source: XIOS/dev/dev_olga/src/node/field.cpp @ 1144

Last change on this file since 1144 was 1144, checked in by mhnguyen, 7 years ago

Cleaning up some redundant codes

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
  • Property svn:executable set to *
File size: 46.7 KB
RevLine 
[219]1#include "field.hpp"
2
[352]3#include "attribute_template.hpp"
4#include "object_template.hpp"
5#include "group_template.hpp"
[219]6
7#include "node_type.hpp"
8#include "calendar_util.hpp"
[352]9#include "message.hpp"
[591]10#include "xios_spl.hpp"
[352]11#include "type.hpp"
[638]12#include "timer.hpp"
[352]13#include "context_client.hpp"
[586]14#include "context_server.hpp"
[459]15#include <set>
[640]16#include "garbage_collector.hpp"
17#include "source_filter.hpp"
18#include "store_filter.hpp"
19#include "file_writer_filter.hpp"
[641]20#include "pass_through_filter.hpp"
[642]21#include "filter_expr_node.hpp"
22#include "lex_parser.hpp"
[643]23#include "temporal_filter.hpp"
[644]24#include "spatial_transform_filter.hpp"
[1025]25#include "file_server_writer_filter.hpp"
[219]26
[335]27namespace xios{
[509]28
[219]29   /// ////////////////////// Définitions ////////////////////// ///
30
31   CField::CField(void)
32      : CObjectTemplate<CField>(), CFieldAttributes()
33      , grid(), file()
[707]34      , written(false)
[645]35      , nstep(0), nstepMax(0)
36      , hasOutputFile(false)
[1129]37      , domAxisScalarIds_(vector<StdString>(3,""))
38      , areAllReferenceSolved(false), isReferenceSolved(false), isReferenceSolvedAndTransformed(false)
[676]39      , useCompressedOutput(false)
[1021]40      , wasDataAlreadyReceivedFromServer(false)
[957]41   { setVirtualVariableGroup(CVariableGroup::create(getId() + "_virtual_variable_group")); }
[219]42
[562]43   CField::CField(const StdString& id)
[219]44      : CObjectTemplate<CField>(id), CFieldAttributes()
45      , grid(), file()
[707]46      , written(false)
[645]47      , nstep(0), nstepMax(0)
48      , hasOutputFile(false)
[1129]49      , domAxisScalarIds_(vector<StdString>(3,""))
50      , areAllReferenceSolved(false), isReferenceSolved(false), isReferenceSolvedAndTransformed(false)
[676]51      , useCompressedOutput(false)
[1021]52      , wasDataAlreadyReceivedFromServer(false)
[957]53   { setVirtualVariableGroup(CVariableGroup::create(getId() + "_virtual_variable_group")); }
[219]54
55   CField::~CField(void)
[645]56   {}
[509]57
[472]58  //----------------------------------------------------------------
59
60   void CField::setVirtualVariableGroup(CVariableGroup* newVVariableGroup)
[509]61   {
62      this->vVariableGroup = newVVariableGroup;
[472]63   }
[509]64
[472]65   CVariableGroup* CField::getVirtualVariableGroup(void) const
66   {
[562]67      return this->vVariableGroup;
[472]68   }
69
70   std::vector<CVariable*> CField::getAllVariables(void) const
71   {
[562]72      return this->vVariableGroup->getAllChildren();
[472]73   }
[509]74
[562]75   void CField::solveDescInheritance(bool apply, const CAttributeMap* const parent)
[472]76   {
[562]77      SuperClassAttribute::setAttributes(parent, apply);
[472]78      this->getVirtualVariableGroup()->solveDescInheritance(apply, NULL);
79   }
[219]80
[645]81  //----------------------------------------------------------------
[509]82
[598]83  bool CField::dispatchEvent(CEventServer& event)
[300]84  {
[562]85    if (SuperClass::dispatchEvent(event)) return true;
[300]86    else
87    {
88      switch(event.type)
89      {
90        case EVENT_ID_UPDATE_DATA :
[562]91          recvUpdateData(event);
92          return true;
93          break;
[472]94
[598]95        case EVENT_ID_READ_DATA :
96          recvReadDataRequest(event);
97          return true;
98          break;
[509]99
[598]100        case EVENT_ID_READ_DATA_READY :
101          recvReadDataReady(event);
102          return true;
103          break;
[509]104
[598]105        case EVENT_ID_ADD_VARIABLE :
106          recvAddVariable(event);
107          return true;
108          break;
109
110        case EVENT_ID_ADD_VARIABLE_GROUP :
111          recvAddVariableGroup(event);
112          return true;
113          break;
114
[300]115        default :
[562]116          ERROR("bool CField::dispatchEvent(CEventServer& event)", << "Unknown Event");
117          return false;
[300]118      }
119    }
120  }
[509]121
[638]122  void CField::sendUpdateData(const CArray<double,1>& data)
123  {
124    CTimer::get("XIOS Send Data").resume();
125
126    CContext* context = CContext::getCurrent();
[1054]127      CContextClient* client = (!context->hasServer) ? context->client : this->file->getContextClient();
[638]128
[1009]129      CEventClient event(getType(), EVENT_ID_UPDATE_DATA);
130
131      map<int, CArray<int,1> >::iterator it;
132      list<CMessage> list_msg;
133      list<CArray<double,1> > list_data;
134
135      if (!grid->doGridHaveDataDistributed())
136      {
137         if (client->isServerLeader())
138         {
139            for (it = grid->storeIndex_toSrv.begin(); it != grid->storeIndex_toSrv.end(); it++)
140            {
141              int rank = it->first;
142              CArray<int,1>& index = it->second;
143
144              list_msg.push_back(CMessage());
145              list_data.push_back(CArray<double,1>(index.numElements()));
146
147              CArray<double,1>& data_tmp = list_data.back();
148              for (int n = 0; n < data_tmp.numElements(); n++) data_tmp(n) = data(index(n));
149
150              list_msg.back() << getId() << data_tmp;
151              event.push(rank, 1, list_msg.back());
152            }
153            client->sendEvent(event);
154         }
155         else client->sendEvent(event);
156      }
157      else
158      {
159        for (it = grid->storeIndex_toSrv.begin(); it != grid->storeIndex_toSrv.end(); it++)
160        {
161          int rank = it->first;
162          CArray<int,1>& index = it->second;
163
164          list_msg.push_back(CMessage());
165          list_data.push_back(CArray<double,1>(index.numElements()));
166
167          CArray<double,1>& data_tmp = list_data.back();
168          for (int n = 0; n < data_tmp.numElements(); n++) data_tmp(n) = data(index(n));
169
170          list_msg.back() << getId() << data_tmp;
[1099]171          event.push(rank, grid->nbSenders[0][rank], list_msg.back());
[1009]172        }
173        client->sendEvent(event);
[1144]174      }   
[1009]175
176    CTimer::get("XIOS Send Data").suspend();
177  }
178
