source: XIOS3/trunk/src/node/domain.hpp @ 2388

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Manage hash values with size_t in hash tables of elements associated to output files

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
File size: 14.4 KB
Line 
1#ifndef __XIOS_CDomain__
2#define __XIOS_CDomain__
3
4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
6#include "group_factory.hpp"
7
8#include "declare_group.hpp"
9#include "declare_ref_func.hpp"
10#include "event_client.hpp"
11#include "event_server.hpp"
12#include "buffer_in.hpp"
13#include "array_new.hpp"
14#include "attribute_array.hpp"
15#include "attribute_enum.hpp"
16#include "transformation.hpp"
17#include "transformation_enum.hpp"
18#include "transformation_path.hpp"
19#include "server_distribution_description.hpp"
20#include "mesh.hpp"
21#include "element.hpp"
22#include "local_connector.hpp"
23#include "scatterer_connector.hpp"
24#include "gatherer_connector.hpp"
25#include "distribution_type.hpp"
26#include "generic_algorithm_transformation.hpp"
27
28
29namespace xios
30{
31
32   /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
33
34   class CDomainGroup;
35   class CDomainAttributes;
36   class CDomain;
37   class CFile;
38   class CField ;
39
40   ///--------------------------------------------------------------
41
42   // Declare/Define CDomainAttribute
43   BEGIN_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CDomain)
44#  include "domain_attribute.conf"
45#  include "domain_attribute_private.conf"
46   END_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CDomain)
47
48   ///--------------------------------------------------------------
49
50   class CDomain
51      : public CObjectTemplate<CDomain>
52      , public CDomainAttributes
53   {
54     /// typedef ///
55     typedef CObjectTemplate<CDomain>   SuperClass;
56     typedef CDomainAttributes SuperClassAttribute;
57     public:
58         enum EEventId
59         {
60           EVENT_ID_COLLECTIVE=100,
61           EVENT_ID_DOMAIN_DISTRIBUTION, EVENT_ID_SEND_DISTRIBUTED_ATTRIBUTE,
62           EVENT_ID_NO_COLLECTIVE=100,
63         } ;
64
65      public:
66
67         typedef CDomainAttributes RelAttributes;
68         typedef CDomainGroup      RelGroup;
69         
70         /// Constructeurs ///
71         CDomain(void);
72         explicit CDomain(const StdString & id);
73         CDomain(const CDomain & domain);       // Not implemented yet.
74         CDomain(const CDomain * const domain); // Not implemented yet.
75         static void releaseStaticAllocation(void) ; // release static allocation on heap
76
77         static CDomain* createDomain();
78         static CDomain* get(const string& id, bool noError=false) ; //<! return domain pointer using id
79         static bool has(const string& id) ; //<! return domain pointer using id
80         static CField*  getFieldFromId(const string& id) ;
81
82         CMesh* mesh;
83         void assignMesh(const StdString, const int);
84       
85         virtual void parse(xml::CXMLNode & node);
86
87         void setContextClient(CContextClient* contextClient);
88
89         /// Vérifications ///
90         void checkAttributes(void);
91         bool checkAttributes_done_ = false ;
92
93         size_t computeAttributesHash( MPI_Comm comm );
94         
95      //////////////////////////
96      ///// transformations ////
97      //////////////////////////
98      public:
99        typedef CTransformation<CDomain>::TransformationMapTypes TransMapTypes;
100      private:
101        static bool initializeTransformationMap(std::map<StdString, ETranformationType>& m);
102        static std::map<StdString, ETranformationType> transformationMapList_;
103        static bool dummyTransformationMapList_;
104        TransMapTypes transformationMap_;         
105
106      public:
107        CTransformation<CDomain>* addTransformation(ETranformationType transType, const StdString& id="");
108        CTransformation<CDomain>* addTransformation(ETranformationType transType, CTransformation<CDomain>* transformation) ;
109        void setTransformations(const TransMapTypes&);         
110        void duplicateTransformation(CDomain*);
111        TransMapTypes getAllTransformations();
112        bool hasTransformation();
113        void solveInheritanceTransformation_old(); // to remove later
114        void solveInheritanceTransformation();
115      private:
116        bool solveInheritanceTransformation_done_= false ;
117      public:
118        bool activateFieldWorkflow(CGarbageCollector& gc) ;
119      private:
120        bool activateFieldWorkflow_done_=false ;
121
122      private:
123        shared_ptr<CGenericAlgorithmTransformation> transformationAlgorithm_ = nullptr ;
124      public:
125        void setTransformationAlgorithm(shared_ptr<CGenericAlgorithmTransformation> transformationAlgorithm) { transformationAlgorithm_=transformationAlgorithm ;}
126        shared_ptr<CGenericAlgorithmTransformation> getTransformationAlgorithm(void) { return transformationAlgorithm_ ;}   
127      private:
128        CTransformationPaths transformationPaths_ ;
129      public:
130        CTransformationPaths getTransformationPaths(void) {return transformationPaths_;} 
131        void setTransformationPaths(const CTransformationPaths& transformationPaths) { transformationPaths_=transformationPaths ;}
132
133      ////////////////////////////
134
135         void redistribute(int nbLocalDomain);
136
137      public:
138         const std::set<StdString> & getRelFiles(void) const;
139         bool IsWritten(const StdString & filename) const;
140         bool isWrittenCompressed(const StdString& filename) const;
141         
142         std::map<int, StdSize> getAttributesBufferSize(CContextClient* client, bool bufferForWriting = false);
143
144         bool isEmpty(void) const;
145         bool isDistributed(void) const;
146
147        public :
148         /*!
