wiki:Modipsl_envCalc

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Environnements de calculs

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IDRIS

  • http://www.idris.fr/
  • les machines de l'IDRIS disponibles pour le couplé sont brodie (NEC SX-8) et vargas (IBM Power6). Pour vargas, voir informations plus loin.

Mémo des choses à faire sur un nouveau login à l'IDRIS pour pouvoir préparer et lancer une simulation :

  • PATH sur brodie : ajouter l'accès à svn et fcm :
    PATH=$PATH:/TXlocal/pub/svn/svn-1.3.1/bin:/home/rech/psl/rpsl035/fcm/bin
    
  • sur vargas, il faut
    • avoir accès à svn : module load svn
    • avoir fcm dans son PATH :
      PATH=$PATH:/homegpfs/rech/psl/rpsl035/FCM/bin
      
  • $WORKDIR sur ulam est très vaste mais non sauvegardé. C'est là que les post-traitements tourneront in fine.
  • $WORKDIR sur brodie peut être étendu largement (50 Go pour le groupe par exemple). Le demander à l'assistance. Pour vérifier l'occupation et la taille :
    quota_u -w 
    
  • sur ulam, il faut éviter les bavardages affichés lors de la connexion. Vérifier depuis brodie que la commande : rsh ulam pwd renvoie juste une ligne avec le HOME.
    brodie : rsh ulam pwd
    /home/rech/...
    brodie : 
    
  • Il faut faire marcher les transferts brodie/gaya par mfget/mfput. Pour cela utiliser la commande Ftuas sur ulam (permet de faire connaitre le mot de passe gaya à brodie et à toutes les machines).
  • Pour que le stockage sur le serveur dods.idris fonctionne, il faut faire marcher la commande rsh gaya pwd sur ulam. Pour cela remplir le fichier gaya:~/.rhosts (et lui donner les accès rw-------) avec :
    ulam.idris.fr
    ulam
    brodie.idris.fr
    brodie
    
  • Pour les accès dods, il faut lancer de plus une commande mfdods sur gaya. Cela crée le lien (24h après la première fois) visible là : http://dods.idris.fr/monlogin.
  • Pour donner les accès à tous (755 ou drwxr-xr-x) au WORKDIR de brodie, il faut demander à l'assistance IDRIS pour le niveau /u/rech/grp.



CCRT

  • les machines du CCRT disponibles pour le couplé sont mercure (NEC SX-8 et NEC SX-9) et platine (Bull Itanium) et titane (Bull Xeon). Voir information spécifique titane plus loin.


Mémo des choses à faire sur un nouveau login au CCRT pour pouvoir préparer et lancer une simulation :

  • PATH sur mercure/platine/titane : ajouter l'accès à fcm :
    PATH=$PATH:/home/cont003/p86ipsl/fcm/bin  # MERCURE only 
    


Conseil pour installer son environnement au ccrt

Nous vous conseillons de garder le bash comme shell de login, et de récupérer les fichiers suivants :

~p86ipsl/.bashrc 
~p86ipsl/.bashrc_platine 
~p86ipsl/.bashrc_mercure01 
~p86ipsl/.bashrc_cesium 
~p86ipsl/.bashrc_titane 
~p86ipsl/.profile 

Ces fichiers sont maintenus par le groupe esci et sont adaptés aux machines de calcul du CCRT. Lorsque des modifications majeures sont apportées à l'une des machines (exemple : le changement de frontale de la machine mercure en juin 2010) vous pouvez récupérer la nouvelle version du fichier concerné (.bashrc_machine).

NOTE : si votre shell de login n'est pas bash, vous pouvez le modifier avec la commande chsh.



Travailler sur titane

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