New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iodef.xml in trunk/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00 – NEMO

source: trunk/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/iodef.xml @ 1650

Last change on this file since 1650 was 1650, checked in by cetlod, 15 years ago

update iodef.xml files relative to changeset:1649

File size: 20.5 KB
Line 
1<?xml version="1.0"?>
2
3<simulation> 
4 
5  <context id="nemo">
6   
7    <!-- groups of variables definition -->
8   
9    <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" freq_op="5760" enabled=".TRUE.">
10
11      <!-- T grid -->
12     
13      <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
14   <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   />
15         <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   />
16   <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     />
17   <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      />
18   <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        />
19   <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        />
20   <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        />
21   <field id="bowl"         description="Bowl Index"                                unit="W-point"                  />
22   <!-- next variables available with key_diahth -->
23   <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        />
24   <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        />
25   <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        />
26   <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        />
27   <field id="mld|dt|"      description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        />
28   <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        />
29   <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        />
30   <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        />
31   <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     />
32   <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        />
33        <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        />
34   <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        />
35   <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        />
36     </group>
37
38      <!-- SBC -->
39     
40      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" freq_op="28800">
41
42   <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  />
43   <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  />
44   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  />
45   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  />
46
47   <field id="qns+qsr"      description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     />
48   <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     />
49   <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     />
50   <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     />
51   <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  />
52   <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m "                                   unit="m/s"      />
53   
54   <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core -->
55   <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     />
56   <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
57   <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
58   <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     />
59
60   <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        />
61
62   <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     />
63   <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
64   <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
65   <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     />
66   
67   <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
68   <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
69   
70   <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        />
71   <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        />
72   <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      />
73   
74   <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        />
75   <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />     
76   <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
77   <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
78   
79   <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
80   <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
81   
82   <!-- icealb_cea: available key_coupled -->
83   <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        />
84      </group>
85
86      <!-- U grid -->
87     
88      <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U">
89   <field id="utau"        description="Wind Stress along i-axis"                  unit="N/m2" axis_ref="none" />
90   <field id="uoce"        description="ocean current along i-axis"                unit="m/s"                  />
91   <field id="uoce_eff"    description="Effective ocean current along i-axis"      unit="m/s"                  />
92   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
93   <field id="uoce_eiv"    description="EIV ocean current along i-axis"            unit="m/s"                  />
94   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
95   <field id="uoce_bbl"    description="BBL ocean current along i-axis"            unit="m/s"                  />
96      </group>
97     
98      <!-- V grid -->
99     
100      <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V">
101   <field id="vtau"        description="Wind Stress along j-axis"                  unit="N/m2" axis_ref="none" />
102   <field id="voce"        description="ocean current along j-axis"                unit="m/s"                  />
103   <field id="voce_eff"    description="Effective ocean current along j-axis"      unit="m/s"                  />
104   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
105   <field id="voce_eiv"    description="EIV ocean current along j-axis"            unit="m/s"                  />
106   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
107   <field id="voce_bbl"    description="BBL ocean current along j-axis"            unit="m/s"                  />
