Changes between Version 19 and Version 20 of Modipsl_curie

Timestamp:

08/02/12 18:23:58 (12 years ago)

Author:

aclsce

Comment:

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Modipsl_curie

@@ -207 +207 @@
  * 9% des jobs de calcul ont du être resoumis à la main (3/34).
  * 0,6 % de l'ensembles des jobs de calcul et de post-traitements ont du être resoumis à la main (4/694).
+
+=== Comment utiliser le débugueur ddt pour débuguer le modèle couplé (ou tout autre code MPMD) ? ===
+
+ * compiler le modèle que vous souhaitez débuguer avec l'option -g (nécessaire pour avoir accès aux sources depuis l'interface ddt)
+ * créer un répertoire de débugage dans lequel se trouve les exécutables du modèle + les fichiers d'entrée nécessaires au modèle
+ * modifier le fichier de configuration "run_file" pour avoir quelque chose comme :
+{{{
+-np 1 ${DDTPATH}/bin/ddt-client ${TMPDIR_DEBUG}/oasis
+-np 5 ${DDTPATH}/bin/ddt-client ${TMPDIR_DEBUG}/opa.xx
+-np 26 ${DDTPATH}/bin/ddt-client ${TMPDIR_DEBUG}/lmdz.x 
+
+avec TMPDIR_DEBUG = répertoire de débugage
+}}}
+ * créer un job de débugage simplifié qui permet de lancer un run dans le répertoire de débugage
+ * ajouter dans votre job la commande "module load ddt/3.2"
+ * ajouter un lancement de ddt dans le job.
+ * supprimer la variable d’environnement SLURM_SPANK_AUKS : unset SLURM_SPANK_AUKS
+{{{
+...
+module load ddt/3.2
+unset SLURM_SPANK_AUKS
+ddt
+}}}
+ * être connecté sur curie en SSH avec export graphique (option -X) et ayant entré son mot de passe (si vous avez des clés SSH, sur la frontale déplacez les fichiers ~/.ssh/authorized_keys* en dehors du dossier, puis déconnectez-vous et reconnectez-vous).
+ * lancer le job avec export graphique : ccc_msub -X Job
+ * lorsque la fenêtre ddt apparaît : 
+  * cliquer sur "Run and Debug a Program" 
+  * dans Application, sélectionner un des 3 exécutables du modèle (peu importe lequel)
+  * dans MPI, Implémentation choisir le mode "OpenMPI (Compatibility)"
+  * dans mpirun arguments, mettre "--app ${TMPDIR_DEBUG}/run_file" avec TMPDIR_DEBUG = répertoire de débugage
+  * cliquer sur "Run" puis sur la touche lecture en haut à gauche
+
+