[300]179  void CField::recvUpdateData(CEventServer& event)
180  {
[1025]181    std::map<int,CBufferIn*> rankBuffers;
[509]182
[562]183    list<CEventServer::SSubEvent>::iterator it;
184    string fieldId;
[219]185
[562]186    for (it = event.subEvents.begin(); it != event.subEvents.end(); ++it)
[300]187    {
[562]188      int rank = it->rank;
189      CBufferIn* buffer = it->buffer;
190      *buffer >> fieldId;
[1025]191      rankBuffers[rank] = buffer;
[300]192    }
[1025]193    get(fieldId)->recvUpdateData(rankBuffers);
[300]194  }
[509]195
[1025]196  void  CField::recvUpdateData(std::map<int,CBufferIn*>& rankBuffers)
[300]197  {
[983]198    CContext* context = CContext::getCurrent();
199
[1025]200    size_t sizeData = 0;
201    if (0 == recvDataSrv.numElements())
[1129]202    {           
203      CArray<int,1>& storeClient = grid->storeIndex_client;
[1025]204
[1136]205      // Gather all data from different clients     
[1129]206      recvDataSrv.resize(storeClient.numElements());
[1025]207      recvFoperationSrv = boost::shared_ptr<func::CFunctor>(new func::CInstant(recvDataSrv));
[300]208    }
209
[1136]210    CArray<double,1> recv_data_tmp(recvDataSrv.numElements());   
[562]211    const CDate& currDate = context->getCalendar()->getCurrentDate();
[1099]212    const CDate opeDate   = last_operation_srv +freq_op + freq_operation_srv - freq_op;
[300]213
214    if (opeDate <= currDate)
215    {
[1136]216      for (map<int, CArray<size_t, 1> >::iterator it = grid->outLocalIndexStoreOnClient.begin(); it != grid->outLocalIndexStoreOnClient.end(); ++it)
[1129]217      {
[1099]218        CArray<double,1> tmp;
219        CArray<size_t,1>& indexTmp = it->second;
[1025]220        *(rankBuffers[it->first]) >> tmp;
[1099]221        for (int idx = 0; idx < indexTmp.numElements(); ++idx)
222        {
223          recv_data_tmp(indexTmp(idx)) = tmp(idx);
[1136]224        }     
[300]225      }
226    }
[509]227
[1025]228    this->setData(recv_data_tmp);
229  }
[509]230
[1025]231  void CField::writeUpdateData(const CArray<double,1>& data)
232  {
233    CContext* context = CContext::getCurrent();
[983]234
[1025]235    const CDate& currDate = context->getCalendar()->getCurrentDate();
236    const CDate opeDate      = last_operation_srv +freq_op + freq_operation_srv - freq_op;
237    const CDate writeDate    = last_Write_srv     + freq_write_srv;
238
239    if (opeDate <= currDate)
[983]240    {
[1025]241      (*recvFoperationSrv)(data);
242      last_operation_srv = currDate;
[983]243    }
[1025]244
245    if (writeDate < (currDate + freq_operation_srv))
[983]246    {
[1025]247      recvFoperationSrv->final();
248      last_Write_srv = writeDate;
[1129]249      grid->computeWrittenIndex();
[562]250      writeField();
[1025]251      lastlast_Write_srv = last_Write_srv;
[300]252    }
[1025]253  }
254 
255//   void  CField::recvUpdateData(vector<int>& ranks, vector<CBufferIn*>& buffers)
256//   {
257//     CContext* context = CContext::getCurrent();
[983]258
[1025]259//     if (data_srv.empty())
260//     {
261//       for (map<int, CArray<size_t, 1> >::iterator it = grid->outIndexFromClient.begin(); it != grid->outIndexFromClient.end(); ++it)
262//       {
263//         int rank = it->first;
264//         data_srv.insert(std::make_pair(rank, CArray<double,1>(it->second.numElements())));
265//         foperation_srv.insert(pair<int,boost::shared_ptr<func::CFunctor> >(rank,boost::shared_ptr<func::CFunctor>(new func::CInstant(data_srv[rank]))));
266//       }
267//     }
[983]268
[1025]269//     const CDate& currDate = context->getCalendar()->getCurrentDate();
270//     const CDate opeDate      = last_operation_srv +freq_op + freq_operation_srv - freq_op;
271//     const CDate writeDate    = last_Write_srv     + freq_write_srv;
[509]272
[1025]273//     if (opeDate <= currDate)
274//     {
275//       for (int n = 0; n < ranks.size(); n++)
276//       {
277//         CArray<double,1> data_tmp;
278//         *buffers[n] >> data_tmp;
279//         (*foperation_srv[ranks[n]])(data_tmp);
280//       }
281//       last_operation_srv = currDate;
282//     }
283
284//     if (writeDate < (currDate + freq_operation_srv))
285//     {
286//       for (int n = 0; n < ranks.size(); n++)
287//       {
288//         this->foperation_srv[ranks[n]]->final();
289//       }
290
291//       last_Write_srv = writeDate;
292//     }
293
294//     if (context->hasClient && context->hasServer)
295//     {
296//       size_t writtenSize;
297// //      if (field->getUseCompressedOutput())
298// //        writtenSize = grid->getNumberWrittenIndexes();
299// //      else
300//         writtenSize = grid->getWrittenDataSize();
301
302//       CArray<double,1> fieldData(writtenSize);
303// //      if (!field->default_value.isEmpty()) fieldData = field->default_value;
304
305// //      if (field->getUseCompressedOutput())
306// //        field->outputCompressedField(fieldData);
307// //      else
308//         this->outputField(fieldData);
309//       sendUpdateData(fieldData);
310//     }
311//     if (!context->hasClient && context->hasServer)
312//     {
313//       writeField();
314//     }
315
316//     lastlast_Write_srv = last_Write_srv;
317
318//   }
319
[300]320  void CField::writeField(void)
321  {
[562]322    if (!getRelFile()->allDomainEmpty)
[586]323    {
[599]324      if (grid->doGridHaveDataToWrite() || getRelFile()->type == CFile::type_attr::one_file)
[379]325      {
[1136]326        getRelFile()->checkWriteFile();
[379]327        this->incrementNStep();
328        getRelFile()->getDataOutput()->writeFieldData(CField::get(this));
329      }
[586]330    }
[300]331  }
[562]332
[1021]333  void CField::sendReadDataRequest(const CDate& tsDataRequested)
[598]334  {
335    CContext* context = CContext::getCurrent();
[1071]336    CContextClient* client = (!context->hasServer) ? context->client : this->file->getContextClient();
[598]337
[1071]338
[1021]339    lastDataRequestedFromServer = tsDataRequested;
[708]340
[598]341    CEventClient event(getType(), EVENT_ID_READ_DATA);
342    if (client->isServerLeader())
343    {
344      CMessage msg;
345      msg << getId();
346      const std::list<int>& ranks = client->getRanksServerLeader();
347      for (std::list<int>::const_iterator itRank = ranks.begin(), itRankEnd = ranks.end(); itRank != itRankEnd; ++itRank)
348        event.push(*itRank, 1, msg);
349      client->sendEvent(event);
350    }
351    else client->sendEvent(event);
352  }
353
354  /*!
