[1999] | 1 | #ifndef __REDUCE_TRANSFORM_CONNECTOR_HPP__ |
---|
| 2 | #define __REDUCE_TRANSFORM_CONNECTOR_HPP__ |
---|
| 3 | |
---|
| 4 | #include "xios_spl.hpp" |
---|
| 5 | #include "array_new.hpp" |
---|
| 6 | #include "local_view.hpp" |
---|
| 7 | #include "reduction_types.hpp" |
---|
[2000] | 8 | #include <algorithm> |
---|
[1999] | 9 | |
---|
| 10 | |
---|
| 11 | |
---|
| 12 | namespace xios |
---|
| 13 | { |
---|
| 14 | |
---|
| 15 | class CReduceTransformConnector |
---|
| 16 | { |
---|
| 17 | |
---|
| 18 | private: |
---|
[2267] | 19 | shared_ptr<CLocalView> srcView_; |
---|
| 20 | shared_ptr<CLocalView> dstView_; |
---|
[1999] | 21 | |
---|
| 22 | vector<int> connector_; // sizeof sum(nWeights_) |
---|
| 23 | vector<int> nSrc_ ; // sizeof dstSize_ |
---|
| 24 | int srcSize_ ; |
---|
| 25 | int dstSize_ ; |
---|
| 26 | bool detectMissingValue_ ; |
---|
| 27 | EReduction type_ ; |
---|
| 28 | |
---|
| 29 | typedef void (CReduceTransformConnector::* transferPtr)(int, int, const CArray<double,1>& , CArray<double,1>&) ; |
---|
| 30 | transferPtr transfer_ ; |
---|
| 31 | |
---|
| 32 | void computeConnector(unordered_map<int, std::vector<int>>& indexMap) ; |
---|
| 33 | |
---|
| 34 | public: |
---|
| 35 | |
---|
[2267] | 36 | CReduceTransformConnector(shared_ptr<CLocalView> srcView, shared_ptr<CLocalView> dstView, EReduction op, unordered_map<int, std::vector<int>>& indexMap, |
---|
[1999] | 37 | bool detectMissingValue=true) ; |
---|
| 38 | |
---|
| 39 | void transfer(const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 40 | { |
---|
| 41 | transfer(1,1,dataIn, dataOut) ; |
---|
| 42 | } |
---|
| 43 | void transfer(int sizeT, const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 44 | { |
---|
| 45 | transfer(1,sizeT, dataIn, dataOut) ; |
---|
| 46 | } |
---|
| 47 | |
---|
| 48 | void transfer(int repeat, int sizeT, const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 49 | { |
---|
| 50 | (this->*transfer_)(repeat, sizeT, dataIn, dataOut) ; |
---|
| 51 | } |
---|
| 52 | |
---|
| 53 | private : |
---|
| 54 | |
---|
| 55 | void transferSum(int repeat, int sizeT, const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 56 | { |
---|
| 57 | double defaultValue = std::numeric_limits<double>::quiet_NaN(); |
---|
| 58 | |
---|
| 59 | int dstSlice = dstSize_*sizeT ; |
---|
| 60 | int srcSlice = srcSize_*sizeT ; |
---|
| 61 | dataOut.resize(repeat* dstSlice) ; |
---|
| 62 | dataOut=0 ; |
---|
| 63 | |
---|
| 64 | const double* input = dataIn.dataFirst() ; |
---|
| 65 | double* output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
| 66 | |
---|
| 67 | if (detectMissingValue_) |
---|
| 68 | { |
---|
| 69 | vector<bool> touched(repeat* dstSlice, false) ; |
---|
[2291] | 70 | int posr=0 ; |
---|
| 71 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[1999] | 72 | { |
---|
| 73 | const double* in = input; |
---|
| 74 | double* out = output ; |
---|
| 75 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 76 | int pos = posr ; |
---|
[1999] | 77 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 78 | { |
---|
| 79 | if (nSrc_[i]==0) for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 80 | else |
---|
| 81 | { |
---|
| 82 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 83 | for(int l=0; l<sizeT; l++) |
---|
| 84 | { |
---|
| 85 | if (! std::isnan(in[connector_[k]*sizeT+l]) ) |
---|
| 86 | { |
---|
| 87 | if (touched[pos+l]) out[l] += in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 88 | else |
---|
| 89 | { |
---|
| 90 | touched[pos+l] = true ; |
---|
| 91 | out[l] = in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 92 | } |
---|
| 93 | } |
