source: XIOS/dev/dev_ym/XIOS_COUPLING/xios_test_suite/TEST_SUITE/step1.py @ 2272

Last change on this file since 2272 was 2272, checked in by jderouillat, 3 years ago

Introduce different levels of test in test suite, levels can be set in function of the machine, arch and mode.
File size: 13.2 KB
Line 
1import glob
2import sys
3import subprocess
4import os
5import json
6import itertools
7import copy
8
9param_list =       ["DomMask",    "AxisMask", "Domain", "UseServer2", "NumberClients", "NumberServers", "PctServer2", "Duration", "OneSided", "NonDistTran"]
10param_short_list = ["DomMask",    "AxisMask", "Dom",    "Srv2",       "NbClnt",        "NbSrv",         "PctSrv2",    "Duration", "OneSided", "NDtTr"]
11
12mode=os.getenv("mode")
13arch=os.getenv("arch")
14machine=os.getenv("xios_machine_name")
15svnR=os.getenv("svnR")
16user_acct=os.getenv("user_account")
17
18nb_proc_irene=40 # this must be >= NumberClients+NumberServers for all configs for all test folders
19nb_proc_jz=40 # to run completly in parallel, this must be set to 40 for the moment
20              # otherwise, jobs should be regrouped by test folder. jobs in folder are parallel, folders are sequential
21              # in this case,nb_proc_jz >= sum(NumberClients+NumberServers) for each test folder
22
23def OSinfo(runthis):
24    red = lambda text: '\033[0;31m' + text + '\033[0m'
25    osstdout = subprocess.Popen(runthis, shell=True, stdin=subprocess.PIPE, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE, close_fds=True)
26    theInfo, theErr = osstdout.communicate()
27    #print( theInfo )
28    if theErr:
29        print(red(runthis+" FAILED"))
30        print(theErr)
31        sys.exit()
32
33def product_dict(**kwargs):
34    keys = kwargs.keys()
35    vals = kwargs.values()
36    for instance in itertools.product(*vals):
37        yield dict(zip(keys, instance))
38
39def get_default_param():
40    f=open("default_param.json", 'r')
41    default_param = json.load(f)
42    f.close()
43    l = list(default_param[0].items())
44    l.sort()
45    def_param=dict(l)
46    return def_param
47
48def get_test_type():
49    test_type = "basic"
50    if ( machine == "irene" ):
51        test_type = "advanced"
52    return test_type
53
54def generate_job(fn, n):
55    if machine=="irene":
56        with open(fn, "w") as fh:
57            fh.write("#!/bin/bash\n")
58            fh.write("#====================================================\n")
59            fh.write("# Generated by step1.py\n")
60            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
61            fh.write("# For Irene\n")
62            fh.write("#====================================================\n")
63            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
64            fh.write("#MSUB -eo\n")
65            fh.write("#MSUB -o client_output.out\n")
66            fh.write("#MSUB -e client_error.out\n")
67            fh.write("#MSUB -c 1\n")
68            fh.write("#MSUB -n "+str(n)+"\n")
69            fh.write("#MSUB -X\n")
70            fh.write("#MSUB -x\n")
71            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
72            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
73            fh.write("#MSUB -A "+user_acct+"\n")
74            fh.write("#MSUB -Q test\n")
75            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
76            fh.write("cp ../../build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe ./\n")
77            fh.write("source ../../build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
78            fh.write("ccc_mprun -n "+str(n)+" generic_testcase.exe\n")
79
80    if machine=="jeanzay":
81        with open(fn, "w") as fh:
82            fh.write("#!/bin/bash\n")
83            fh.write("#====================================================\n")
84            fh.write("# Generated by step1.py\n")
85            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
86            fh.write("# For Jean-Zay\n")
87            fh.write("#====================================================\n")
88            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(n)+"\n")
89            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
90            fh.write("#SBATCH -o output.out\n")
91            fh.write("#SBATCH -e error.out\n")
92            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
93            fh.write("#SBATCH --account="+user_acct+"\n")
94            fh.write("#SBATCH --exclusive\n")
95            fh.write("ulimit -c 0\n")
96            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
97            fh.write("cp ../../build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe ./\n")
98            fh.write("source ../../build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
99            #fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
100            fh.write("srun generic_testcase.exe")
101
102
103def update_full_job(location, n):
104    global my_counter
105    if machine=="irene":
106        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
107            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; ccc_mprun -E \'--exclusive\' -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output_"+arch+"_"+mode+".out 2> error_"+arch+"_"+mode+".out &\n")
108            fh.write("PIDS+=($!)\n")
109            fh.write("CONFIGS+=("+location+")\n")
110    if machine=="jeanzay":
111        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
112            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; srun --exclusive -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output_"+arch+"_"+mode+".out 2> error_"+arch+"_"+mode+".out &\n")
113
114def main():
115
116    if machine=="irene":
117        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
118            fh.write("#!/bin/bash\n")
119            fh.write("#====================================================\n")
120            fh.write("# Generated by step1.py\n")
121            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
122            fh.write("#====================================================\n")
123            fh.write("#MSUB -r XIOS_rev"+svnR+"\n")
124            fh.write("#MSUB -eo\n")
125            fh.write("#MSUB -o output_"+arch+"_"+mode+".out\n")
126            fh.write("#MSUB -e error_"+arch+"_"+mode+".err\n")
127            fh.write("#MSUB -c 1\n")
128            fh.write("#MSUB -n "+str(nb_proc_irene)+"\n")
129            fh.write("#MSUB -X\n")
130            fh.write("#MSUB -x\n")
131            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
132            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
133            fh.write("#MSUB -A "+user_acct+"\n")
134            fh.write("#MSUB -Q test\n")
135            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
136            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
137            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
138            fh.write("source build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
139            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
140            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
141     
142    if machine=="jeanzay":
143        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
144            fh.write("#!/bin/bash\n")
145            fh.write("#====================================================\n")
146            fh.write("# Generated by step1.py\n")
147            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
148            fh.write("#====================================================\n")
