New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 14276 for NEMO/branches/2019/dev_r11708_aumont_PISCES_QUOTA/cfgs/SHARED/namelist_pisces_ref – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2021-01-07T23:09:56+01:00 (3 years ago)
Author:
aumont
Message:

numerous updates to PISCES, PISCES-QUOTA and the sediment module

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2019/dev_r11708_aumont_PISCES_QUOTA/cfgs/SHARED/namelist_pisces_ref

    r13234 r14276  
    1414!----------------------------------------------------------------------- 
    1515  ln_p2z    = .false.        !  LOBSTER model used 
    16   ln_p4z    = .true.         !  PISCES model used 
    17   ln_p5z    = .false.        !  PISCES QUOTA model used 
     16  ln_p4z    = .false.        !  PISCES model used 
     17  ln_p5z    = .true.         !  PISCES QUOTA model used 
    1818  ln_ligand = .false.        !  Enable  organic ligands 
    1919  ln_sediment = .false.      !  Enable sediment module 
     
    4444&nampisbio     !   biological parameters 
    4545!----------------------------------------------------------------------- 
    46    nrdttrc    =  1        ! time step frequency for biology 
    47    wsbio      =  2.       ! POC sinking speed 
    48    xkmort     =  2.E-7    ! half saturation constant for mortality 
    49    ferat3     =  10.E-6   ! Fe/C in zooplankton  
    50    wsbio2     =  50.      ! Big particles sinking speed 
    51    wsbio2max  =  50.      ! Big particles maximum sinking speed 
    52    wsbio2scale =  5000.    ! Big particles length scale of sinking 
     46   nrdttrc     =  1       ! time step frequency for biology 
     47   wsbio       =  2.      ! POC sinking speed 
     48   xkmort      =  2.E-7   ! half saturation constant for mortality 
     49   feratz      =  10.E-6  ! Fe/C in zooplankton  
     50   feratm      =  15.E-6  ! Fe/C in mesozooplankton 
     51   wsbio2      =  50.     ! Big particles sinking speed 
     52   wsbio2max   =  50.     ! Big particles maximum sinking speed 
     53   wsbio2scale =  5000.   ! Big particles length scale of sinking 
    5354!                         !  ln_ligand enabled 
    54    ldocp      =  1.E-4    ! Phyto ligand production per unit doc  
    55    ldocz      =  1.E-4    ! Zoo ligand production per unit doc  
    56    lthet      =  1.0      ! Proportional loss of ligands due to Fe uptake  
     55   ldocp       =  1.E-4   ! Phyto ligand production per unit doc  
     56   ldocz       =  1.E-4   ! Zoo ligand production per unit doc  
     57   lthet       =  1.0     ! Proportional loss of ligands due to Fe uptake  
    5758!                         !  ln_p5z enabled 
    58    no3rat3    =  0.151    ! N/C ratio in zooplankton 
    59    po4rat3    =  0.00943 ! P/C ratio in zooplankton 
     59   no3rat3     =  0.151   ! N/C ratio in zooplankton 
     60   po4rat3     =  0.00944 ! P/C ratio in zooplankton 
    6061/ 
    6162!----------------------------------------------------------------------- 
     
    6465   concnno3   =  1.e-6    ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
    6566   concdno3   =  3.E-6    ! Nitrate half saturation for diatoms 
    66    concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    67    concdnh4   =  3.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
    68    concnfer   =  1.E-9    ! Iron half saturation for phyto 
    69    concdfer   =  3.E-9    ! Iron half saturation for diatoms 
    70    concbfe    =  1.E-11   ! Iron half-saturation for DOC remin. 
    71    concbnh4   =  6.E-8    ! NH4 half saturation for DOC remin. 
    72    concbno3   =  2.E-7    ! Nitrate half saturation for DOC remin. 
     67   concnnh4   =  1.E-6    ! NH4 half saturation for phyto 
     68   concdnh4   =  3.E-6    ! NH4 half saturation for diatoms 
     69   concnfer   =  3.E-9    ! Iron half saturation for phyto 
     70   concdfer   =  9.E-9    ! Iron half saturation for diatoms 
     71   concbfe    =  3.E-11   ! Iron half-saturation for DOC remin. 
     72   concbnh4   =  3.E-7    ! NH4 half saturation for DOC remin. 
     73   concbno3   =  3.E-7    ! Nitrate half saturation for DOC remin. 
    7374   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    7475   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
     