355  Send request new data read from file if need be, that is the current data is out-of-date.
356  \return true if and only if some data was requested
357  */
358  bool CField::sendReadDataRequestIfNeeded(void)
359  {
360    const CDate& currentDate = CContext::getCurrent()->getCalendar()->getCurrentDate();
361
[1021]362    bool dataRequested = false;
363    while (currentDate >= lastDataRequestedFromServer)
[850]364    {
[1021]365      info(20) << "currentDate : " << currentDate << endl ;
366      info(20) << "lastDataRequestedFromServer : " << lastDataRequestedFromServer << endl ;
367      info(20) << "file->output_freq.getValue() : " << file->output_freq.getValue() << endl ;
368      info(20) << "lastDataRequestedFromServer + file->output_freq.getValue() : " << lastDataRequestedFromServer + file->output_freq << endl ;
[873]369
[1021]370      sendReadDataRequest(lastDataRequestedFromServer + file->output_freq);
371
372      dataRequested = true;
[850]373    }
[1021]374    return dataRequested;
[598]375  }
376
377  void CField::recvReadDataRequest(CEventServer& event)
378  {
379    CBufferIn* buffer = event.subEvents.begin()->buffer;
380    StdString fieldId;
381    *buffer >> fieldId;
382    get(fieldId)->recvReadDataRequest();
383  }
384
385  void CField::recvReadDataRequest(void)
386  {
387    CContext* context = CContext::getCurrent();
[1136]388    CContextClient* client = context->client;   
[598]389
390    CEventClient event(getType(), EVENT_ID_READ_DATA_READY);
391    std::list<CMessage> msgs;
392
[599]393    bool hasData = readField();
[598]394
[1136]395   
[1021]396    if (!grid->doGridHaveDataDistributed())
[598]397    {
[1021]398       if (client->isServerLeader())
399       {
[1136]400          if (0 != recvDataSrv.numElements())
401          {           
[1021]402            const std::list<int>& ranks = client->getRanksServerLeader();
403            for (std::list<int>::const_iterator itRank = ranks.begin(), itRankEnd = ranks.end(); itRank != itRankEnd; ++itRank)
404            {
405              msgs.push_back(CMessage());
406              CMessage& msg = msgs.back();
407              msg << getId();
408              if (hasData)
[1136]409                msg << getNStep() - 1 << recvDataSrv;
[1021]410              else
411                msg << int(-1);
412              event.push(*itRank, 1, msg);
413            }
414          }
[1136]415
[1021]416          client->sendEvent(event);
417       }
418       else
419       {
420          client->sendEvent(event);
421       }
[598]422    }
[1021]423    else
424    {
[1136]425      for (map<int, CArray<size_t, 1> >::iterator it = grid->outLocalIndexStoreOnClient.begin(); 
426                                                  it != grid->outLocalIndexStoreOnClient.end(); ++it)
[1021]427      {
[1136]428        CArray<size_t,1>& indexTmp = it->second;
429        CArray<double,1> tmp(indexTmp.numElements());
430        for (int idx = 0; idx < indexTmp.numElements(); ++idx)
431        {
432          tmp(idx) = recvDataSrv(indexTmp(idx));
433        } 
434
[1021]435        msgs.push_back(CMessage());
436        CMessage& msg = msgs.back();
437        msg << getId();
438        if (hasData)
[1136]439          msg << getNStep() - 1 << tmp;
[1021]440        else
441          msg << int(-1);
[1136]442        event.push(it->first, grid->nbReadSenders[0][it->first], msg);
[1021]443      }
444      client->sendEvent(event);
445    }
[599]446  }
[598]447
[599]448  bool CField::readField(void)
449  {
[1136]450    grid->computeWrittenIndex();
[599]451    if (!getRelFile()->allDomainEmpty)
452    {
453      if (grid->doGridHaveDataToWrite() || getRelFile()->type == CFile::type_attr::one_file)
454      {
[1136]455        if (0 == recvDataSrv.numElements())
456        {           
457          CArray<int,1>& storeClient = grid->storeIndex_client;         
458          recvDataSrv.resize(storeClient.numElements());         
[599]459        }
460
[1136]461        getRelFile()->checkReadFile();
[599]462        if (!nstepMax)
463        {
464          nstepMax = getRelFile()->getDataInput()->getFieldNbRecords(CField::get(this));
465        }
[873]466
[850]467        this->incrementNStep();
[599]468
[850]469        if (getNStep() > nstepMax && (getRelFile()->cyclic.isEmpty() || !getRelFile()->cyclic) )
[599]470          return false;
471
472        getRelFile()->getDataInput()->readFieldData(CField::get(this));
473      }
474    }
475
476    return true;
[598]477  }
478
479  void CField::recvReadDataReady(CEventServer& event)
480  {
481    string fieldId;
482    vector<int> ranks;
483    vector<CBufferIn*> buffers;
484
485    list<CEventServer::SSubEvent>::iterator it;
486    for (it = event.subEvents.begin(); it != event.subEvents.end(); ++it)
487    {
488      ranks.push_back(it->rank);
489      CBufferIn* buffer = it->buffer;
490      *buffer >> fieldId;
491      buffers.push_back(buffer);
492    }
493    get(fieldId)->recvReadDataReady(ranks, buffers);
494  }
495
496  void CField::recvReadDataReady(vector<int> ranks, vector<CBufferIn*> buffers)
497  {
498    CContext* context = CContext::getCurrent();
[959]499    int record;
[640]500    std::map<int, CArray<double,1> > data;
501
[645]502    bool isEOF = false;
503
[598]504    for (int i = 0; i < ranks.size(); i++)
505    {
506      int rank = ranks[i];
[599]507      *buffers[i] >> record;
[959]508      isEOF = (record == int(-1));
[598]509
[599]510      if (!isEOF)
[640]511        *buffers[i] >> data[rank];
512      else
513        break;
514    }
515
[1021]516    if (wasDataAlreadyReceivedFromServer)
517      lastDataReceivedFromServer = lastDataReceivedFromServer + file->output_freq;
518    else
519    {
520      lastDataReceivedFromServer = context->getCalendar()->getInitDate();
521      wasDataAlreadyReceivedFromServer = true;
522    }
523
[640]524    if (isEOF)
[1021]525      serverSourceFilter->signalEndOfStream(lastDataReceivedFromServer);
[640]526    else
[1021]527      serverSourceFilter->streamDataFromServer(lastDataReceivedFromServer, data);
[598]528  }
529
[219]530   //----------------------------------------------------------------
531
[347]532   void CField::setRelFile(CFile* _file)
[509]533   {
[459]534      this->file = _file;
[562]535      hasOutputFile = true;
[219]536   }
537
538   //----------------------------------------------------------------
539
[562]540   StdString CField::GetName(void)    { return StdString("field"); }
541   StdString CField::GetDefName(void) { return CField::GetName(); }
542   ENodeType CField::GetType(void)    { return eField; }
[219]543
544   //----------------------------------------------------------------
545
[347]546   CGrid* CField::getRelGrid(void) const
[509]547   {
[562]548      return this->grid;
[219]549   }
550
551   //----------------------------------------------------------------
552
[347]553   CFile* CField::getRelFile(void) const
[509]554   {
[562]555      return this->file;
[219]556   }
[509]557
[952]558   int CField::getNStep(void) const
[266]559   {
[562]560      return this->nstep;
[266]561   }
[509]562
[645]563   func::CFunctor::ETimeType CField::getOperationTimeType() const
564   {
565     return operationTimeType;
566   }
567
568   //----------------------------------------------------------------
569
[266]570   void CField::incrementNStep(void)
571   {
572      this->nstep++;
573   }
[509]574
[952]575   void CField::resetNStep(int nstep /*= 0*/)
[321]576   {
[707]577      this->nstep = nstep;
[321]578   }
[219]579
[599]580   void CField::resetNStepMax(void)
581   {
582      this->nstepMax = 0;
583   }
584
[219]585   //----------------------------------------------------------------
586
[310]587   bool CField::isActive(void) const
[509]588   {
[767]589      return (instantDataFilter != NULL);
[310]590   }
[562]591
[219]592   //----------------------------------------------------------------
[509]593
[707]594   bool CField::wasWritten() const
595   {
596     return written;
597   }
598
599   void CField::setWritten()
600   {
601     written = true;
602   }
603
604   //----------------------------------------------------------------
605
[676]606   bool CField::getUseCompressedOutput() const
607   {
608     return useCompressedOutput;
609   }
610
611   void CField::setUseCompressedOutput()
612   {
613     useCompressedOutput = true;
614   }
615
616   //----------------------------------------------------------------
617
[641]618   boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getInstantDataFilter()
619   {
620     return instantDataFilter;
621   }
622
623   //----------------------------------------------------------------
624
[823]625   /*!