108      </group>
109     
110      <!-- W grid -->
111     
112      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W">
113   <field id="woce"        description="ocean vertical velocity"                   unit="m/s"                  />
114   <field id="woce_eff"    description="effective ocean vertical velocity"         unit="m/s"                  />
115   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
116   <field id="woce_eiv"    description="EIV ocean vertical velocity"               unit="m/s"                  />
117   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
118   <field id="woce_bbl"    description="BBL ocean vertical velocity"               unit="m/s"                  />
119   
120   <field id="avt"         description="vertical eddy diffusivity"                 unit="m2/s"                 />
121   <field id="avm"         description="vertical eddy viscosity"                   unit="m2/s"                 />
122   <!-- avs: available with key_zdfddm -->
123   <field id="avs"         description="salt vertical eddy diffusivity"            unit="m2/s"                 />
124   <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd -->
125   <field id="avt_evd"     description="enhanced vertical diffusivity"             unit="m2/s"                 />
126   <field id="avm_evd"     description="enhanced vertical viscosity"               unit="m2/s"                 />
127   <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d -->
128   <field id="aht2d"       description="lateral eddy diffusivity"                 unit="m2/s" axis_ref="none"  />
129   <field id="aht2d_eiv"   description="EIV lateral eddy diffusivity"             unit="m2/s" axis_ref="none"  />
130      </group>
131     
132      <!-- ptrc on T grid -->
133
134     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">
135       <field id="DIC"         description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" />
136       <field id="Alkalini"    description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L   " />
137       <field id="O2"          description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" />
138       <field id="CaCO3"       description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" />
139       <field id="PO4"         description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" />
140       <field id="POC"         description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" />
141       <field id="Si"          description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" />
142       <field id="PHY"         description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" />
143       <field id="ZOO"         description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" />
144       <field id="PHY2"        description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" />
145       <field id="ZOO2"        description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" />
146       <field id="BSi"         description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" />
147       <field id="Fer"         description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" />
148       <field id="BFe"         description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" />
149       <field id="GOC"         description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" />
150       <field id="SFe"         description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" />
151       <field id="DFe"         description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" />
152       <field id="DSi"         description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" />
153       <field id="NFe"         description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" />
154       <field id="NCHL"        description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" />
155       <field id="DCHL"        description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" />
156       <field id="NO3"         description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" />
157       <field id="NH4"         description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" />
158     </group>
159
160      <!-- diad on T grid -->
161
162     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
163       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" />
164       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" />
165       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" />
166       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" />
167       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
168       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
169       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
170       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
171       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m2/s" axis_ref="deptht" />
172       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" />
173       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" />
174       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s" />
175       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s" />
176       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" />
177       <field id="DelC"        description="Delta CO2"                                unit="uatm" />
178       <field id="PMO"         description="POC export"                               unit="mol-C/m2/s" />
179       <field id="PMO2"        description="GOC export"                               unit="mol-C/m2/s" />
180       <field id="ExpFe1"      description="Nano iron export"                         unit="mol-Fe/m2/s" />
181       <field id="ExpFe2"      description="Diatoms iron export"                      unit="mol-Fe/m2/s" />
182       <field id="ExpSi"       description="Silicate export"                          unit="mol-Si/m2/s" />
183       <field id="ExpCaCO3"    description="Calcite export"                           unit="mol-C/m2/s" />
184       <field id="heup"        description="euphotic layer depth"                     unit="m" />
185       <field id="Fedep"       description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s" />
