source: XIOS3/trunk/src/io/nc4_data_output.hpp @ 2634

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Add a field attribute, conversion_by_NetCDF, to operate type conversion in XIOS, and not in NetCDF
  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
File size: 6.2 KB
Line 
1#ifndef __XIOS_NC4_DATA_OUTPUT__
2#define __XIOS_NC4_DATA_OUTPUT__
3
4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
6#include "onetcdf4.hpp"
7#include "data_output.hpp"
8
9namespace xios
10{
11      /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
12
13      class CNc4DataOutput
14         : protected CONetCDF4
15         , public virtual CDataOutput
16      {
17         public :
18
19            /// Définition de type ///
20            typedef CONetCDF4   SuperClassWriter;
21            typedef CDataOutput SuperClass;
22
23            /// Constructeurs ///
24            CNc4DataOutput
25               (CFile* file, const StdString & filename, bool exist);
26            CNc4DataOutput
27               (CFile* file, const StdString & filename, bool exist, bool useClassicFormat,
28                bool useCFConvention,
29                MPI_Comm comm_file, bool multifile, bool isCollective = true,
30                const StdString& timeCounterName = "time_counter");
31
32            CNc4DataOutput(const CNc4DataOutput & dataoutput);       // Not implemented.
33            CNc4DataOutput(const CNc4DataOutput * const dataoutput); // Not implemented.
34           
35            /// Accesseur ///
36            const StdString & getFileName(void) const;
37
38            /// Destructeur ///
39            virtual ~CNc4DataOutput(void);
40           
41            bool singleDomain ;
42            bool isCollective ;
43            int compressionLevel ;
44                     
45            CFile* file;
46                     
47         protected :
48
49            /// Ecriture ///
50            virtual void writeDomain_   (CDomain* domain);
51            virtual void writeAxis_     (CAxis* axis);
52            virtual void writeScalar_   (CScalar* scalar);
53            virtual void writeGridCompressed_(CGrid* grid);
54            virtual void writeTimeDimension_(void);
55            virtual void writeField_    (CField* field);
56            virtual void writeAttribute_(CVariable* var);
57            virtual void writeAttribute_(CVariable* var, const string& fieldId);
58            virtual int  writeFieldData_(CField* field, const CArray<double,1>& data, const CDate& lastWrite, const CDate& currentWrite, int nstep);
59            void writeAndConvertData(CField* field, const CArray<double,1>& data, StdSize record, const std::vector<StdSize> *start = NULL, const std::vector<StdSize> *count = NULL);
60            virtual void writeFile_     (CFile* file);
61            virtual void closeFile_     (void);
62            virtual void syncFile_      (void);
63            virtual void writeTimeAxis_ (CField* field,
64                                         const std::shared_ptr<CCalendar> cal);
65
66         protected :
67            void writeUnstructuredDomain (CDomain* domain);
68            void writeUnstructuredDomainUgrid (CDomain* domain);
69            void writeLocalAttributes(int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, StdString domid);
70            void writeLocalAttributes_IOIPSL(const StdString& dimXid, const StdString& dimYid,
71                                             int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, int ni_glo, int nj_glo, int rank, int size);
72            void writeTimeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
73                                         const StdString & calendar,
74                                         const StdString & units,
75                                         const StdString & time_origin,
76                                         const StdString & time_bounds   = StdString("bounds"),
77                                         const StdString & standard_name = StdString("time"),
78                                         const StdString & long_name     = StdString("Time axis"));
79
80            void writeFileAttributes(const StdString & name,
81                                     const StdString & description,
82                                     const StdString & conventions,
83                                     const StdString & production,
84                                     const StdString & timeStamp);
85
86            void writeMaskAttributes(const StdString & mask_name,
87                                     int data_dim,
88                                     int data_ni     = 0,
89                                     int data_nj     = 0,
90                                     int data_ibegin = 0,
91                                     int data_jbegin = 0);
92
93            void writeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
94                                     const StdString & axis,
95                                     const StdString & standard_name,
96                                     const StdString & long_name,
97                                     const StdString & units,
98                                     const StdString & nav_model);
99
100            StdSize getRecordFromTime(Time time, double factorUnit);
101
102         private :
103
104            /// Traitement ///
105            StdString getTimeStamp(void) const;
106
107            bool isWrittenDomain(const std::string& domainName) const;
108            bool isWrittenCompressedDomain(const std::string& domainName) const;
109            bool isWrittenAxis(const std::string& axisName) const;
110            bool isWrittenCompressedAxis(const std::string& axisName) const;
111            bool isWrittenScalar(const std::string& scalarName) const;
112
113            void setWrittenDomain(const std::string& domainName);
114            void setWrittenCompressedDomain(const std::string& domainName);
115            void setWrittenAxis(const std::string& axisName);
116            void setWrittenCompressedAxis(const std::string& axisName);
117            void setWrittenScalar(const std::string& scalarName);
118
119            /// Propriétés privées ///
120            MPI_Comm comm_file;
121            const StdString filename;
122            std::map<Time, StdSize> timeToRecordCache;
123
124            std::set<std::string> writtenDomains, writtenCompressedDomains;
125            std::set<std::string> writtenAxis, writtenCompressedAxis;
126            std::set<std::string> writtenScalar;
127
128            enum { none, centered, instant, record} timeCounterType ;
129            bool hasTimeInstant ;
130            bool hasTimeCentered ;
131       
132            std::multimap< StdString, pair<size_t,CAxis*> > relAxis_;
133            std::multimap< StdString, pair<size_t,CDomain*> > relDomains_;
134
135      }; // class CNc4DataOutput
136
137} // namespace xios
138
139#endif //__XIOS_NC4_DATA_OUTPUT__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.