626     Build up graph of grids which plays role of destination and source in grid transformation
627     This function should be called before \func solveGridReference()
628   */
629   void CField::buildGridTransformationGraph()
630   {
631     CContext* context = CContext::getCurrent();
[983]632     if (context->hasClient && !context->hasServer)
[687]633     {
[823]634       if (grid && !grid->isTransformed() && hasDirectFieldReference() && grid != getDirectFieldReference()->grid)
635       {
636         grid->addTransGridSource(getDirectFieldReference()->grid);
637       }
[687]638     }
[823]639   }
[687]640
[823]641   /*!
642     Generate a new grid destination if there are more than one grid source pointing to a same grid destination
643   */
644   void CField::generateNewTransformationGridDest()
645   {
646     CContext* context = CContext::getCurrent();
[983]647     if (context->hasClient && !context->hasServer)
[823]648     {
649       std::map<CGrid*,std::pair<bool,StdString> >& gridSrcMap = grid->getTransGridSource();
650       if (1 < gridSrcMap.size())
651       {
652         // Search for grid source
653         CGrid* gridSrc = grid;
654         CField* currField = this;
655         std::vector<CField*> hieraField;
[687]656
[823]657         while (currField->hasDirectFieldReference() && (gridSrc == grid))
658         {
659           hieraField.push_back(currField);
660           CField* tmp = currField->getDirectFieldReference();
661           currField = tmp;
662           gridSrc = currField->grid;
663         }
664
665         if (gridSrcMap.end() != gridSrcMap.find(gridSrc))
666         {
667           CGrid* gridTmp;
668           std::pair<bool,StdString> newGridDest = gridSrcMap[gridSrc];
669           if (newGridDest.first)
670           {
671             StdString newIdGridDest = newGridDest.second;
672             if (!CGrid::has(newIdGridDest))
673             {
674                ERROR("CGrid* CGrid::generateNewTransformationGridDest()",
675                  << " Something wrong happened! Grid whose id " << newIdGridDest
676                  << "should exist ");
677             }
678             gridTmp = CGrid::get(newIdGridDest);
679           }
680           else
681           {
682             StdString newIdGridDest = CGrid::generateId(gridSrc, grid);
683             gridTmp = CGrid::cloneGrid(newIdGridDest, grid);
684
685             (gridSrcMap[gridSrc]).first = true;
686             (gridSrcMap[gridSrc]).second = newIdGridDest;
687           }
688
689           // Update all descendants
690           for (std::vector<CField*>::iterator it = hieraField.begin(); it != hieraField.end(); ++it)
691           {
692             (*it)->grid = gridTmp;
693             (*it)->updateRef((*it)->grid);
694           }
695         }
696       }
697     }
698   }
699
700   void CField::updateRef(CGrid* grid)
701   {
702     if (!grid_ref.isEmpty()) grid_ref.setValue(grid->getId());
703     else
704     {
705       std::vector<CAxis*> axisTmp = grid->getAxis();
706       std::vector<CDomain*> domainTmp = grid->getDomains();
707       if ((1<axisTmp.size()) || (1<domainTmp.size()))
708         ERROR("void CField::updateRef(CGrid* grid)",
709           << "More than one domain or axis is available for domain_ref/axis_ref of field " << this->getId());
710
711       if ((!domain_ref.isEmpty()) && (domainTmp.empty()))
712         ERROR("void CField::updateRef(CGrid* grid)",
713           << "Incoherent between available domain and domain_ref of field " << this->getId());
714       if ((!axis_ref.isEmpty()) && (axisTmp.empty()))
715         ERROR("void CField::updateRef(CGrid* grid)",
716           << "Incoherent between available axis and axis_ref of field " << this->getId());
717
718       if (!domain_ref.isEmpty()) domain_ref.setValue(domainTmp[0]->getId());
719       if (!axis_ref.isEmpty()) axis_ref.setValue(axisTmp[0]->getId());
720     }
721   }
[1025]722   
[1129]723   /*!
