The objective is to evaluate the performance of ORCHIDEE against in-situ data by running ORCHIDEE on Eddy-covariance sites where C (NEE, GPP, TER) and Energy (LH, SH) fluxes and met data are available.


It consists in a suite of tools able to deal from input data formating to post-treatments. They are developed in Python and Shell scripts (based on the libIGCM library).


Here below is described the flowchart of the Fluxnet processing chain:
[[Image(flowchart.png)]]

(1) Data_Processing


(2) Suite_of_Simulations


(3) Post_Treatment



= FLUXNET validation sites documentation  =

Since OOL_1_9_2 version of ORCHIDEE_OL code; we have built an automatic
job to validate ORCHIDEE on FLUXNET sites. 

You can now find a FLUXNET sub-directory in ORCHIDEE_OL source.

== Lancer une simulation avec Site Fluxnet ==

=== Presentation du répertoire FLUXNET/ ===
 (après "ins_job" - voir documentation sur l'installation des scripts)[[BR]]
 Les fichiers de configurations 
 a. Comme tous les scripts associés à libIGCM,
    il contient les fichiers 
    - config.card : contient les informations de Job``Name, Tag``Name, Dates et Restart.
    - un Job_${Job``Name} (par défaut Job_Sp) : contient la carte PBS utilisées pour tous les SPINUP.
    - un fichier run.card.init qui permettra le suivit des lancements de SPINUP.
 b. la carte de configuration fluxnet.card : les informations sur la liste des sites, leur type et
    les paramètres associés à tous les SPINUP.
 c. le fichier de paramètre d'ORCHIDEE : orchidee.def

 Les utilitaires suivants ne doivent pas être modifiés :
 d. le job "maître" Job_FLUXNET_validation
 e. le job "maître" pour les post-traitements Job_Post_FLUXNET
 f. les scripts d'atlas atlas_FLUXNET.cfg et atlas_FLUXNET_soenke.cfg
 g. le script d'installation install 
 h. les bibliothèques fluxnet.ksh et post_FLUXNET


=== Les étapes suivantes doivent être effectuées : ===
 1. Pour créer une simulation vous devez modifier le fichier config.card
    - Job``Name=Sp
    - Tag``Name=OL2 (si besoin)
    - Write``Frequency="1800s"
    - Restart=n
    - Time``Series``Frequency= NONE (si besoin)

 2. Puis vous devez effacer les fichier Job_Sp et run.card.init

 3. Ensuite, il faut créé le job avec le bon Job``Name, et les bons chemins :
{{{
#!sh
  myprompt> cd [..]/modipsl/util
  myprompt> ./ins_job
    Pour installer correctement les Jobs Job_FLUXNET_validation et Job_Post_FLUXNET :
  myprompt> cd [..]/modipsl/modeles/ORCHIDEE_OL/FLUXNET
  myprompt> ./install
}}}
 4. Il faut penser à modifier carte PBS dans le nouveau Job_${Job``Name} 
    (paramètres dépendant de la machine de calcul)

 5. Pour finir, éxécutez simplement Job_FLUXNET_validation; conseillé :
{{{
#!sh
  myprompt> ksh
  myprompt_ksh> nohup ./Job_FLUXNET_validation > out_Job 2>&1 &
}}}

 6. À la fin des SPINUPs, éxécutez simplement Job_Post_FLUXNET; conseillé :
{{{
#!sh
  myprompt_ksh> nohup ./Job_Post_FLUXNET > out_Post 2>&1 &
}}}