---|
| 94 | } |
---|
| 95 | } |
---|
| 96 | } |
---|
| 97 | } |
---|
| 98 | |
---|
| 99 | output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
[2291] | 100 | posr=0 ; |
---|
| 101 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[1999] | 102 | { |
---|
| 103 | const double* in = input; |
---|
| 104 | double* out = output ; |
---|
| 105 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 106 | int pos=posr ; |
---|
[1999] | 107 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 108 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 109 | for(int l=0; l<sizeT; l++) if (!touched[pos+l]) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 110 | } |
---|
| 111 | |
---|
| 112 | } |
---|
| 113 | else |
---|
| 114 | { |
---|
| 115 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice) |
---|
| 116 | { |
---|
| 117 | const double* in = input; |
---|
| 118 | double* out = output ; |
---|
| 119 | int k=0 ; |
---|
| 120 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT) |
---|
| 121 | if (nSrc_[i]==0) |
---|
| 122 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 123 | else |
---|
| 124 | { |
---|
| 125 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 126 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] += in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 127 | } |
---|
| 128 | } |
---|
| 129 | } |
---|
| 130 | } |
---|
| 131 | |
---|
[2000] | 132 | void transferMin(int repeat, int sizeT, const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 133 | { |
---|
| 134 | double defaultValue = std::numeric_limits<double>::quiet_NaN(); |
---|
[1999] | 135 | |
---|
[2000] | 136 | int dstSlice = dstSize_*sizeT ; |
---|
| 137 | int srcSlice = srcSize_*sizeT ; |
---|
| 138 | dataOut.resize(repeat* dstSlice) ; |
---|
| 139 | dataOut=0 ; |
---|
| 140 | |
---|
| 141 | const double* input = dataIn.dataFirst() ; |
---|
| 142 | double* output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
| 143 | |
---|
| 144 | if (detectMissingValue_) |
---|
| 145 | { |
---|
| 146 | vector<bool> touched(repeat* dstSlice, false) ; |
---|
[2291] | 147 | int posr=0 ; |
---|
| 148 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[2000] | 149 | { |
---|
| 150 | const double* in = input; |
---|
| 151 | double* out = output ; |
---|
| 152 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 153 | int pos=posr ; |
---|
[2000] | 154 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 155 | { |
---|
| 156 | if (nSrc_[i]==0) for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 157 | else |
---|
| 158 | { |
---|
| 159 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 160 | for(int l=0; l<sizeT; l++) |
---|
| 161 | { |
---|
| 162 | if (! std::isnan(in[connector_[k]*sizeT+l]) ) |
---|
| 163 | { |
---|
| 164 | if (touched[pos+l]) out[l]=min(out[l],in[connector_[k]*sizeT+l]) ; |
---|
| 165 | else |
---|
| 166 | { |
---|
| 167 | touched[pos+l] = true ; |
---|
| 168 | out[l] = in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 169 | } |
---|
| 170 | } |
---|
| 171 | } |
---|
| 172 | } |
---|
| 173 | } |
---|
| 174 | } |
---|
| 175 | |
---|
| 176 | output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
[2291] | 177 | posr=0 ; |
---|
| 178 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[2000] | 179 | { |
---|
| 180 | const double* in = input; |
---|
| 181 | double* out = output ; |
---|
| 182 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 183 | int pos=posr ; |
---|
[2000] | 184 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 185 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 186 | for(int l=0; l<sizeT; l++) if (!touched[pos+l]) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 187 | } |