724     Solve reference of all enabled fields even the source fields .
725     In this step, we do transformations.
726   */
727   void CField::solveAllEnabledFieldsAndTransform()
[1025]728   {
729     CContext* context = CContext::getCurrent();
730     bool hasClient = context->hasClient;
731     bool hasServer = context->hasServer;
[823]732
[1129]733     if (!isReferenceSolvedAndTransformed)
[1025]734     {
[1129]735        isReferenceSolvedAndTransformed = true;
[1025]736
737        if (hasClient && !hasServer)
738        {
739          solveRefInheritance(true);
[1129]740          if (hasDirectFieldReference()) getDirectFieldReference()->solveAllEnabledFieldsAndTransform();
[1025]741        }
742
743        if (hasServer)
744          solveServerOperation();
745
746        solveGridReference();
747
748        if (hasClient && !hasServer)
749       {
750         solveGenerateGrid();
751         buildGridTransformationGraph();
752       }
753
754       solveGridDomainAxisRef(false);
755
756       if (hasClient && !hasServer)
757       {
758         solveTransformedGrid();
759       }
760
761       solveGridDomainAxisRef(false);
762     }
763   }
764
765   void CField::checkGridOfEnabledFields()
766   {
767      solveCheckMaskIndex(false);
768   }
769
770   void CField::sendGridOfEnabledFields()
771   {
772      solveGridDomainAxisRef(true);
773      solveCheckMaskIndex(true);
774   }
775
776
777    void CField::solveOnlyReferenceEnabledField(bool doSending2Server)
778   {
779     CContext* context = CContext::getCurrent();
780     if (!isReferenceSolved)
781     {
782        isReferenceSolved = true;
783
784        if (context->hasClient && !context->hasServer)
785        {
786          solveRefInheritance(true);
787          if (hasDirectFieldReference()) getDirectFieldReference()->solveOnlyReferenceEnabledField(false);
788        }
[1144]789
[1025]790        if (context->hasServer)
791          solveServerOperation();
792
793        solveGridReference();
794
795        if (context->hasClient && !context->hasServer)
796       {
797         solveGenerateGrid();
798         buildGridTransformationGraph();
799       }
800     }
801   }
802     
[823]803   void CField::solveAllReferenceEnabledField(bool doSending2Server)
804   {
805     CContext* context = CContext::getCurrent();
806     solveOnlyReferenceEnabledField(doSending2Server);
807
808     if (!areAllReferenceSolved)
809     {
810        areAllReferenceSolved = true;
[1144]811       
[983]812        if (context->hasClient && !context->hasServer)
[823]813        {
814          solveRefInheritance(true);
815          if (hasDirectFieldReference()) getDirectFieldReference()->solveAllReferenceEnabledField(false);
816        }
[1144]817       else if (context->hasServer)       
[823]818          solveServerOperation();
819
820        solveGridReference();
821     }
822
823     solveGridDomainAxisRef(doSending2Server);
824
[1021]825     if (context->hasClient && !context->hasServer)
[619]826     {
827       solveTransformedGrid();
828     }
[687]829
[823]830     solveCheckMaskIndex(doSending2Server);
[509]831   }
832
[731]833   std::map<int, StdSize> CField::getGridAttributesBufferSize()
[509]834   {
[731]835     return grid->getAttributesBufferSize();
[509]836   }
837
[1099]838   std::vector<std::map<int, StdSize> > CField::getGridDataBufferSize()
[731]839   {
840     return grid->getDataBufferSize(getId());
841   }
842
[219]843   //----------------------------------------------------------------
844
[645]845   void CField::solveServerOperation(void)
[219]846   {
[640]847      CContext* context = CContext::getCurrent();
[509]848
[640]849      if (!context->hasServer || !hasOutputFile) return;
850
[645]851      if (freq_op.isEmpty())
852        freq_op.setValue(TimeStep);
[509]853
[538]854      if (freq_offset.isEmpty())
855        freq_offset.setValue(NoneDu);
[219]856
[645]857      freq_operation_srv = file->output_freq.getValue();
858      freq_write_srv     = file->output_freq.getValue();
[509]859
[651]860      lastlast_Write_srv = context->getCalendar()->getInitDate();
861      last_Write_srv     = context->getCalendar()->getInitDate();
862      last_operation_srv = context->getCalendar()->getInitDate();
[509]863
[645]864      const CDuration toffset = freq_operation_srv - freq_offset.getValue() - context->getCalendar()->getTimeStep();
[651]865      last_operation_srv     = last_operation_srv - toffset;
[509]866
[645]867      if (operation.isEmpty())
868        ERROR("void CField::solveServerOperation(void)",
869              << "An operation must be defined for field \"" << getId() << "\".");
[509]870
[645]871      boost::shared_ptr<func::CFunctor> functor;
872      CArray<double, 1> dummyData;
[598]873
[562]874#define DECLARE_FUNCTOR(MType, mtype) \
[645]875      if (operation.getValue().compare(#mtype) == 0) \
[470]876      { \
[645]877        functor.reset(new func::C##MType(dummyData)); \
878      }
[509]879
[219]880#include "functor_type.conf"
[509]881
[645]882      if (!functor)
883        ERROR("void CField::solveServerOperation(void)",
884              << "\"" << operation << "\" is not a valid operation.");
885
886      operationTimeType = functor->timeType();
[219]887   }
[509]888
[219]889   //----------------------------------------------------------------
[640]890
891   /*!
892    * Constructs the graph filter for the field, enabling or not the data output.
893    * This method should not be called more than once with enableOutput equal to true.
894    *
895    * \param gc the garbage collector to use when building the filter graph
896    * \param enableOutput must be true when the field data is to be
897    *                     read by the client or/and written to a file
898    */
899   void CField::buildFilterGraph(CGarbageCollector& gc, bool enableOutput)
[1144]900   {     
[1129]901    if (!isReferenceSolvedAndTransformed) solveAllEnabledFieldsAndTransform();
[1025]902     CContext* context = CContext::getCurrent();
903     bool hasWriterServer = context->hasServer && !context->hasClient;
904     bool hasIntermediateServer = context->hasServer && context->hasClient;
[641]905
[1025]906     if (hasWriterServer)
[640]907     {
[1025]908        if (!instantDataFilter)
[1027]909          instantDataFilter = clientSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(gc, grid));
[1025]910
911             // If the field data is to be read by the client or/and written to a file
912       if (enableOutput && !storeFilter && !fileWriterFilter)
913       {
914         if (file && (file->mode.isEmpty() || file->mode == CFile::mode_attr::write))
915         {
916           fileServerWriterFilter = boost::shared_ptr<CFileServerWriterFilter>(new CFileServerWriterFilter(gc, this));
917           instantDataFilter->connectOutput(fileServerWriterFilter, 0);
918         }
919       }
920     }
921     else if (hasIntermediateServer)
922     {
923       if (!instantDataFilter)
[1027]924         instantDataFilter = clientSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(gc, grid));
[1025]925
926             // If the field data is to be read by the client or/and written to a file
927       if (enableOutput && !storeFilter && !fileWriterFilter)
928       {
929         if (file && (file->mode.isEmpty() || file->mode == CFile::mode_attr::write))
930         {
931           fileWriterFilter = boost::shared_ptr<CFileWriterFilter>(new CFileWriterFilter(gc, this));
932           instantDataFilter->connectOutput(fileWriterFilter, 0);
933         }
934       }
935     }
936     else
937     {
938       // Start by building a filter which can provide the field's instant data
939       if (!instantDataFilter)
940       {
941         // Check if we have an expression to parse
[1021]942       if (hasExpression())
[1025]943         {
[1021]944         boost::scoped_ptr<IFilterExprNode> expr(parseExpr(getExpression() + '\0'));
945         boost::shared_ptr<COutputPin> filter = expr->reduce(gc, *this);
946
947         // Check if a spatial transformation is needed
948         if (!field_ref.isEmpty())
949         {
950           CGrid* gridRef = CField::get(field_ref)->grid;
951
952           if (grid && grid != gridRef && grid->hasTransform())
953           {
954             double defaultValue = !default_value.isEmpty() ? default_value : 0.0;
955             std::pair<boost::shared_ptr<CFilter>, boost::shared_ptr<CFilter> > filters = CSpatialTransformFilter::buildFilterGraph(gc, gridRef, grid, defaultValue);
956
957             filter->connectOutput(filters.first, 0);
958             filter = filters.second;
959           }
960         }
961
962         instantDataFilter = filter;
[1025]963         }
964         // Check if we have a reference on another field
965         else if (!field_ref.isEmpty())
966           instantDataFilter = getFieldReference(gc);
967         // Check if the data is to be read from a file
968         else if (file && !file->mode.isEmpty() && file->mode == CFile::mode_attr::read)
[1021]969         instantDataFilter = serverSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(gc, grid,
970                                                                                                     freq_offset.isEmpty() ? NoneDu : freq_offset,
971                                                                                                     true));
[1025]972         else // The data might be passed from the model
[1021]973         instantDataFilter = clientSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(gc, grid));
[1025]974       }
[640]975
[1025]976       // If the field data is to be read by the client or/and written to a file
977       if (enableOutput && !storeFilter && !fileWriterFilter)
[640]978       {
[1025]979         if (!read_access.isEmpty() && read_access)
980         {
981           storeFilter = boost::shared_ptr<CStoreFilter>(new CStoreFilter(gc, CContext::getCurrent(), grid));
982           instantDataFilter->connectOutput(storeFilter, 0);
983         }
[640]984
[1025]985         if (file && (file->mode.isEmpty() || file->mode == CFile::mode_attr::write))
986         {
987           fileWriterFilter = boost::shared_ptr<CFileWriterFilter>(new CFileWriterFilter(gc, this));
988           getTemporalDataFilter(gc, file->output_freq)->connectOutput(fileWriterFilter, 0);
989         }
[640]990       }
991     }
992   }
993
[1021]994
[642]995   /*!