149            \brief return if the domain can be written or not in a compressed way.
150            ie if there are some masked or indexed point on the domain. Valid only on server side.
151            \return true if domain can be writtedn in a compressed way
152         */ 
153         bool isCompressible(void) { if (!isCompressibleComputed_) computeIsCompressible() ; return isCompressible_ ;} 
154        private :
155         bool isCompressible_ ; /** specify if the domain can be written in a compressed way */ 
156         bool isCompressibleComputed_=false ; /** Indicate if compressability has been computed*/
157         void computeIsCompressible() ;
158
159      public :
160         bool isEqual(CDomain* domain);
161
162         static bool dispatchEvent(CEventServer& event);
163     
164      private:
165         /** define if the domain is completed or not ie all attributes have been received before in case
166             of grid reading from file or coupling */ 
167         bool isCompleted_=true ; 
168      public:     
169        /*!
170           \brief Check if a domain is completed
171           Before make any domain processing, we must be sure that all domain informations have
172           been sent, for exemple when reading a grid in a file or when grid elements are sent by an
173           other context (coupling). So all direct reference of the domain (domain_ref) must be also completed
174           \return true if domain and domain reference are completed
175          */
176         bool isCompleted(void)
177         {
178           if (hasDirectDomainReference()) if (!getDirectDomainReference()->isCompleted()) return false;
179           else return isCompleted_ ;
180
181           MISSING_RETURN( "bool CDomain::isCompleted() " );
182           return true;
183         }
184         void setCompleted(void) { isCompleted_=true ; }
185         void unsetCompleted(void) { isCompleted_=false ; }
186
187      public:
188         /// Mutateur ///
189         void addRelFile(const StdString & filename);
190         void addRelFileCompressed(const StdString& filename);           
191         
192         void AllgatherRectilinearLonLat(CArray<double,1>& lon, CArray<double,1>& lat,
193                                         CArray<double,1>& lon_g, CArray<double,1>& lat_g);
194
195         void fillInRectilinearBoundLonLat(CArray<double,1>& lon, CArray<double,1>& lat,
196                                           CArray<double,2>& boundsLon, CArray<double,2>& boundsLat);
197         
198         void fillInLonLat();
199         bool distributionAttributesHaveValue() const;
200
201         size_t getGlobalWrittenSize() ;
202         /// Destructeur ///
203         virtual ~CDomain(void);
204
205         /// Accesseurs statiques ///
206         static StdString GetName(void);
207         static StdString GetDefName(void);
208
209         static ENodeType GetType(void);       
210
211      public:
212         CArray<double, 1> lonvalue, latvalue;
213         CArray<double, 2> bounds_lonvalue, bounds_latvalue;
214         CArray<double, 1> areavalue;
215
216
217         CArray<bool, 1> domainMask; // mask_1d, mask_2d -> domainMask
218         CArray<bool, 1> localMask; // domainMask + indexing
219         bool isCurvilinear ;
220         bool hasBounds ;
221         bool hasArea;
222         bool hasLonLat;
223         bool hasPole ;
224       
225         void computeLocalMask(void) ;
226     
227         /** The number of server of a context client. Avoid to re-compute indice computed in a previous computeConnectedClient */
228         private: std::set<int> listNbServer_ ;
229         
230      private:
231         void checkDomain(void);
232         void checkLocalIDomain(void);
233         void checkLocalJDomain(void);
234
235         void checkMask(void);
236         void checkDomainData(void);
237         void checkCompression(void);
238
239         void checkBounds(void);
240         void checkArea(void);
241         void checkLonLat();
242         
243       public:
244         void sendDomainToFileServer(CContextClient* client) ;
245       private:
246         std::set<CContextClient*> sendDomainToFileServer_done_ ;
247       public:
248         void sendDomainToCouplerOut(CContextClient* client, const string& fieldId, int posInGrid) ;
249       private:
250         std::set<CContextClient*> sendDomainToCouplerOut_done_ ;
251     
252       public:
253        void makeAliasForCoupling(const string& fieldId, int posInGrid) ;
254        string getCouplingAlias(const string& fieldId, int posInGrid) ;
255       private:
256
257         void convertLonLatValue();
258         void fillInRectilinearLonLat();
259         void fillInCurvilinearLonLat();
260         void fillInUnstructuredLonLat();
261         void completeLonLatClient(void); 
262         
263         
264       private:         
265
266/** Clients that have to send a domain. There can be multiple clients in case of secondary server, otherwise only one client. */
267         std::list<CContextClient*> clients;
268         std::set<CContextClient*> clientsSet;
269
270         bool isChecked ;
271         std::set<StdString> relFiles, relFilesCompressed;
272
273/** only on client side : Global index of each client sent to server: map<serverSize, map<serverRank, indexes>>
274    indSrv_[nbServers] -->  first map is related to the server distribution (ie associated with the contextClient)
275    indSrv_[nbServers][server_rank] -> array of global index sent to the server of rank "server_rank"
276    indSrv_[nbServers][server_rank](ind) --> global index on server of the local element "ind" sent (for lon, lat, mask, etc...)
