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2016WP/2016SharedActions (diff) – NEMO

Changes between Version 39 and Version 40 of 2016WP/2016SharedActions


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2015-11-11T17:06:02+01:00 (9 years ago)
Author:
cetlod
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    v39 v40  
    5454=== '''AGRIF''' === 
    5555==== ''' '''AGRIF-1 / Met Office - Increased vertical resolution with AGRIF ==== 
    56   '''                             Motivation:'''       Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                         '''                             Status: '''       Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                         '''                            Main Tasks: '''                             [[BR]]                         '''                             Science Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             System Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Deadline:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Priority:'''        Medium                     [[BR]]'''Depends on:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Principal Investigator : '''Tim Graham 
     56  '''                                  Motivation:'''            Vertical grid refinement in NEMO would be a useful tool in simulating some aspects of the ocean (e.g. overflows)        [[BR]]                              '''                                  Status: '''            Started in 2015 but much more work to do                      [[BR]]                              '''                                 Main Tasks: '''                                  [[BR]]                              '''                                  Science Reviewer:'''                                                                          [[BR]]                                                                          '''                                  System Reviewer:'''                                                                          [[BR]]                                                                          '''                                  Deadline:'''                                  [[BR]]                                                                          '''                                  Priority:'''             Medium                     [[BR]]     '''     Depends on:'''                                                                          [[BR]]                                                                          '''                                  Principal Investigator : '''     Tim Graham 
    5757 
     58====  ==== 
     59====  ==== 
     60====  ==== 
    5861==== AGRIF-2 / CNRS - Assessment of LIM3 with AGRIF ==== 
    59 ==== '''    Motivation:''' Enable the use of grid refinement with LIM3, since LIM3 is consolidated in NEMO and should remain the only sea-ice model in the system[[BR]]'''    Status: '''Not yet started in 2015 [[BR]]'''    Main Tasks: '''[[BR]]'''    Science Reviewer:''' [[BR]]'''    System Reviewer:''' [[BR]]'''    Deadline:''' [[BR]]'''    Priority:''' Medium [[BR]]'''    Depends on:''' [[BR]]'''    Principal Investigator : ''' Clement Rousset  ==== 
    60 ====  ==== 
     62  '''                                  Motivation:'''  Assess the grid refinement with LIM3, since LIM3 is consolidated in NEMO and should remain the only sea-ice model in the system[[BR]]                              '''                                  Status: ''' Not yet tarted in 2015 [[BR]]                              '''                                 Main Tasks: '''                                  [[BR]]                              '''                                  Science Reviewer:'''                                                                          [[BR]]                                                                          '''                                  System Reviewer:'''                                                                          [[BR]]                                                                          '''                                  Deadline:'''                                  [[BR]]                                                                          '''                                  Priority:'''           High                     [[BR]]          '''          Depends on:'''                                                                          [[BR]]                                                                          '''                                  Principal Investigator :'''  Clément Rousset 
     63 
     64===  === 
    6165==== AGRIF-3 / Mercator Océan - Agrif + vvl (two way nesting) ==== 
    62   '''                             Motivation:'''      Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]                         '''                             Status: '''       Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized.                      [[BR]]                         '''                            Main Tasks: '''                             [[BR]]                         '''                             Science Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             System Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Deadline:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Priority:'''      High                     [[BR]]     '''     Depends on:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Principal Investigator :'''      Jérôme Chanut 
     66  '''  Motivation:'''   Enable the use of agrif with temporally varying vertical grid (e.g. with zstar or ztilde coordinates) [[BR]]  '''  Status: '''  Started in 2015. One way nesting is ok, two way nesting needs to be finalized. [[BR]]  '''  Main Tasks: '''  [[BR]]  '''  Science Reviewer:'''   [[BR]]  '''  System Reviewer:'''   [[BR]]  '''  Deadline:'''   [[BR]]  '''  Priority:'''   High [[BR]]  '''  Depends on:'''   [[BR]]  '''  Principal Investigator :'''   Jérôme Chanut 
    6367 
     68===  === 
    6469=== '''HPC''' === 
    6570==== ''' '''HPC-1 / CMCC/Met Office - Suppress global communications ==== 
     