    7879   xksi2      =  20E-6    ! half saturation constant for Si/C 
    7980   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    80    qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto 
    81    qdfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
    82    caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     81   qnfelim    =  10.E-6   ! Optimal quota of phyto 
     82   qdfelim    =  10.E-6   ! Optimal quota of diatoms 
     83   caco3r     =  0.28     ! mean rain ratio 
    8384   oxymin     =  1.E-6    ! Half-saturation constant for anoxia 
    8485/ 
     
    8687&namp5zlim     !   parameters for nutrient limitations PISCES QUOTA    - ln_p5z 
    8788!----------------------------------------------------------------------- 
    88    concnno3   =  3e-6     ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
    89    concpno3   =  8e-7     ! Nitrate half saturation of picophytoplankton 
    90    concdno3   =  5E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
    91    concnnh4   =  1E-6     ! NH4 half saturation for phyto 
    92    concpnh4   =  2.3E-7   ! NH4 half saturation for picophytoplankton 
    93    concdnh4   =  1.7E-6   ! NH4 half saturation for diatoms 
    94    concnpo4   =  3E-6     ! PO4 half saturation for phyto 
    95    concppo4   =  8E-7     ! PO4 half saturation for picophytoplankton 
    96    concdpo4   =  5E-6     ! PO4 half saturation for diatoms 
    97    concnfer   =  3E-9     ! Iron half saturation for phyto 
    98    concpfer   =  8E-10    ! Iron half saturation for picophytoplankton 
    99    concdfer   =  5E-9     ! Iron half saturation for diatoms 
    100    concbfe    =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
    101    concbnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    102    concbno3   =  5.E-7    ! Phosphate half saturation for diatoms 
    103    concbpo4   =  1E-7     ! Phosphate half saturation for bacteria 
     89   concnno3   =  2e-6     ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton 
     90   concpno3   =  7e-7     ! Nitrate half saturation of picophytoplankton 
     91   concdno3   =  3E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
     92   concnnh4   =  2E-6     ! NH4 half saturation for phyto 
     93   concpnh4   =  7E-7     ! NH4 half saturation for picophytoplankton 
     94   concdnh4   =  3E-6     ! NH4 half saturation for diatoms 
     95   concnpo4   =  2E-6     ! PO4 half saturation for phyto 
     96   concppo4   =  7E-7     ! PO4 half saturation for picophytoplankton 
     97   concdpo4   =  3E-6     ! PO4 half saturation for diatoms 
     98   concnfer   =  6E-9     ! Iron half saturation for phyto 
     99   concpfer   =  2E-9     ! Iron half saturation for picophytoplankton 
     100   concdfer   =  9E-9     ! Iron half saturation for diatoms 
     101   concbfe    =  3E-11    ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
     102   concbnh4   =  4.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
     103   concbno3   =  4.E-7    ! Phosphate half saturation for diatoms 
     104   concbpo4   =  4.E-7    ! Phosphate half saturation for bacteria 
    104105   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    105106   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
     
