FLUXNET validation sites documentation

Since OOL_1_9_2 version of ORCHIDEE_OL code; we have built an automatic job to validate ORCHIDEE on FLUXNET sites.

You can now find a FLUXNET sub-directory in ORCHIDEE_OL source.

Lancer une simulation avec Site Fluxnet

Presentation du répertoire FLUXNET/

(après "ins_job" - voir documentation sur l'installation des scripts)
Les fichiers de configurations

1. Comme tous les scripts associés à libIGCM, il contient les fichiers
   • config.card : contient les informations de JobName, TagName, Dates et Restart.
   • un Job_${JobName} (par défaut Job_Sp) : contient la carte PBS utilisées pour tous les SPINUP.
   • un fichier run.card.init qui permettra le suivit des lancements de SPINUP.
2. la carte de configuration fluxnet.card : les informations sur la liste des sites, leur type et les paramètres associés à tous les SPINUP.
3. le fichier de paramètre d'ORCHIDEE : orchidee.def

Les utilitaires suivants ne doivent pas être modifiés :

4. le job "maître" Job_FLUXNET_validation
5. le job "maître" pour les post-traitements Job_Post_FLUXNET
6. les scripts d'atlas atlas_FLUXNET.cfg et atlas_FLUXNET_soenke.cfg
7. le script d'installation install
8. les bibliothèques fluxnet.ksh et post_FLUXNET

Les étapes suivantes doivent être effectuées :

1. Pour créer une simulation vous devez modifier le fichier config.card
   • JobName=Sp
   • TagName=OL2 (si besoin)
   • WriteFrequency="1800s"
   • Restart=n
   • TimeSeriesFrequency= NONE (si besoin)

2. Puis vous devez effacer les fichier Job_Sp et run.card.init

3. Ensuite, il faut créé le job avec le bon JobName, et les bons chemins :

     myprompt> cd [..]/modipsl/util
     myprompt> ./ins_job
       Pour installer correctement les Jobs Job_FLUXNET_validation et Job_Post_FLUXNET :
     myprompt> cd [..]/modipsl/modeles/ORCHIDEE_OL/FLUXNET
     myprompt> ./install
   

4. Il faut penser à modifier carte PBS dans le nouveau Job_${JobName} (paramètres dépendant de la machine de calcul)

5. Pour finir, éxécutez simplement Job_FLUXNET_validation; conseillé :

     myprompt> ksh
     myprompt_ksh> nohup ./Job_FLUXNET_validation > out_Job 2>&1 &
   

6. À la fin des SPINUPs, éxécutez simplement Job_Post_FLUXNET; conseillé :

     myprompt_ksh> nohup ./Job_Post_FLUXNET > out_Post 2>&1 &