277*/
278         std::map<int, std::unordered_map<int, vector<size_t> > > indSrv_;
279
280         std::map<int, std::vector<int> > connectedServerRank_;
281
282         bool isRedistributed_;
283         bool isUnstructed_;
284
285       
286       //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
287       //  this part is related to distribution, element definition, views and connectors  //
288       //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
289       private:
290         shared_ptr<CLocalElement> localElement_ = nullptr ;
291         void initializeLocalElement(void) ;
292       
293       public: 
294         shared_ptr<CLocalElement> getLocalElement(void) { if (localElement_==nullptr) initializeLocalElement() ; return localElement_ ; }
295         shared_ptr<CLocalView> getLocalView(CElementView::type type) { return getLocalElement()->getView(type) ;}
296       
297       private: 
298         void addFullView(void) ;
299         void addWorkflowView(void) ;
300         void addModelView(void) ;
301       
302       private:
303         shared_ptr<CLocalConnector> modelToWorkflowConnector_ ;
304         void computeModelToWorkflowConnector(void)  ;
305       public:
306         shared_ptr<CLocalConnector> getModelToWorkflowConnector(void) { if (modelToWorkflowConnector_==nullptr) computeModelToWorkflowConnector() ; return modelToWorkflowConnector_ ;}
307
308       public:
309         void computeRemoteElement(CContextClient* client, EDistributionType) ;
310         void distributeToServer(CContextClient* client, std::map<int, CArray<size_t,1>>& globalIndexOut, std::map<int, CArray<size_t,1>>& globalIndexIn, 
311                                 shared_ptr<CScattererConnector> &scattererConnector, const string& domainId="") ;
312
313         static void recvDomainDistribution(CEventServer& event) ;
314         void receivedDomainDistribution(CEventServer& event, int phasis) ;
315
316         void sendDistributedAttributes(CContextClient* client, shared_ptr<CScattererConnector> scaterrerConnector, const string& domainId) ;
317         static void recvDistributedAttributes(CEventServer& event) ;
318         void recvDistributedAttributes(CEventServer& event, const string& type) ;
319         void setServerMask(CArray<bool,1>& serverMask, CContextClient* client) ;
320
321       private:
322         map<CContextClient*, shared_ptr<CDistributedElement>> remoteElement_ ;
323       public: 
324         shared_ptr<CDistributedElement> getRemoteElement(CContextClient* client) {return remoteElement_[client] ;}
325       private:
326         map<CContextClient*, shared_ptr<CScattererConnector>> clientToServerConnector_ ;
327       public: 
328         shared_ptr<CScattererConnector> getClientToServerConnector(CContextClient* client) { return clientToServerConnector_[client] ;}
329       
330       private:
331         shared_ptr<CGathererConnector>  gathererConnector_ ;
332       public:
333         shared_ptr<CGathererConnector> getGathererConnector(void) { return gathererConnector_ ;}
334        private:
335         shared_ptr<CGathererConnector> serverFromClientConnector_ ;
336         shared_ptr<CDistributedElement> elementFrom_ ;
337       public:
338         shared_ptr<CGathererConnector> getServerFromClientConnector(void) { return serverFromClientConnector_ ;}
339
340       private:
341         shared_ptr<CScattererConnector> serverToClientConnector_ = nullptr ;
342         shared_ptr<CDistributedElement> elementTo_ ;
343       public: 
344         shared_ptr<CScattererConnector> getServerToClientConnector(void) { return serverToClientConnector_ ;} 
345
346       private:
347         map<CContextClient*,shared_ptr<CGathererConnector>>  clientFromServerConnector_  ;
348       public: 
349         shared_ptr<CGathererConnector> getClientFromServerConnector(CContextClient* client) { return clientFromServerConnector_[client] ;}       
350         
351
352         DECLARE_REF_FUNC(Domain,domain)
353
354   }; // class CDomain
355
356   ///--------------------------------------------------------------
357
358   // Declare/Define CDomainGroup and CDomainDefinition
359   DECLARE_GROUP(CDomain);
360
361   ///--------------------------------------------------------------
362
363} // namespace xios
364
365#endif //__XIOS_CDomain__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.