    117118&namp5zquota   !   parameters for nutrient limitations PISCES quota    - ln_p5z 
    118119!----------------------------------------------------------------------- 
    119    qfnopt     =  7.E-6    ! Optimal Fe quota of nanophyto 
    120    qfpopt     =  7.E-6    ! Optimal Fe quota of picophyto 
    121    qfdopt     =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
     120   qfnopt     =  10.E-6   ! Optimal Fe quota of nanophyto 
     121   qfpopt     =  10.E-6   ! Optimal Fe quota of picophyto 
     122   qfdopt     =  10.E-6   ! Optimal quota of diatoms 
    122123   qnnmin     =  0.61     ! Minimal N quota for nano 
    123124   qnnmax     =  1.25     ! Maximal N quota for nano 
    124125   qpnmin     =  0.24     ! Minimal P quota for nano 
    125126   qpnmax     =  1.35     ! Maximal P quota for nano 
    126    qnpmin     =  1.04     ! Minimal N quota for pico 
    127    qnpmax     =  1.525    ! Maximal N quota for pico 
     127   qnpmin     =  1.02     ! Minimal N quota for pico 
     128   qnpmax     =  1.39     ! Maximal N quota for pico 
    128129   qppmin     =  0.19     ! Minimal P quota for pico 
    129130   qppmax     =  1.15     ! Maximal P quota for pico 
    130    qndmin     =  0.53     ! Minimal N quota for diatoms 
     131   qndmin     =  0.51     ! Minimal N quota for diatoms 
    131132   qndmax     =  1.25     ! Maximal N quota for diatoms 
    132133   qpdmin     =  0.24     ! Minimal P quota for diatoms 
    133134   qpdmax     =  1.525    ! Maximal P quota for diatoms 
    134    qfnmax     =  80E-6    ! Maximal Fe quota for nano 
    135    qfpmax     =  80E-6    ! Maximal Fe quota for pico 
    136    qfdmax     =  80E-6    ! Maximal Fe quota for diatoms 
     135   qfnmax     =  60E-6    ! Maximal Fe quota for nano 
     136   qfpmax     =  60E-6    ! Maximal Fe quota for pico 
     137   qfdmax     =  60E-6    ! Maximal Fe quota for diatoms 
    137138/ 
    138139!----------------------------------------------------------------------- 
     
    149150&namp4zprod    !   parameters for phytoplankton growth for PISCES std  - ln_p4z 
    150151!----------------------------------------------------------------------- 
    151    pislopen   =  2.       ! P-I slope 
    152    pisloped   =  2.       ! P-I slope  for diatoms 
     152   pislopen   =  2.5      ! P-I slope 
     153   pisloped   =  2.5      ! P-I slope  for diatoms 
    153154   xadap      =  0.       ! Adaptation factor to low light 
    154155   excretn    =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
     
    157158   chlcnm     =  0.033    ! Maximum Chl/C in nanophytoplankton 
    158159   chlcdm     =  0.05     ! Maximum Chl/C in diatoms 
    159    chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
    160    fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
    161    fecdm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in diatoms 
    162    grosip     =  0.11     ! mean Si/C ratio 
     160   chlcmin    =  0.003    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
     161   fecnm      =  60E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
     162   fecdm      =  60E-6    ! Maximum Fe/C in diatoms 
     163   grosip     =  0.13     ! mean Si/C ratio 
    163164/ 
    164165!----------------------------------------------------------------------- 
    165166&namp5zprod    !   parameters for phytoplankton growth for PISCES quota- ln_p5z 
    166167!----------------------------------------------------------------------- 
    167    pislopen   =  4.       ! P-I slope of nanophytoplankton 
    168    pislopep   =  4.       ! P-I slope for picophytoplankton 
    169    pisloped   =  4.       ! P-I slope  for diatoms 
     168   pislopen   =  5        ! P-I slope of nanophytoplankton 
     169   pislopep   =  5        ! P-I slope for picophytoplankton 
     170   pisloped   =  5        ! P-I slope  for diatoms 
    170171   excretn    =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
    171172   excretp    =  0.05     ! excretion ratio of picophytoplankton 
     
    176177   thetanpm   =  0.3      ! Maximum Chl/N in picophytoplankton 
    177178   thetandm   =  0.4      ! Maximum Chl/N in diatoms 
    178    chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
    179    grosip     =  0.11     ! mean Si/C ratio 
     179   chlcmin    =  0.003    ! Minimum Chl/c in phytoplankton 
     180   grosip     =  0.12     ! mean Si/C ratio 
    180181/ 
    181182!----------------------------------------------------------------------- 
     
    183184!----------------------------------------------------------------------- 
    184185   wchln      =  0.01     ! quadratic mortality of phytoplankton 
    185    wchld      =  0.01     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
    186    wchldm     =  0.03     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
     186   wchld      =  0.03     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
    187187   mpratn     =  0.01     ! phytoplankton mortality rate 
    188188   mpratd     =  0.01     ! Diatoms mortality rate 
     
    193193   wchln      =  0.01     ! quadratic mortality of nanophytoplankton 
    194194   wchlp      =  0.01     ! quadratic mortality of picophytoplankton 
    195    wchld      =  0.01     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
    196    wchldm     =  0.03     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
     195   wchld      =  0.03     ! maximum quadratic mortality of diatoms 
    197196   mpratn     =  0.01     ! nanophytoplankton mortality rate 
    198197   mpratp     =  0.01     ! picophytoplankton mortality rate 
     
