New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 14822 for NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining/tests/DOME/EXPREF – NEMO

Ignore:
Timestamp:
2021-05-10T13:32:16+02:00 (3 years ago)
Author:
smueller
Message:

Synchronizing with /NEMO/trunk@14820 (ticket #2353)

Location:
NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining
Files:
5 edited
2 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining

    • Property svn:externals

      •  

        old new  
        1 ^/utils/build/arch@14122      arch 
        2 ^/utils/build/makenemo@14122  makenemo 
        3 ^/utils/build/mk@14122        mk 
        4 ^/utils/tools@14122           tools 
        5 ^/vendors/AGRIF/dev@14122     ext/AGRIF 
        6 ^/vendors/FCM@14122           ext/FCM 
        7 ^/vendors/IOIPSL@14122        ext/IOIPSL 
        8 ^/vendors/PPR@14122           ext/PPR 
         1^/utils/build/arch@HEAD       arch 
         2^/utils/build/makenemo@HEAD   makenemo 
         3^/utils/build/mk@HEAD         mk 
         4^/utils/tools@HEAD            tools 
         5^/vendors/AGRIF/dev@HEAD      ext/AGRIF 
         6^/vendors/FCM@HEAD            ext/FCM 
         7^/vendors/IOIPSL@HEAD         ext/IOIPSL 
         8^/vendors/PPR@HEAD            ext/PPR 
        99 
        1010# SETTE 
        11 ^/utils/CI/sette_wave@13990         sette 
         11^/utils/CI/sette@14244        sette 

  • NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining/tests/DOME/EXPREF/1_namelist_cfg

    r13952 r14822  
    1818/ 
    1919!----------------------------------------------------------------------- 
     20&namusr_def    !   User defined :   OVERFLOW configuration 
     21!----------------------------------------------------------------------- 
     22   !                       !  type of vertical coordinate 
     23   ln_zco      = .false.      ! z-coordinate 
     24   ln_zps      = .true.       ! z-partial-step coordinate 
     25   ln_sco      = .false.      ! s-coordinate 
     26   rn_dx       =   5000.   !  horizontal resolution   [meters] 
     27   rn_dz       =     60.   !  vertical   resolution   [meters] 
     28   rn_f0       =  1.e-4    !  coriolis [s-1] 
     29/ 
     30!----------------------------------------------------------------------- 
    2031&namrun        !   parameters of the run 
    2132!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    3647!----------------------------------------------------------------------- 
    3748   ln_linssh  = .true. 
    38    rn_Dt      =   240.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
     49   rn_Dt      =   150.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    3950   rn_atfp    =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    4051   ln_meshmask = .false.  !  =T create a mesh file 
    … …  
    164175&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm 
    165176!----------------------------------------------------------------------- 
    166    ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
    167    ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
    168    ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    169177   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
    170       nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     178   ! 
     179   nn_e3f_typ = 1          !  type of e3f (EEN, ENE, ENS, MIX only)  =0  e3f = mi(mj(e3t))/4 
     180   ! 
    171181/ 
    172182!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    174184!----------------------------------------------------------------------- 
    175185   ln_hpg_zps  = .false.  !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
    176    ln_hpg_sco  = .true.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     186   ln_hpg_djc  = .true.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
    177187/ 
    178188!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    200210&namzdf        !   vertical physics                                     (default: NO selection) 
    201211!----------------------------------------------------------------------- 
    202    ln_zad_Aimp = .true.       !  Courant number dependent scheme (Shchepetkin 2015) 
     212   ln_zad_Aimp = .false.       !  Courant number dependent scheme (Shchepetkin 2015) 
    203213   !                       ! type of vertical closure (required) 
    204    ln_zdfcst   = .true.       !  constant mixing 
     214   ln_zdfcst   = .false.      !  constant mixing 
    205215   ln_zdfric   = .false.      !  local Richardson dependent formulation (T =>   fill namzdf_ric) 
    206216   ln_zdftke   = .false.      !  Turbulent Kinetic Energy closure       (T =>   fill namzdf_tke) 
    207    ln_zdfgls   = .false.      !  Generic Length Scale closure           (T =>   fill namzdf_gls) 
     217   ln_zdfgls   = .true.       !  Generic Length Scale closure           (T =>   fill namzdf_gls) 
    208218   ln_zdfosm   = .false.      !  OSMOSIS BL closure                     (T =>   fill namzdf_osm) 
    209219   !    
    … …  
    225235   !    
    226236   !                       ! coefficients 
    227    rn_avm0     =   5.e-2     !  vertical eddy viscosity   [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
    228    rn_avt0     =   0.0       !  vertical eddy diffusivity [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
     237   rn_avm0     =   1.e-5     !  vertical eddy viscosity   [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
     238   rn_avt0     =   1.e-6     !  vertical eddy diffusivity [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
    229239   nn_avb      =    0        !  profile for background avt & avm (=1) or not (=0) 
    230240   nn_havtb    =    0        !  horizontal shape for avtb (=1) or not (=0) 

  • NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining/tests/DOME/EXPREF/AGRIF_FixedGrids.in

    r13952 r14822  
    111 
    2 118 178 40 80 2 2 2  
     2278 358 88 162 2 2 2   
    330 

  • NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining/tests/DOME/EXPREF/file_def_nemo-oce.xml

    r13930 r14822  
    1717          <field field_ref="sbt"        name="sbt"           operation="instant" /> 
    1818          <field field_ref="sbs"        name="btra"          operation="instant" /> 
    19           <field field_ref="sbh"        name="thick"         operation="instant" /> 
    2019          <field field_ref="agrif_spt"  name="Agrif_sponge" /> 
    2120   </file> 

  • NEMO/branches/2021/dev_r14122_HPC-08_Mueller_OSMOSIS_streamlining/tests/DOME/EXPREF/namelist_cfg

    r13952 r14822  
    33!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    44! 
    5 ! 
     5!----------------------------------------------------------------------- 
     6&namusr_def    !   User defined :   OVERFLOW configuration 
     7!----------------------------------------------------------------------- 
     8   !                       !  type of vertical coordinate 
     9   ln_zco      = .false.      ! z-coordinate 
     10   ln_zps      = .true.       ! z-partial-step coordinate 
     11   ln_sco      = .false.      ! s-coordinate 
     12   rn_dx       =   5000.   !  horizontal resolution   [meters] 
     13   rn_dz       =     60.   !  vertical   resolution   [meters] 
     14   rn_f0       =  1.e-4    !  coriolis [s-1] 
     15/ 
    616!----------------------------------------------------------------------- 
    717&namrun        !   parameters of the run 
    … …  
    1020   cn_exp      =    "DOME" !  experience name 
    1121   nn_it000    =       1   !  first time step 
    12    nn_itend    =   16200   ! here 16h of simulation  (=5760 time-step) abort after 5802 for zps: pb of physics conditions 
     22   nn_itend    =   11520   ! here 16h of simulation  (=5760 time-step) abort after 5802 for zps: pb of physics conditions 
    1323   nn_stock    =       0   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1) 
    1424/ 
    … …  
    2535!----------------------------------------------------------------------- 
    2636   ln_linssh  = .true. 
    27    rn_Dt      =   480.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
     37   rn_Dt      =   300.    !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    2838   rn_atfp    =    0.1    !  asselin time filter parameter 
    2939   ln_meshmask = .false.  !  =T create a mesh file 
    … …  
    92102!----------------------------------------------------------------------- 
    93103&namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    94 !----------------------------------------------------------------------- 
     104!---------------------------------------------------------------------- 
    95105   ln_traadv_fct = .true. !  FCT scheme 
    96106      nn_fct_h   =  2            !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order 
    … …  
    153163&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm 
    154164!----------------------------------------------------------------------- 
    155    ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
    156    ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme 
    157    ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme 
    158165   ln_dynvor_een = .true.  !  energy & enstrophy scheme 
    159       nn_een_e3f = 1             !  e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1) 
     166   ! 
     167   nn_e3f_typ = 1          !  type of e3f (EEN, ENE, ENS, MIX only)  =0  e3f = mi(mj(e3t))/4 
     168   !                       !                                         =1  e3f = mi(mj(e3t))/mi(mj( tmask)) 
    160169/ 
    161170!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    163172!----------------------------------------------------------------------- 
    164173   ln_hpg_zps  = .false.  !  z-coordinate - partial steps (interpolation) 
    165    ln_hpg_sco  = .true.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
     174   ln_hpg_djc  = .true.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
    166175/ 
    167176!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    189198&namzdf        !   vertical physics                                     (default: NO selection) 
    190199!----------------------------------------------------------------------- 
    191    ln_zad_Aimp = .true.       !  Courant number dependent scheme (Shchepetkin 2015) 
     200   ln_zad_Aimp = .false.       !  Courant number dependent scheme (Shchepetkin 2015) 
    192201   !                       ! type of vertical closure (required) 
    193    ln_zdfcst   = .true.       !  constant mixing 
     202   ln_zdfcst   = .false.      !  constant mixing 
    194203   ln_zdfric   = .false.      !  local Richardson dependent formulation (T =>   fill namzdf_ric) 
    195204   ln_zdftke   = .false.      !  Turbulent Kinetic Energy closure       (T =>   fill namzdf_tke) 
    196    ln_zdfgls   = .false.      !  Generic Length Scale closure           (T =>   fill namzdf_gls) 
     205   ln_zdfgls   = .true.       !  Generic Length Scale closure           (T =>   fill namzdf_gls) 
    197206   ln_zdfosm   = .false.      !  OSMOSIS BL closure                     (T =>   fill namzdf_osm) 
    198207   !    
    … …  
    214223   !    
    215224   !                       ! coefficients 
    216    rn_avm0     =   5.e-2     !  vertical eddy viscosity   [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
    217    rn_avt0     =   0.0       !  vertical eddy diffusivity [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
     225   rn_avm0     =   1.e-5     !  vertical eddy viscosity   [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
     226   rn_avt0     =   1.e-6     !  vertical eddy diffusivity [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
    218227   nn_avb      =    0        !  profile for background avt & avm (=1) or not (=0) 
    219228   nn_havtb    =    0        !  horizontal shape for avtb (=1) or not (=0) 
    … …  
    261270   ctypebdy='W' 
    262271   nbdyind = 2  
    263    nbdybeg = 1 
    264    nbdyend = 87  
    265 / 
     272   nbdybeg = 1  
     273   nbdyend = 164  
     274/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.