[737]996    * Returns the filter needed to handle the field reference.
997    * This method should only be called when building the filter graph corresponding to the field.
998    *
999    * \param gc the garbage collector to use
1000    * \return the output pin corresponding to the field reference
1001    */
[1021]1002     boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getFieldReference(CGarbageCollector& gc)
1003     {
1004       if (instantDataFilter || field_ref.isEmpty())
1005         ERROR("COutputPin* CField::getFieldReference(CGarbageCollector& gc)",
1006               "Impossible to get the field reference for a field which has already been parsed or which does not have a field_ref.");
[737]1007
[1021]1008       CField* fieldRef = CField::get(field_ref);
1009       fieldRef->buildFilterGraph(gc, false);
[737]1010
[1021]1011       std::pair<boost::shared_ptr<CFilter>, boost::shared_ptr<CFilter> > filters;
1012       // Check if a spatial transformation is needed
1013       if (grid && grid != fieldRef->grid && grid->hasTransform())
1014       {
1015         double defaultValue = !default_value.isEmpty() ? default_value : 0.0;
1016         filters = CSpatialTransformFilter::buildFilterGraph(gc, fieldRef->grid, grid, defaultValue);
1017       }
1018       else
1019         filters.first = filters.second = boost::shared_ptr<CFilter>(new CPassThroughFilter(gc));
[873]1020
[1021]1021       fieldRef->getInstantDataFilter()->connectOutput(filters.first, 0);
[737]1022
[1021]1023       return filters.second;
1024     }
[737]1025
1026   /*!
1027    * Returns the filter needed to handle a self reference in the field's expression.
1028    * If the needed filter does not exist, it is created, otherwise it is reused.
[642]1029    * This method should only be called when building the filter graph corresponding
1030    * to the field's expression.
1031    *
1032    * \param gc the garbage collector to use
1033    * \return the output pin corresponding to a self reference
1034    */
1035   boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getSelfReference(CGarbageCollector& gc)
1036   {
[1021]1037     if (instantDataFilter || !hasExpression())
[642]1038       ERROR("COutputPin* CField::getSelfReference(CGarbageCollector& gc)",
1039             "Impossible to add a self reference to a field which has already been parsed or which does not have an expression.");
1040
[737]1041     if (!selfReferenceFilter)
1042     {
[741]1043       if (file && !file->mode.isEmpty() && file->mode == CFile::mode_attr::read)
1044       {
1045         if (!serverSourceFilter)
[1021]1046           serverSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(gc, grid,
1047                                                                                   freq_offset.isEmpty() ? NoneDu : freq_offset,
1048                                                                                   true));
[741]1049         selfReferenceFilter = serverSourceFilter;
1050       }
1051       else if (!field_ref.isEmpty())
[1021]1052       {
1053         CField* fieldRef = CField::get(field_ref);
1054         fieldRef->buildFilterGraph(gc, false);
1055         selfReferenceFilter = fieldRef->getInstantDataFilter();
1056       }
[737]1057       else
1058       {
1059         if (!clientSourceFilter)
[1021]1060           clientSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(gc, grid));
[642]1061
[737]1062         selfReferenceFilter = clientSourceFilter;
1063       }
1064     }
1065
1066     return selfReferenceFilter;
[642]1067   }
1068
[643]1069   /*!
1070    * Returns the temporal filter corresponding to the field's temporal operation
1071    * for the specified operation frequency. The filter is created if it does not
1072    * exist, otherwise it is reused.
1073    *
1074    * \param gc the garbage collector to use
1075    * \param outFreq the operation frequency, i.e. the frequency at which the output data will be computed
1076    * \return the output pin corresponding to the requested temporal filter
1077    */
1078   boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getTemporalDataFilter(CGarbageCollector& gc, CDuration outFreq)
1079   {
1080     std::map<CDuration, boost::shared_ptr<COutputPin> >::iterator it = temporalDataFilters.find(outFreq);
1081
1082     if (it == temporalDataFilters.end())
1083     {
1084       if (operation.isEmpty())
1085         ERROR("void CField::getTemporalDataFilter(CGarbageCollector& gc, CDuration outFreq)",
1086               << "An operation must be defined for field \"" << getId() << "\".");
1087
1088       if (freq_op.isEmpty())
1089         freq_op.setValue(TimeStep);
1090       if (freq_offset.isEmpty())
1091         freq_offset.setValue(NoneDu);
1092
1093       const bool ignoreMissingValue = (!detect_missing_value.isEmpty() && !default_value.isEmpty() && detect_missing_value == true);
1094
1095       boost::shared_ptr<CTemporalFilter> temporalFilter(new CTemporalFilter(gc, operation,
1096                                                                             CContext::getCurrent()->getCalendar()->getInitDate(),
1097                                                                             freq_op, freq_offset, outFreq,
1098                                                                             ignoreMissingValue, ignoreMissingValue ? default_value : 0.0));
1099       instantDataFilter->connectOutput(temporalFilter, 0);
1100
1101       it = temporalDataFilters.insert(std::make_pair(outFreq, temporalFilter)).first;
1102     }
1103
1104     return it->second;
1105   }
1106
[640]1107   //----------------------------------------------------------------
[369]1108/*
[562]1109   void CField::fromBinary(StdIStream& is)
[219]1110   {
1111      SuperClass::fromBinary(is);
1112#define CLEAR_ATT(name_)\
[369]1113      SuperClassAttribute::operator[](#name_)->reset()
[219]1114
1115         CLEAR_ATT(domain_ref);
1116         CLEAR_ATT(axis_ref);
1117#undef CLEAR_ATT
1118
1119   }
[369]1120*/
[219]1121   //----------------------------------------------------------------
1122
1123   void CField::solveGridReference(void)
1124   {
[887]1125      if (grid_ref.isEmpty() && domain_ref.isEmpty() && axis_ref.isEmpty() && scalar_ref.isEmpty())
[742]1126      {
1127        ERROR("CField::solveGridReference(void)",
[770]1128              << "A grid must be defined for field '" << getFieldOutputName() << "' .");
[742]1129      }
[887]1130      else if (!grid_ref.isEmpty() && (!domain_ref.isEmpty() || !axis_ref.isEmpty() || !scalar_ref.isEmpty()))
[219]1131      {
[744]1132        ERROR("CField::solveGridReference(void)",