    205204   grazrat2    =  0.5      ! maximal mesozoo grazing rate 
    206205   resrat2     =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    207    mzrat2      =  0.02     ! mesozooplankton mortality rate 
     206   mzrat2      =  0.01     ! mesozooplankton mortality rate 
    208207   xpref2d     =  1.       ! mesozoo preference for diatoms 
    209208   xpref2n     =  0.3      ! mesozoo preference for nanophyto. 
    210209   xpref2z     =  1.       ! mesozoo preference for microzoo. 
    211210   xpref2c     =  0.3      ! mesozoo preference for poc 
    212    xthresh2zoo = 1E-8      ! zoo feeding threshold for mesozooplankton  
    213    xthresh2dia = 1E-8      ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton  
    214    xthresh2phy = 1E-8      ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton  
    215    xthresh2poc = 1E-8      ! poc feeding threshold for mesozooplankton  
     211   xthresh2zoo =  1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton  
     212   xthresh2dia =  1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton  
     213   xthresh2phy =  1E-8     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton  
     214   xthresh2poc =  1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton  
    216215   xthresh2    =  3E-7     ! Food threshold for grazing 
    217216   xkgraz2     =  20.E-6   ! half saturation constant for meso grazing 
    218    epsher2     =  0.35     ! Efficicency of Mesozoo growth 
    219    epsher2min  =  0.35     ! Minimum efficiency of mesozoo growth 
     217   epsher2     =  0.4      ! Efficicency of Mesozoo growth 
     218   epsher2min  =  0.4      ! Minimum efficiency of mesozoo growth 
    220219   sigma2      =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM 
    221220   unass2      =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo 
    222    grazflux    =  3.e3     ! flux-feeding rate 
    223    ln_dvm_meso = .false.   ! Activates DVM for mesozooplankton 
    224    xfracmig    = 0.3       ! Fraction of mesozooplankton performing DVM 
     221   grazflux    =  2.e3     ! flux-feeding rate 
     222   xsigma2     =  0.5      ! Predation window size 
     223   xsigma2del  =  1.0      ! Predation window size scaling 
     224   ln_dvm_meso =  .false.  ! Activates DVM for mesozooplankton 
     225   xfracmig    =  0.3      ! Fraction of mesozooplankton performing DVM 
    225226/ 
    226227!----------------------------------------------------------------------- 
    227228&namp5zmes     !   parameters for mesozooplankton 
    228229!----------------------------------------------------------------------- 
    229    part2      =  0.75     ! part of calcite not dissolved in mesozoo guts 
    230    grazrat2   =  0.75     ! maximal mesozoo grazing rate 
    231    bmetexc2   =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon  
    232    resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
    233    mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate 
    234    xpref2d    =  1.       ! meso preference for diatoms 
    235    xpref2n    =  0.3      ! meso preference for nano 
    236    xpref2z    =  1.       ! meso preference for zoo 
    237    xpref2m    =  0.1      ! meso preference for zoo 
    238    xpref2c    =  0.3      ! meso preference for poc 
    239    xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton 
    240    xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton 
    241    xthresh2phy = 1E-8     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton 
    242    xthresh2mes = 1E-8     ! meso feeding threshold for mesozooplankton 
    243    xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton 
    244    xthresh2    =  3E-7    ! Food threshold for grazing 
    245    xkgraz2     =  20.E-6  ! half sturation constant for meso grazing 
    246    epsher2     =  0.5     ! Efficicency of Mesozoo growth 
    247    epsher2min  =  0.5     ! Minimum efficiency of mesozoo growth 
    248    ssigma2     =  0.5     ! Fraction excreted as semi-labile DOM 
    249    srespir2    =  0.2     ! Active respiration 
    250    unass2c     =  0.3     ! non assimilated fraction of C by mesozoo 
    251    unass2n     =  0.3     ! non assimilated fraction of N by mesozoo 
    252    unass2p     =  0.3     ! non assimilated fraction of P by mesozoo 
    253    grazflux   =  3.e3     ! flux-feeding rate 
     230   part2       =  0.75     ! part of calcite not dissolved in mesozoo guts 
     231   grazrat2    =  0.5      ! maximal mesozoo grazing rate 
     232   bmetexc2    =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon  
     233   resrat2     =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton 
     234   mzrat2      =  0.01     ! mesozooplankton mortality rate 
     235   xpref2d     =  1.       ! meso preference for diatoms 
     236   xpref2n     =  0.3      ! meso preference for nano 
     237   xpref2z     =  1.       ! meso preference for zoo 
     238   xpref2m     =  0.       ! meso preference for zoo 
     239   xpref2c     =  0.3      ! meso preference for poc 
     240   xthresh2zoo =  1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton 
     241   xthresh2dia =  1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton 
     242   xthresh2phy =  1E-8     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton 
     243   xthresh2mes =  1E-8     ! meso feeding threshold for mesozooplankton 
     244   xthresh2poc =  1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton 
     245   xthresh2    =  3E-7     ! Food threshold for grazing 
     246   xkgraz2     =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
     247   epsher2     =  0.5      ! Efficicency of Mesozoo growth 
     248   epsher2min  =  0.5      ! Minimum efficiency of mesozoo growth 
     249   ssigma2     =  0.5      ! Fraction excreted as semi-labile DOM 
     250   srespir2    =  0.2      ! Active respiration 
     251   unass2c     =  0.3      ! non assimilated fraction of C by mesozoo 
     252   unass2n     =  0.3      ! non assimilated fraction of N by mesozoo 
     253   unass2p     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo 
     254   xsigma2     =  0.5      ! Predation window size 
     255   xsigma2del  =  1.0      ! Predation window size scaling 
     256   grazflux    =  2.e3     ! flux-feeding rate 
     257   ln_dvm_meso =  .false.  ! Activates DVM for mesozooplankton 
     258   xfracmig    =  0.25     ! Fraction of mesozooplankton performing DVM 
    254259/ 
    255260!----------------------------------------------------------------------- 
    256261&namp4zzoo     !   parameters for microzooplankton for PISCES std      - ln_p4z 
    257262!----------------------------------------------------------------------- 
    258    part       =  0.5      ! part of calcite not dissolved in microzoo guts 
     263   part       =  0.75     ! part of calcite not dissolved in microzoo guts 
    259264   grazrat    =  2.0      ! maximal zoo grazing rate 
    260    resrat     =  0.03     ! Linear mortality rate of zooplankton 
     265   resrat     =  0.02     ! Linear mortality rate of zooplankton 
    261266   mzrat      =  0.005    ! zooplankton mortality rate 
    262267   xprefc     =  0.1      ! Microzoo preference for POM 
     