186       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation"                        unit="mol-N/m2/s" />
187     </group>
188
189    </field_definition>
190   
191    <!-- file definition -->
192   
193    <file_definition output_level="10" enabled=".TRUE.">
194      <file id="ORCA2_5d_grid_T" description="ocean T grid variables" output_freq="432000" output_level="5" >
195   <field ref="toce"         name="votemper"  />
196   <field ref="soce"         name="vosaline"  />
197   <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
198   <field ref="sss"          name="sosaline"  />
199   <field ref="ssh"          name="sossheig"  />
200   <field ref="emp"          name="sowaflup"  />
201   <field ref="qsr"          name="soshfldo"  />
202   <field ref="emps"         name="sowaflcd"  />
203   <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  />
204   <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  />
205   <field ref="mldkz5"       name="somixhgt"  />
206   <field ref="ice_cover"    name="soicecov"  />
207   <field ref="wspd"         name="sowindsp"  />
208   <field ref="qrp"          name="sohefldp"  />
209   <field ref="erp"          name="sowafldp"  />
210   <field ref="bowl"         name="sobowlin"  />
211   <field ref="mlddzt"       name="sothedep"  />
212   <field ref="20d"          name="so20chgt"  />
213   <field ref="28d"          name="so28chgt"  />
214   <field ref="hc300"        name="sohtc300"  />
215   <field ref="ist_ipa"      name="soicetem"  />
216   <field ref="icealb_cea"   name="soicealb"  />   
217      </file>
218     
219      <file id="ORCA2_5d_grid_U" description="ocean U grid variables" output_freq="432000" output_level="5" >
220   <field ref="uoce"         name="vozocrtx"  />
221   <field ref="uoce_eiv"     name="vozoeivu"  />
222   <field ref="utau"         name="sozotaux"  />
223      </file>
224     
225      <file id="ORCA2_5d_grid_V" description="ocean V grid variables" output_freq="432000" output_level="5" >
226   <field ref="voce"         name="vomecrty"  />
227   <field ref="voce_eiv"     name="vomeeivv"  />
228   <field ref="vtau"         name="sometauy"  />
229      </file>
230     
231      <file id="ORCA2_5d_grid_W" description="ocean W grid variables" output_freq="432000" output_level="5" >
232   <field ref="woce"         name="vovecrtz" />
233   <field ref="woce_eiv"     name="voveeivw" />
234   <field ref="avt"          name="votkeavt" />
235   <field ref="avt_evd"      name="votkeevd" />
236   <field ref="avm"          name="votkeavm" />
237   <field ref="avm_evd"      name="votkeevm" />
238   <field ref="avs"          name="voddmavs" />
239   <field ref="aht2d"        name="soleahtw" />
240   <field ref="aht2d_eiv"    name="soleaeiw" />
241      </file>
242     
243      <file id="ORCA2_5d_icemod" description="ice variables" output_freq="432000" output_level="5" >
244   <field ref="ice_pres"                     />
245   <field ref="snowthic_cea" name="isnowthi" />
246   <field ref="icethic_cea"  name="iicethic" />
247   <field ref="iceprod_cea"  name="iiceprod" />
248   <field ref="ist_ipa"      name="iicetemp" />
249   <field ref="ioceflxb"     name="ioceflxb" />
250   <field ref="uice_ipa"     name="iicevelu" />
251   <field ref="vice_ipa"     name="iicevelv" />
252   <field ref="utau_ice"     name="iicestru" />
253   <field ref="vtau_ice"     name="iicestrv" />
254   <field ref="qsr_io_cea"   name="iicesflx" />
255   <field ref="qns_io_cea"   name="iicenflx" />
256   <field ref="snowpre"      name="isnowpre" />
257      </file>
258
259    <file id="ORCA2P_5d_ptrc_T" description="pisces sms variables" output_freq="432000" output_level="5" >
260       <field ref="DIC"      />
261       <field ref="Alkalini" />
262       <field ref="O2"       />
263       <field ref="CaCO3"    />
264       <field ref="PO4"      />
265       <field ref="POC"      />
266       <field ref="Si"       />
267       <field ref="PHY"      />
268       <field ref="ZOO"      />
269       <field ref="PHY2"     />
270       <field ref="ZOO2"     />
271       <field ref="BSi"      />
272       <field ref="Fer"      />
273       <field ref="BFe"      />
274       <field ref="GOC"      />
275       <field ref="SFe"      />
276       <field ref="DFe"      />
277       <field ref="DSi"      />
278       <field ref="NFe"      />
279       <field ref="NCHL"     />
280       <field ref="DCHL"     />
281       <field ref="NO3"      />
282       <field ref="NH4"      />
283    </file>
284
285      <file id="ORCA2P_5d_diad_T" description="additional pisces diagnostics" output_freq="432000" output_level="5" >
286       <field ref="PH"       />
287       <field ref="CO3"      />
288       <field ref="CO3sat"   />
289       <field ref="PAR"      />
290       <field ref="PPPHY"    />
291       <field ref="PPPHY2"   />
292       <field ref="PPNEWN"   />
293       <field ref="PPNEWD"   />
294       <field ref="PBSi"     />
295       <field ref="PFeN"     />
296       <field ref="PFeD"     />
297       <field ref="Cflx"     />
298       <field ref="Oflx"     />
299       <field ref="Kg"       />
300       <field ref="DelC"     />
301       <field ref="PMO"      />
302       <field ref="PMO2"     />
303       <field ref="ExpFe1"   />
304       <field ref="ExpFe2"   />
305       <field ref="ExpSi"    />
306       <field ref="ExpCaCO3" />
307       <field ref="heup"     />
308       <field ref="Fedep"    />
309       <field ref="Nfix"     />
310     </file>
311
312     
313    </file_definition>
314   
315   
316    <axis_definition> 
317      <axis id="deptht" description="Vertical T levels" unit="m" />
318      <axis id="depthu" description="Vertical U levels" unit="m" />
319      <axis id="depthv" description="Vertical V levels" unit="m" />
320      <axis id="depthw" description="Vertical W levels" unit="m" />
321      <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" />
322    </axis_definition> 
323   
324    <grid_definition>
325      <grid id="grid_T" description="grid T" />
326      <grid id="grid_U" description="grid U" />
327      <grid id="grid_V" description="grid V" />
328      <grid id="grid_W" description="grid W" />
329    </grid_definition>   
330   
331  </context>
332 
333</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.