[887]1133              << "Field '" << getFieldOutputName() << "' has both a grid and a domain/axis/scalar." << std::endl
1134              << "Please define either 'grid_ref' or 'domain_ref'/'axis_ref'/'scalar_ref'.");
[219]1135      }
1136
[744]1137      if (grid_ref.isEmpty())
[219]1138      {
[744]1139        std::vector<CDomain*> vecDom;
1140        std::vector<CAxis*> vecAxis;
[887]1141        std::vector<CScalar*> vecScalar;
[894]1142        std::vector<int> axisDomainOrderTmp;
1143       
[744]1144        if (!domain_ref.isEmpty())
1145        {
[823]1146          StdString tmp = domain_ref.getValue();
[744]1147          if (CDomain::has(domain_ref))
[894]1148          {
[744]1149            vecDom.push_back(CDomain::get(domain_ref));
[894]1150            axisDomainOrderTmp.push_back(2);
1151          }
[744]1152          else
[219]1153            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
[744]1154                  << "Invalid reference to domain '" << domain_ref.getValue() << "'.");
1155        }
[219]1156
[744]1157        if (!axis_ref.isEmpty())
[742]1158        {
[744]1159          if (CAxis::has(axis_ref))
[894]1160          {
[744]1161            vecAxis.push_back(CAxis::get(axis_ref));
[894]1162            axisDomainOrderTmp.push_back(1);
1163          }
[744]1164          else
1165            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
1166                  << "Invalid reference to axis '" << axis_ref.getValue() << "'.");
[742]1167        }
[744]1168
[887]1169        if (!scalar_ref.isEmpty())
1170        {
1171          if (CScalar::has(scalar_ref))
[894]1172          {
[887]1173            vecScalar.push_back(CScalar::get(scalar_ref));
[894]1174            axisDomainOrderTmp.push_back(0);
1175          }
[887]1176          else
1177            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
1178                  << "Invalid reference to scalar '" << scalar_ref.getValue() << "'.");
1179        }
[894]1180       
1181        CArray<int,1> axisDomainOrder(axisDomainOrderTmp.size());
1182        for (int idx = 0; idx < axisDomainOrderTmp.size(); ++idx)
1183        {
1184          axisDomainOrder(idx) = axisDomainOrderTmp[idx];
1185        }
[887]1186
[745]1187        // Warning: the gridId shouldn't be set as the grid_ref since it could be inherited
[894]1188        StdString gridId = CGrid::generateId(vecDom, vecAxis, vecScalar,axisDomainOrder);
[745]1189        if (CGrid::has(gridId))
1190          this->grid = CGrid::get(gridId);
1191        else
[894]1192          this->grid = CGrid::createGrid(gridId, vecDom, vecAxis, vecScalar,axisDomainOrder);
[219]1193      }
[586]1194      else
1195      {
[744]1196        if (CGrid::has(grid_ref))
1197          this->grid = CGrid::get(grid_ref);
1198        else
1199          ERROR("CField::solveGridReference(void)",
1200                << "Invalid reference to grid '" << grid_ref.getValue() << "'.");
[586]1201      }
[509]1202   }
[459]1203
[509]1204   void CField::solveGridDomainAxisRef(bool checkAtt)
1205   {
1206     grid->solveDomainAxisRef(checkAtt);
[219]1207   }
1208
[509]1209   void CField::solveCheckMaskIndex(bool doSendingIndex)
1210   {
1211     grid->checkMaskIndex(doSendingIndex);
1212   }
[219]1213
[619]1214   void CField::solveTransformedGrid()
1215   {
[746]1216     if (grid && !grid->isTransformed() && hasDirectFieldReference() && grid != getDirectFieldReference()->grid)
[790]1217     {
1218       std::vector<CGrid*> grids;
1219       // Source grid
1220       grids.push_back(getDirectFieldReference()->grid);
1221       // Intermediate grids
1222       if (!grid_path.isEmpty())
1223       {
1224         std::string gridId;
1225         size_t start = 0, end;
1226
1227         do
1228         {
1229           end = grid_path.getValue().find(',', start);
1230           if (end != std::string::npos)
1231           {
1232             gridId = grid_path.getValue().substr(start, end - start);
1233             start = end + 1;
1234           }
1235           else
1236             gridId = grid_path.getValue().substr(start);
1237
1238           if (!CGrid::has(gridId))
1239             ERROR("void CField::solveTransformedGrid()",
1240                   << "Invalid grid_path, the grid '" << gridId << "' does not exist.");
1241
1242           grids.push_back(CGrid::get(gridId));
1243         }
1244         while (end != std::string::npos);
1245       }
1246       // Destination grid
1247       grids.push_back(grid);
1248
1249       for (size_t i = 0, count = grids.size() - 1; i < count; ++i)
1250       {
1251         CGrid *gridSrc  = grids[i];
1252         CGrid *gridDest = grids[i + 1];
1253         if (!gridDest->isTransformed())
1254           gridDest->transformGrid(gridSrc);
1255       }
1256     }
[934]1257     else if (grid && grid->hasTransform() && !grid->isTransformed())
1258     {
[1021]1259       // Temporarily deactivate the self-transformation of grid
1260       //grid->transformGrid(grid);
[934]1261     }
[619]1262   }
1263
[687]1264   void CField::solveGenerateGrid()
1265   {
[746]1266     if (grid && !grid->isTransformed() && hasDirectFieldReference() && grid != getDirectFieldReference()->grid)
[687]1267       grid->completeGrid(getDirectFieldReference()->grid);
[775]1268     else
1269       grid->completeGrid();
[687]1270   }
1271
[775]1272   void CField::solveGridDomainAxisBaseRef()
1273   {
1274     grid->solveDomainAxisRef(false);
1275     grid->solveDomainAxisBaseRef();
1276   }
1277
[219]1278   ///-------------------------------------------------------------------
1279
1280   template <>
[562]1281   void CGroupTemplate<CField, CFieldGroup, CFieldAttributes>::solveRefInheritance(void)
[219]1282   {
1283      if (this->group_ref.isEmpty()) return;
1284      StdString gref = this->group_ref.getValue();
1285
[346]1286      if (!CFieldGroup::has(gref))
[219]1287         ERROR("CGroupTemplate<CField, CFieldGroup, CFieldAttributes>::solveRefInheritance(void)",
1288               << "[ gref = " << gref << "]"
1289               << " invalid group name !");
1290
[347]1291      CFieldGroup* group = CFieldGroup::get(gref);
1292      CFieldGroup* owner = CFieldGroup::get(boost::polymorphic_downcast<CFieldGroup*>(this));
[219]1293
[347]1294      std::vector<CField*> allChildren  = group->getAllChildren();
[562]1295      std::vector<CField*>::iterator it = allChildren.begin(), end = allChildren.end();
[509]1296
[219]1297      for (; it != end; it++)
1298      {
[347]1299         CField* child = *it;
[562]1300         if (child->hasId()) owner->createChild()->field_ref.setValue(child->getId());