    268273   xthresh    =  3.E-7    ! Food threshold for feeding 
    269274   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing 
    270    epsher     =  0.35     ! Efficiency of microzoo growth 
    271    epshermin  =  0.35     ! Minimum efficiency of microzoo growth 
     275   epsher     =  0.4     ! Efficiency of microzoo growth 
     276   epshermin  =  0.4     ! Minimum efficiency of microzoo growth 
    272277   sigma1     =  0.6      ! Fraction of microzoo excretion as DOM 
    273278   unass      =  0.3      ! non assimilated fraction of phyto by zoo 
     279   xsigma     =  0.5      ! Predation window size 
     280   xsigmadel  =  1.0      ! Predation window size scaling 
    274281/ 
    275282!----------------------------------------------------------------------- 
    276283&namp5zzoo     !   parameters for microzooplankton 
    277284!----------------------------------------------------------------------- 
    278    part       =  0.5      ! part of calcite not dissolved in microzoo gutsa 
    279    grazrat    =  3.0      ! maximal zoo grazing rate 
     285   part       =  0.75     ! part of calcite not dissolved in microzoo gutsa 
     286   grazrat    =  2.0      ! maximal zoo grazing rate 
    280287   bmetexc    =  .true.   ! Metabolic use of excess carbon 
    281    resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton 
    282    mzrat      =  0.004    ! zooplankton mortality rate 
     288   resrat     =  0.02     ! exsudation rate of zooplankton 
     289   mzrat      =  0.005    ! zooplankton mortality rate 
    283290   xprefc     =  0.1      ! Microzoo preference for POM 
    284291   xprefn     =  1.0      ! Microzoo preference for Nanophyto 
    285292   xprefp     =  1.0      ! Microzoo preference for picophyto 
    286293   xprefd     =  0.8      ! Microzoo preference for Diatoms 
    287    xprefz     =  0.1      ! Microzoo preference for microzooplankton 
     294   xprefz     =  0.       ! Microzoo preference for microzooplankton 
    288295   xthreshdia =  1.E-8    ! Diatoms feeding threshold for microzooplankton 
    289296   xthreshphy =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton 
     