149            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(nb_proc_jz)+"\n")
150            fh.write("#SBATCH -o output_"+arch+"_"+mode+".out\n")
151            fh.write("#SBATCH -e error_"+arch+"_"+mode+".out\n")
152            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
153            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
154            fh.write("#SBATCH --account="+user_acct+"\n")
155            fh.write("#SBATCH --job-name=XIOS_rev"+svnR+"\n")
156            fh.write("#SBATCH --exclusive\n")
157            fh.write("ulimit -c 0\n")
158            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
159            fh.write("source build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
160            #fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
161            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
162            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
163            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
164            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
165
166
167
168    test_folder_list = glob.glob('test_*')
169    #all_config=dict()
170
171    default_param = get_default_param()
172    #print(default_param)
173
174    # default = basic, function( machine, arch, mode )
175    test_type = get_test_type()
176
177    for test_folder in test_folder_list:
178        config_list=[]
179        config_name=[]
180        with open(test_folder+"/user_param_"+test_type+".json", "r") as f:
181            config_dict = json.load(f)
182
183        for i in range(len(config_dict)):
184            config_list.extend(list(product_dict(**config_dict[i])))
185            #print(config_list)
186        for i in range(len(config_list)):
187            # print(config_list[i])
188            keylist = list(config_list[i].keys())
189            # print(keylist)
190            full_config = copy.deepcopy(default_param)
191            for j in range(len(keylist)):
192                full_config[ keylist[j] ] = config_list[i][keylist[j]]
193
194            #print(full_config)
195            mystr = str(full_config)
196            mystr = mystr.replace("{", "")
197            mystr = mystr.replace("}", "")
198            mystr = mystr.replace("[", "")
199            mystr = mystr.replace("]", "")
200            mystr = mystr.replace(",", "")
201            mystr = mystr.replace(":", "")
202            mystr = mystr.replace("u'", "")
203            mystr = mystr.replace("b'", "")
204            mystr = mystr.replace("'", "")
205            mystr = mystr.replace(" ", "_")
206            for j in range(len(param_list)):
207                mystr = mystr.replace(param_list[j], param_short_list[j])
208            if not mystr in config_name:
209                config_name.append(mystr)
210            #print(mystr)
211            if ( os.path.isdir( test_folder+"/CONFIG_"+mystr ) ) :
212                OSinfo("rm -rf "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
213            OSinfo("mkdir -p "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
214            OSinfo("cp build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
215            OSinfo("cp iodef.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
216            OSinfo("cp "+test_folder+"/context_atm.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml.tmp")
217
218            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp", "r") as f:
219                lines = f.readlines()
220                for i in range(len(lines)):
221                    if "XIOS::" in lines[i]:
222                        config_keys = list(full_config.keys())
223                        for idx in range(len(config_keys)):
224                            lines[i] = lines[i].replace("XIOS::"+config_keys[idx], str(full_config[config_keys[idx]]))
225                with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml", "w") as g:
226                    for line in lines:
227                        g.write(line)
228
229            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml.tmp", "r") as f:
230                lines = f.readlines()
231                for i in range(len(lines)):
232                    if "XIOS::" in lines[i]:
233                        config_keys = list(full_config.keys())
234                        for idx in range(len(config_keys)):
235                            lines[i] = lines[i].replace("XIOS::"+config_keys[idx], str(full_config[config_keys[idx]]))
236                with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml", "w") as g:
237                    for line in lines:
238                        g.write(line)
239
240
241            OSinfo("rm -f "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
242            OSinfo("rm -f "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml.tmp")
243            OSinfo("cp context_grid_dynamico.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
244            OSinfo("cp dynamico_grid.nc "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
245            OSinfo("cp "+test_folder+"/checkfile.def "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
246            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/param.def", "w") as fh:
247                fh.write("&params_run\n")
248                fh.write("duration=\'"+full_config["Duration"]+"\'\n")
249                fh.write("nb_proc_atm="+str(full_config["NumberClients"])+"\n")
250                fh.write("/\n")
251            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/all_param.def", "w") as fh:
252                fh.write("&params_run\n")
253                for param in param_list:
254                    fh.write(param+"="+str(full_config[param])+"\n")
255                fh.write("/\n")
256
257            generate_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/job_"+arch+"_"+mode+".sh", full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
258            update_full_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr, full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
259
260        #if machine=="jeanzay":
261        #    with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
262        #        fh.write("wait\nwait\n")
263        #        fh.write("echo \"tests in "+test_folder+" finished\"\n")
264        #all_config[test_folder] = config_name
265 
266
267    if machine=="irene":
268        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
269            #fh.write("\nfor pid in ${PIDS[@]}; do\n")
270            #fh.write("wait ${pid}\n")
271            #fh.write("STATUS+=($?)\ndone\n")
272            #fh.write("\ni=0\n")
273            #fh.write("#for st in ${STATUS[@]}; do\n")
274            #fh.write("#if [[ ${st} -ne 0 ]]; then\n")
275            #fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} -1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
276            #fh.write("#else\n")
277            #fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} 1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
278            #fh.write("#fi\n")
279            #fh.write("#((i+=1))\n")
280            #fh.write("#done\n\n")
281            fh.write("wait\nwait\n")
282            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
283    if machine=="jeanzay":
284        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
285            fh.write("wait\nwait\n")
286            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
287
288
289if __name__== "__main__":
290  main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.