[509]1301
[219]1302      }
1303   }
[509]1304
[464]1305   void CField::scaleFactorAddOffset(double scaleFactor, double addOffset)
1306   {
[1136]1307     recvDataSrv = (recvDataSrv - addOffset) / scaleFactor;
[464]1308   }
[509]1309
[599]1310   void CField::invertScaleFactorAddOffset(double scaleFactor, double addOffset)
1311   {
[1136]1312     recvDataSrv = recvDataSrv * scaleFactor + addOffset;
[599]1313   }
1314
[567]1315   void CField::outputField(CArray<double,1>& fieldOut)
[1136]1316   { 
[1129]1317      CArray<size_t,1>& outIndexClient = grid->localIndexToWriteOnClient;
1318      CArray<size_t,1>& outIndexServer = grid->localIndexToWriteOnServer;
1319      for (size_t idx = 0; idx < outIndexServer.numElements(); ++idx)
1320      {
1321        fieldOut(outIndexServer(idx)) = recvDataSrv(outIndexClient(idx));
1322      }
[1136]1323   }
[1129]1324
[1136]1325   void CField::inputField(CArray<double,1>& fieldIn)
1326   {
1327      CArray<size_t,1>& outIndexClient = grid->localIndexToWriteOnClient;
1328      CArray<size_t,1>& outIndexServer = grid->localIndexToWriteOnServer;
1329      for (size_t idx = 0; idx < outIndexServer.numElements(); ++idx)
[599]1330      {
[1136]1331        recvDataSrv(outIndexClient(idx)) = fieldIn(outIndexServer(idx));
[599]1332      }
1333
1334   }
1335
[676]1336   void CField::outputCompressedField(CArray<double,1>& fieldOut)
1337   {
[1143]1338      CArray<size_t,1>& outIndexClient = grid->localIndexToWriteOnClient;
1339      CArray<size_t,1>& outIndexServer = grid->localIndexToWriteOnServer;
1340      for (size_t idx = 0; idx < outIndexServer.numElements(); ++idx)
[676]1341      {
[1143]1342        fieldOut((idx)) = recvDataSrv(outIndexClient(idx));
[676]1343      }
1344   }
1345
[219]1346   ///-------------------------------------------------------------------
1347
[562]1348   void CField::parse(xml::CXMLNode& node)
[459]1349   {
1350      SuperClass::parse(node);
[562]1351      if (!node.getContent(this->content))
[472]1352      {
[476]1353        if (node.goToChildElement())
[472]1354        {
[476]1355          do
1356          {
[562]1357            if (node.getElementName() == "variable" || node.getElementName() == "variable_group") this->getVirtualVariableGroup()->parseChild(node);
1358          } while (node.goToNextElement());
[476]1359          node.goToParentElement();
1360        }
[472]1361      }
[459]1362    }
[509]1363
1364   /*!
1365     This function retrieves Id of corresponding domain_ref and axis_ref (if any)
1366   of a field. In some cases, only domain exists but axis doesn't
1367   \return pair of Domain and Axis id
1368   */
[887]1369   const std::vector<StdString>& CField::getRefDomainAxisIds()
[569]1370   {
1371     CGrid* cgPtr = getRelGrid();
1372     if (NULL != cgPtr)
1373     {
1374       std::vector<StdString>::iterator it;
1375       if (!domain_ref.isEmpty())
1376       {
1377         std::vector<StdString> domainList = cgPtr->getDomainList();
1378         it = std::find(domainList.begin(), domainList.end(), domain_ref.getValue());
[887]1379         if (domainList.end() != it) domAxisScalarIds_[0] = *it;
[569]1380       }
[472]1381
[569]1382       if (!axis_ref.isEmpty())
1383       {
1384         std::vector<StdString> axisList = cgPtr->getAxisList();
1385         it = std::find(axisList.begin(), axisList.end(), axis_ref.getValue());
[887]1386         if (axisList.end() != it) domAxisScalarIds_[1] = *it;
[569]1387       }
[887]1388
1389       if (!scalar_ref.isEmpty())
1390       {
1391         std::vector<StdString> scalarList = cgPtr->getScalarList();
1392         it = std::find(scalarList.begin(), scalarList.end(), scalar_ref.getValue());
1393         if (scalarList.end() != it) domAxisScalarIds_[2] = *it;
1394       }
[569]1395     }
[887]1396     return (domAxisScalarIds_);
[569]1397   }
1398
[472]1399   CVariable* CField::addVariable(const string& id)
1400   {
[562]1401     return vVariableGroup->createChild(id);
[472]1402   }
1403
1404   CVariableGroup* CField::addVariableGroup(const string& id)
1405   {
[562]1406     return vVariableGroup->createChildGroup(id);
[472]1407   }
1408
[1021]1409   void CField::sendAddAllVariables(CContextClient* client)
[1009]1410   {
1411     std::vector<CVariable*> allVar = getAllVariables();
1412     std::vector<CVariable*>::const_iterator it = allVar.begin();
1413     std::vector<CVariable*>::const_iterator itE = allVar.end();
1414
1415     for (; it != itE; ++it)
1416     {
[1021]1417       this->sendAddVariable((*it)->getId(), client);
1418       (*it)->sendAllAttributesToServer(client);
1419       (*it)->sendValue(client);
[1009]1420     }
1421   }
1422
[1021]1423   void CField::sendAddVariable(const string& id, CContextClient* client)
1424   {
1425      sendAddItem(id, (int)EVENT_ID_ADD_VARIABLE, client);
1426   }
1427
[1144]1428   void CField::sendAddVariableGroup(const string& id, CContextClient* client)
[472]1429   {
[1144]1430      sendAddItem(id, (int)EVENT_ID_ADD_VARIABLE_GROUP, client);
[472]1431   }
[509]1432
[472]1433   void CField::recvAddVariable(CEventServer& event)
1434   {
[509]1435
[562]1436      CBufferIn* buffer = event.subEvents.begin()->buffer;
[472]1437      string id;
[562]1438      *buffer >> id;
1439      get(id)->recvAddVariable(*buffer);
[472]1440   }
[509]1441
[472]1442   void CField::recvAddVariable(CBufferIn& buffer)
1443   {
[562]1444      string id;
1445      buffer >> id;
1446      addVariable(id);
[472]1447   }
1448
1449   void CField::recvAddVariableGroup(CEventServer& event)
1450   {
[509]1451
[562]1452      CBufferIn* buffer = event.subEvents.begin()->buffer;
[472]1453      string id;
[562]1454      *buffer >> id;
1455      get(id)->recvAddVariableGroup(*buffer);
[472]1456   }
[509]1457
[472]1458   void CField::recvAddVariableGroup(CBufferIn& buffer)
1459   {
[562]1460      string id;
1461      buffer >> id;
1462      addVariableGroup(id);
[472]1463   }
1464
[1021]1465   /*!
1466    * Returns string arithmetic expression associated to the field.
1467    * \return if content is defined return content string, otherwise, if "expr" attribute is defined, return expr string.
1468    */
1469   const string& CField::getExpression(void)
1470   {
1471     if (!expr.isEmpty() && content.empty())
1472     {
1473       content = expr;
1474       expr.reset();
1475     }
1476
1477     return content;
1478   }
1479
1480   bool CField::hasExpression(void) const
1481   {
1482     return (!expr.isEmpty() || !content.empty());
1483   }
1484
1485
[540]1486   DEFINE_REF_FUNC(Field,field)
[335]1487} // namespace xios
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.