    300307   unassn     =  0.3      ! non assimilated fraction of N by zoo 
    301308   unassp     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by zoo 
     309   xsigma     =  0.5      ! Predation window size 
     310   xsigmadel  =  1.0      ! Predation window size scaling 
    302311/ 
    303312!----------------------------------------------------------------------- 
     
    305314!----------------------------------------------------------------------- 
    306315   ln_ligvar =  .false.   ! variable ligand concentration 
    307    xlam1     =  0.005      ! scavenging rate of Iron by biogenic particles 
     316   xlam1     =  0.05      ! scavenging rate of Iron by biogenic particles 
    308317   xlamdust  =  150.0     ! Scavenging rate of Iron by dust 
    309    ligand    =  7E-10     ! Ligands concentration  
     318   ligand    =  1E-9     ! Ligands concentration  
    310319   kfep      =  0.01      ! Nanoparticle formation rate constant 
     320   scaveff   =  1.0       ! Fraction of scavenged Fe that goes to POFe 
    311321/ 
    312322!-----------------------------------------------------------------------   
    313323&nampisrem     !   parameters for remineralization 
    314324!----------------------------------------------------------------------- 
    315    xremik    =  0.3       ! remineralization rate of DOC 
    316325   nitrif    =  0.05      ! NH4 nitrification rate 
    317326   xsirem    =  0.003     ! remineralization rate of Si 
    318327   xsiremlab =  0.03      ! fast remineralization rate of Si 
    319328   xsilab    =  0.5       ! Fraction of labile biogenic silica 
    320    feratb    =  10.E-6    ! Fe/C quota in bacteria 
     329   feratb    =  30.E-6    ! Fe/C quota in bacteria 
    321330   xkferb    =  3E-10     ! Half-saturation constant for bacteria Fe/C 
    322331!                         ! ln_p5z 
    323    xremikc   =  0.25      ! remineralization rate of DOC 
    324    xremikn   =  0.3       ! remineralization rate of DON 
    325    xremikp   =  0.4       ! remineralization rate of DOP 
    326 !   feratb    =  20E-6     ! Bacterial Fe/C ratio 
    327 !   xkferb    =  3E-10     ! Half-saturation constant for bact. Fe/C 
     332   xremikc   =  0.4       ! remineralization rate of DOC 
     333   xremikn   =  0.4       ! remineralization rate of DON 
     334   xremikp   =  0.5       ! remineralization rate of DOP 
    328335/ 
    329336!----------------------------------------------------------------------- 
    330337&nampispoc     !   parameters for organic particles 
    331338!----------------------------------------------------------------------- 
    332    xremip    =  0.03      ! remineralisation rate of POC 
     339   xremip    =  0.035     ! remineralisation rate of POC 
    333340   jcpoc     =  15        ! Number of lability classes 
    334341   rshape    =  1.0       ! Shape of the gamma function 
     
    341348&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry 
    342349!----------------------------------------------------------------------- 
    343    kdca       =  6.       ! calcite dissolution rate constant (1/time) 
    344    nca        =  1.       ! order of dissolution reaction (dimensionless) 
     350   kdca       =  3.       ! calcite dissolution rate constant (1/time) 
     351   nca        =  2.       ! order of dissolution reaction (dimensionless) 
    345352/ 
    346353!----------------------------------------------------------------------- 
     
    377384   icefeinput  =  15.e-9   ! Iron concentration in sea ice 
    378385   nitrfix     =  1.e-7    ! Nitrogen fixation rate 
    379    diazolight  =  50.      ! Diazotrophs sensitivity to light (W/m2) 
     386   diazolight  =  30.      ! Diazotrophs sensitivity to light (W/m2) 
    380387   concfediaz  =  1.e-10   ! Diazotrophs half-saturation Cste for Iron 
    381388   hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply  
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.