---|
| 188 | |
---|
| 189 | } |
---|
| 190 | else |
---|
| 191 | { |
---|
| 192 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice) |
---|
| 193 | { |
---|
| 194 | const double* in = input; |
---|
| 195 | double* out = output ; |
---|
| 196 | int k=0 ; |
---|
| 197 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT) |
---|
| 198 | if (nSrc_[i]==0) |
---|
| 199 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 200 | else |
---|
| 201 | { |
---|
| 202 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 203 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l]=min(out[l],in[connector_[k]*sizeT+l]) ; |
---|
| 204 | } |
---|
| 205 | } |
---|
| 206 | } |
---|
| 207 | } |
---|
| 208 | |
---|
| 209 | void transferMax(int repeat, int sizeT, const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 210 | { |
---|
| 211 | double defaultValue = std::numeric_limits<double>::quiet_NaN(); |
---|
| 212 | |
---|
| 213 | int dstSlice = dstSize_*sizeT ; |
---|
| 214 | int srcSlice = srcSize_*sizeT ; |
---|
| 215 | dataOut.resize(repeat* dstSlice) ; |
---|
| 216 | dataOut=0 ; |
---|
| 217 | |
---|
| 218 | const double* input = dataIn.dataFirst() ; |
---|
| 219 | double* output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
| 220 | |
---|
| 221 | if (detectMissingValue_) |
---|
| 222 | { |
---|
| 223 | vector<bool> touched(repeat* dstSlice, false) ; |
---|
[2291] | 224 | int posr=0 ; |
---|
| 225 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[2000] | 226 | { |
---|
| 227 | const double* in = input; |
---|
| 228 | double* out = output ; |
---|
| 229 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 230 | int pos=posr ; |
---|
[2000] | 231 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 232 | { |
---|
| 233 | if (nSrc_[i]==0) for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 234 | else |
---|
| 235 | { |
---|
| 236 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 237 | for(int l=0; l<sizeT; l++) |
---|
| 238 | { |
---|
| 239 | if (! std::isnan(in[connector_[k]*sizeT+l]) ) |
---|
| 240 | { |
---|
| 241 | if (touched[pos+l]) out[l]=max(out[l],in[connector_[k]*sizeT+l]) ; |
---|
| 242 | else |
---|
| 243 | { |
---|
| 244 | touched[pos+l] = true ; |
---|
| 245 | out[l] = in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 246 | } |
---|
| 247 | } |
---|
| 248 | } |
---|
| 249 | } |
---|
| 250 | } |
---|
| 251 | } |
---|
| 252 | |
---|
| 253 | output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
[2291] | 254 | posr=0 ; |
---|
| 255 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[2000] | 256 | { |
---|
| 257 | const double* in = input; |
---|
| 258 | double* out = output ; |
---|
| 259 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 260 | int pos=posr ; |
---|
[2000] | 261 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 262 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 263 | for(int l=0; l<sizeT; l++) if (!touched[pos+l]) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 264 | } |
---|
| 265 | |
---|
| 266 | } |
---|
| 267 | else |
---|
| 268 | { |
---|
| 269 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice) |
---|
| 270 | { |
---|
| 271 | const double* in = input; |
---|
| 272 | double* out = output ; |
---|
| 273 | int k=0 ; |
---|
| 274 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT) |
---|
| 275 | if (nSrc_[i]==0) |
---|
| 276 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 277 | else |
---|
| 278 | { |
---|
| 279 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 280 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l]=max(out[l],in[connector_[k]*sizeT+l]) ; |