    6974'''                Motivation:''' Grouping communications (lbc_lnk) together is more efficient than several separate lbc_lnk calls. [[BR]] 
    7075 
    71   '''                        Status: '''       lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                    '''                       Main Tasks: '''       Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                    '''                        Science Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        System Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        Deadline:'''                        [[BR]]                                                                '''                        Priority:'''                        [[BR]]                                                                '''                        Depends on:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        Principal Investigator : '''       Miguel Castrillo 
     76  '''                             Status: '''            lbc_lnk_multi in 3.6                 [[BR]]                         '''                            Main Tasks: '''            Extend functionality of lbc_lnk_multi to 3D (or 4D variables). Find calls to lbc_lnk that can be replaced with lbc_lnk_multi.                 [[BR]]                         '''                             Science Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             System Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Deadline:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Priority:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Depends on:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Principal Investigator : '''            Miguel Castrillo 
    7277 
    7378==== ''' '''HPC-3 / Barcelona - Suppress useless communications ==== 
    7479'''                Motivation:''' Suppress unnecessary calls to lbc_lnk. 
    7580 
    76   [[BR]]                    '''                        Status: '''                    [[BR]]                    '''                       Main Tasks: '''       Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                    '''                        Science Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        System Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        Deadline:'''                        [[BR]]                                                                '''                        Priority:'''                        [[BR]]                                                                '''                        Depends on:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        Principal Investigator : '''       Tim Graham 
     81  [[BR]]                         '''                             Status: '''                         [[BR]]                         '''                            Main Tasks: '''            Use a script to search for and test impact of removing lbc_lnk calls from the model code. Determine whether communications used for diagnostic purposes can be suppressed.               [[BR]]                         '''                             Science Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             System Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Deadline:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Priority:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Depends on:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Principal Investigator : '''            Tim Graham 
    7782 
    7883==== ''' '''HPC-4 / CMCC - Scalability with MPI-OPENMP ==== 
    7984'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    8085 
    81   [[BR]]                    '''                        Status: '''         continuation of 2015 dev CMCC-1            [[BR]]                    '''                       Main Tasks: '''       1. the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Results in terms of scalability were not so good. Thus, the porting and the analysis of the hybrid version (using “mini-apps”) on many core architectures (e.g. Xeon Phi) is needed, before extending the hybrid OpenMP/MPI approach to the entire code, in order to justify the effort of the development. This analysis is carrying out in 2015. The extension of the hybrid implementation on the entire code will depend on the results of this analysis. 2. analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications              [[BR]]                    '''                        Science Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        System Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        Deadline:'''                        [[BR]]                                                                '''                        Priority:'''         HIGH               [[BR]]                                                                '''                        Depends on:'''        results of the same action in 2015             [[BR]]                                                                '''                        Principal Investigator : '''       Silvia Mocavero 
     86  [[BR]]                         '''                             Status: '''              continuation of 2015 dev CMCC-1            [[BR]]                         '''                            Main Tasks: '''            1. the activity started at the end of 2013 with the analysis of three OpenMP approaches (implemented using “mini-apps”) on several multicore architectures; the second step was the implementation of the hybrid version of the GYRE configuration using the best OpenMP approach. Results in terms of scalability were not so good. Thus, the porting and the analysis of the hybrid version (using “mini-apps”) on many core architectures (e.g. Xeon Phi) is needed, before extending the hybrid OpenMP/MPI approach to the entire code, in order to justify the effort of the development. This analysis is carrying out in 2015. The extension of the hybrid implementation on the entire code will depend on the results of this analysis. 2. analysis of scalability improvement using MPI3 new communications (e.g. collective neighbours communications), instead of point to point communications              [[BR]]                         '''                             Science Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             System Reviewer:'''                                                                     [[BR]]                                                                     '''                             Deadline:'''                             [[BR]]                                                                     '''                             Priority:'''              HIGH               [[BR]]                                                                     '''                             Depends on:'''             results of the same action in 2015             [[BR]]                                                                     '''                             Principal Investigator : '''            Silvia Mocavero 
    8287 
    8388==== ''' '''HPC-5 / NERC - Implement larger haloes ==== 
    8489'''                Motivation:''' Improving NEMO scalability. 
    8590 
    86   [[BR]]                    '''                        Status: '''         New implementation - old idea           [[BR]]                    '''                       Main Tasks: '''           Investigate the benefits of using larger halo to reduce the communication frequency and hence improve performance and scalability. This is likely to be most influential in the barotropic time-splitting where it should be possible to emulate earlier solutions for the iterative solvers. Extension to the rest of the code will be considered subject to an impact assessment.         [[BR]]                    '''                        Science Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        System Reviewer:'''                                                                [[BR]]                                                                '''                        Deadline:'''                        [[BR]]                                                                '''                        Priority:'''         HIGH               [[BR]]                                                                '''                        Depends on:'''                   [[BR]]                                                                '''                        Principal Investigator : '''       Andrew Coward 
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    9196'''Motivation:''' Introduce a vertical physics manager that allows to save MPP communications 
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