Description pour un utilisation standard de LMDZOR_v4

Voici un description rapide pour utilisation de cette configuration. Pour plus des détail comment utiliser cette configuration, voir le wiki LMDZOR_v4, pour modipsl, voir le wiki ModipslBeginner et pour les scripts et les posttraitement, voir ​la documentation de libIGCM.

1) Extraction des sources

Extrait d'abord modipsl :

svn co http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn/modipsl/trunk modipsl

Extrait la configuration LMDZOR_v4 avec les sources des modèles LMDZ et ORCHIDEE, l'extraction inclue aussi IOIPSL et libIGCM :

cd modipsl/util
./model -h LMDZOR_v4
./model LMDZOR_v4

Avant extraction des sources il faut surtout pensez a quel version des sources LMDZ vous voulez utiliser. Cette configuration est prévue pour le version dites LMDZ4_AR5 (aussi appelle PROD, utilisé pour CMIP5 ancien physique) et le version de développement LMDZ5/trunk. Le choix se fait dans le fichier modipsl/util/mod.def, pour LMDZ4_AR5 mettez :

#-C- LMDZOR_v4  LMDZ4/branches/LMDZ4_AR5       HEAD               11 LMDZ       modeles

ou pour LMDZ5 :

#-C- LMDZOR_v4  LMDZ5/trunk                    HEAD               11 LMDZ       modeles

Vous pouvez aussi préciser un numéro de révision au lieu de HEAD qui correspond au dernier révision sur le trunk ou branche. Si vous ne savez pas quel version choisir, prenez LMDZ4_AR5 pour l'ancienne physique ou LMDZ5/trunk pour la nouvelle physique et renseignez vous auprès de l'équipe de LMDZ.

Avant la première extraction d'ORCHIDEE il faut demander un mot-de-passe de M. Mancip. Si vous ne avez pas besoin d'ORCHIDEE, soit vous pouvez quand même compiler avec et ensuite désactiver avant lancement de la simulation (plus facile) ou vous pouvez aussi enlever ORCHIDEE de la compilation, pour les 2 cas voir le wiki LMDZOR_v4.

2) Compilation

Avant de compiler le premier fois, il faut ajouter le chemin pour fcm : /home/rech/psl/rpsl035/fcm/bin (brodie), /homegpfs/rech/psl/rpsl035/FCM/bin (vargas) ou /home/cont003/p86ipsl/fcm/bin (mercure) dans la variable d'environnement PATH. Ensuite créez le Makefile avec ins_make et lancez la compilation :

./ins_make
cd ../config/LMDZOR_v4
gmake [resolution_desirée]

3) Création des états initiaux et des fichiers limites

Les états initiaux (start.nc et startphy.nc) et le fichier des conditions limites (limit.nc) sont crées avec un job dans le répertoire modipsl/config/LMDZOR_v4/CREATE. Ce job va lancer l'executable create_etat0_limit.e (ou ce0l.e) de LMDZ. Il y a deux possibilités prédéfinie pour la création des fichiers limit.nc : a partir des AMIP climatologique ou inter-annuelles. Pour un run climatologique, utilise les config.card et lmdz.card avec le suffix _Climat, fait le lien suivant :

ln -s config.card_Climat config.card; cd COMP; ln -s lmdz.card_Climat lmdz.card

ou pour un simulation inter-annuel AMIP :

ln -s config.card_Interannuel config.card; cd COMP; ln -s lmdz.card_Interannuel lmdz.card

Certains paramètres dans config.card doivent être considère et éventuellement modifié : JobName, CalendarType, DateBegin, DateEnd. Le paramètre CalendarType decide combien de jours le fichier limit.nc va contenir. Pour 360jours, mets CalendarType=360D, pour 365jours mets CalendarType=noleap et pour 365 ou 366 selon les années bissextille, mets CalendarType=leap. Par contre, pour cette expérience CREATE, il ne faut pas modifier le paramètre PeriodLength=1Y car create_etat0_limit créer toujours des fichiers d'un an. Après exécution ces fichiers crées seront stockés dans IGCM_OUT/LMDZOR_v4/JobName/ATM/Output. Le JobName, par défaut ELY-LMDXXXX, avec Y=C pour climatologique ou Y=I pour inter-annuelle, XXXX=résolution. Le nom peut être modifié dans config.card avant le lancement de ins_job.

Pour création du job et lancement, faites :

cd CREATE
(éventuellement modification dans config.card, par exemple Jobname)
../../../util/ins_job
qsub Job_ELXXXX

Après la fin du simulation, les fichiers start.nc, startphy.nc, limit.nc, climoz_LMDZ.nc et grilles_gcm.nc seront stochée sur le serveur de stochage gaya(IDRIS) ou dmndir(CCRT) dans le répertoire IGCM_OUT/LMDZOR/ELY-XXXX/ATM/Output.

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Trait de côte avec o2a.nc

Pour avoir les mêmes traits de côte comme dans le modèle couplé, il est necessaire de crée les fichiers limites en utilisant le fichier o2a.nc. Ce n'est pas le cas par défaut. Il faut ajouter dans COMP/lmdz.card dans la liste "ListNonDel" sous "[BoundaryFiles]" le chemin complet vers ce fichier, par exemple ${R_INIT}/ATM/IPSLCM4_v2/ORCA2xLMD9671/o2a.nc pour la résolution ORCA2xLMD9671.

4) Lancer une simulation

La simulation se lance dans le repertoire modipsl/config/LMDZ4OR_v2/LMDZOR. Verifiez et modifiez la mise en place de la simulation avant lancement. Pour créer le job et après une modification dans config.card, utilisez "ins_job". La simulation par défaut est de type AMIP climatologique. Pour utiliser les AMIP interannuel, copiez le fichier lmdz.card_Interannuel dans lmdz.card. Pour apprendre à utiliser les scripts, voir ​la documentation de libIGCM.

cd ../LMDZ4OR
(éventuellement modification dans COMP, PARAM et config.card)
(éventuellement ../../../util/ins_job)
(éventuellement modification dans Job_LMDZOR)
qsub Job_LMDZOR

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