---|
| 281 | } |
---|
| 282 | } |
---|
| 283 | } |
---|
| 284 | } |
---|
| 285 | |
---|
| 286 | void transferAverage(int repeat, int sizeT, const CArray<double,1>& dataIn, CArray<double,1>& dataOut) |
---|
| 287 | { |
---|
| 288 | double defaultValue = std::numeric_limits<double>::quiet_NaN(); |
---|
| 289 | |
---|
| 290 | int dstSlice = dstSize_*sizeT ; |
---|
| 291 | int srcSlice = srcSize_*sizeT ; |
---|
| 292 | dataOut.resize(repeat* dstSlice) ; |
---|
| 293 | dataOut=0 ; |
---|
| 294 | |
---|
| 295 | const double* input = dataIn.dataFirst() ; |
---|
| 296 | double* output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
| 297 | |
---|
| 298 | if (detectMissingValue_) |
---|
| 299 | { |
---|
| 300 | vector<int> touched(repeat* dstSlice, 0) ; |
---|
[2291] | 301 | int posr=0 ; |
---|
| 302 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[2000] | 303 | { |
---|
| 304 | const double* in = input; |
---|
| 305 | double* out = output ; |
---|
| 306 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 307 | int pos=posr ; |
---|
[2000] | 308 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 309 | { |
---|
| 310 | if (nSrc_[i]==0) for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 311 | else |
---|
| 312 | { |
---|
| 313 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 314 | for(int l=0; l<sizeT; l++) |
---|
| 315 | { |
---|
| 316 | if (! std::isnan(in[connector_[k]*sizeT+l]) ) |
---|
| 317 | { |
---|
| 318 | if (touched[pos+l]) out[l] += in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 319 | else |
---|
| 320 | { |
---|
| 321 | out[l] = in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 322 | } |
---|
[2188] | 323 | touched[pos+l]++ ; |
---|
| 324 | |
---|
[2000] | 325 | } |
---|
| 326 | } |
---|
[2188] | 327 | for(int l=0; l<sizeT; l++) { |
---|
| 328 | if (touched[pos+l]!=0) |
---|
| 329 | out[l] /= touched[pos+l]; |
---|
| 330 | } |
---|
| 331 | |
---|
[2000] | 332 | } |
---|
| 333 | } |
---|
| 334 | } |
---|
| 335 | |
---|
| 336 | output = dataOut.dataFirst() ; |
---|
[2291] | 337 | posr=0 ; |
---|
| 338 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice, posr+=dstSlice) |
---|
[2000] | 339 | { |
---|
| 340 | const double* in = input; |
---|
| 341 | double* out = output ; |
---|
| 342 | int k=0 ; |
---|
[2291] | 343 | int pos=posr ; |
---|
[2000] | 344 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT, pos+=sizeT) |
---|
| 345 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 346 | for(int l=0; l<sizeT; l++) |
---|
| 347 | if (touched[pos+l]==0) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 348 | } |
---|
| 349 | |
---|
| 350 | } |
---|
| 351 | else |
---|
| 352 | { |
---|
| 353 | for(int r=0;r<repeat;r++, input+=srcSlice, output+=dstSlice) |
---|
| 354 | { |
---|
| 355 | const double* in = input; |
---|
| 356 | double* out = output ; |
---|
| 357 | int k=0 ; |
---|
| 358 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT) |
---|
| 359 | if (nSrc_[i]==0) |
---|
| 360 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] = defaultValue ; |
---|
| 361 | else |
---|
| 362 | { |
---|
| 363 | for(int j=0 ; j<nSrc_[i] ; j++,k++) |
---|
| 364 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l] += in[connector_[k]*sizeT+l] ; |
---|
| 365 | } |
---|
| 366 | |
---|
| 367 | out = output ; |
---|
| 368 | for(int i=0; i<dstSize_; i++, out+=sizeT) |
---|
| 369 | if (nSrc_[i]!=0) |
---|
| 370 | for(int l=0; l<sizeT; l++) out[l]/=nSrc_[i]; |
---|
| 371 | } |
---|
| 372 | } |
---|
| 373 | } |
---|
[1999] | 374 | |
---|
| 375 | }; |
---|
| 376 | |
---|
| 377 | } |
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