Configuration ICOLMDZ-LAM (TGCC, IDRIS)

Extraction de la configuration

svn co https://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn/modipsl/trunk modipsl ; cd modipsl/util ; ./model ICOLMDZOR_v7_LAM_work

Les composants suivants composent la configuration:

• DYNAMICO : trunk2master, b18ad822
• ICOSA_LMDZ : aquaplanet/ICOSA_LMDZ, rev 455
• LMDZ : LMDZ6/branches/IPSL-CM6A-MR, rev 3855
• ORCHIDEE : branches/ORCHIDEE_Quest/ORCHIDEE, rev 7086

Compilation de la configuration

cd config/ICOLMDZOR_v7 ; ./compile_icolmdzor.sh

Note : sur Jean-Zay, pensez à vous mettre sur la frontale pp pour compiler via ssh login@jean-zay-pp1.idris.fr

Exécution

Les 6 expériences disponibles avec 2 types de forçages possibles

• sorties générées par une simulation de type amip
• données ERA5 : plus d'informations là: ​https://gitlab.in2p3.fr/ipsl/projets/dynamico/dynamico/-/tree/trunk2master/TEST_CASE/LAM_ERA5

Les expériences tournent par défaut sur la zone France :

• ICOLMDZ/CREATE_amip
  • Génération de l'état initial et fichier limit global
  • Utilisation du run_dynamico.def : PARAM/run_dynamico_global_France.def
  • Transformée de Schmidt : schmidt_lon=3, schmidt_lat=47, schmidt_factor=4
  • cd config/ICOLMDZOR_v7 ; cp EXPERIMENTS/ICOLMDZ/CREATE_amip/config.card .
    • A modifier si besoin dans config.card : JobName=...
    • puis ../../libIGCM/ins_job ; cd JobName ; ccc_msub Job_JobName
• ICOLMDZ/amip
  • Génération du fichier de forcage nudging_forcing.nc nécéssaire pour tourner la simulation LAM.
  • Utilisation du run_dynamico.def : PARAM/run_dynamico_global_France.def
  • Transformée de Schmidt : schmidt_lon=3, schmidt_lat=47, schmidt_factor=4
  • Utilisation des fichier start.nc, startphy.nc et limit.nc générés par l'expérience CREATE_amip.
  • cd config/ICOLMDZOR_v7 ; cp EXPERIMENTS/ICOLMDZ/amip/config.card .
  • A modifier config.card : JobName=..., CreateName=le nom donné à la simulation CREATE_amip
  • ../../libIGCM/ins_job ; cd JobName ; ccc_msub Job_JobName}}}
• ICOLMDZ/CREATE_amip_LAM
  • Génération de l'état initial et fichier limit sur l'aire.
  • Utilisation du run_dynamico.def : PARAM/run_dynamico_lam_forcing_France.def
  • Utilisation du fichier start généré par l'expérience CREATE_amip globale (start = start_file_interp).
  • Utilisation du fichier nudging_forcing.nc généré par l'expérience amip globale.
  • cd config/ICOLMDZOR_v7 ; cp EXPERIMENTS/ICOLMDZ/CREATE_amip_LAM/config.card .
  • A modifier dans config.card :
    • JobName= nom de la simulation
    • CreateName=le nom donné à la simulation CREATE_amip
    • ForcingName= le nom donné à la simulation amip globale
    • ForcingDate= date contenue dans le nom du fichier nudging_forcing.nc généré par la simulation amip globale.
  • ../../libIGCM/ins_job ; cd JobName ; ccc_msub Job_JobName
  • Sur Irene, pensez à augmenter la mémoire disponible par process : #MSUB -c 4 dans l'entête du Job.
• ICOLMDZ/amip_LAM : les forçages utilisés sont issus d'une simulation amip globale.
  • Simulation LAM qui utilise le fichier de forçage nudging_forcing.nc, issu d'une simulation amip globale.
  • Utilisation du run_dynamico.def : PARAM/run_dynamico_lam_forcing_France.def
  • Utilisation des fichier start.nc, startphy.nc et limit.nc générés par l'expérience CREATE_amip_LAM.
  • cd config/ICOLMDZOR_v7 ; cp EXPERIMENTS/ICOLMDZ/amip_LAM/config.card .
  • A modifier dans config.card :
    • JobName= nom de la simulation
    • CreateName=le nom donné à la simulation CREATE_amip_LAM
    • ForcingName= le nom donné à la simulation amip globale
    • ForcingDate= date contenue dans le nom du fichier nudging_forcing.nc généré par la simulation amip globale.
  • ../../libIGCM/ins_job ; cd JobName ; ccc_msub Job_JobName}}}
  • Sur Irene, pensez à augmenter la mémoire disponible par process : #MSUB -c 4 dans l'entête du Job.
• ICOLMDZ/CREATE_amip_ERA5_LAM
  • Génération de l'état initial et fichier limit sur l'aire.
  • Utilisation du run_dynamico.def : PARAM/run_dynamico_lam_ERA5_France.def
  • Utilisation du fichier ERA5 comme fichier nudging_forcing.nc. Le fichier ERA5_062000.nc utilisé par défaut est stocké sur les comptes communs.
  • cd config/ICOLMDZOR_v7 ; cp EXPERIMENTS/ICOLMDZ/CREATE_amip_ERA5_LAM/config.card .
  • A modifier dans config.card :
    • JobName= nom de la simulation
  • ../../libIGCM/ins_job ; cd JobName ; ccc_msub Job_JobName
  • Sur Irene, pensez à augmenter la mémoire disponible par process : #MSUB -c 4 dans l'entête du Job.
• ICOLMDZ/amip_ERA5_LAM : les forçages utilisés proviennent des données ERA5.
  • Simulation LAM qui utilise le fichier de forçage ERA5.
  • Utilisation du run_dynamico.def : PARAM/run_dynamico_lam_ERA5_France.def
  • Utilisation des fichier start.nc, startphy.nc et limit.nc générés par l'expérience CREATE_amip_ERA5_LAM.
  • cd config/ICOLMDZOR_v7 ; cp EXPERIMENTS/ICOLMDZ/amip_ERA5_LAM/config.card .
  • A modifier dans config.card :
    • JobName= nom de la simulation
    • ForcingName= le nom donné au fichier de foçage (defaut : ERA5).
    • ForcingDate= date contenue dans le nom du fichier ERA utilisé (defaut 062000).
  • ../../libIGCM/ins_job ; cd JobName ; ccc_msub Job_JobName}}}
  • Sur Irene, pensez à augmenter la mémoire disponible par process : #MSUB -c 4 dans l'entête du Job.

Vue d'ensemble

Parametres importants du run_dynamico.def pour configurer le LAM (zone et resolution)

• metric_type = icosa_area ==> definition de la métrique du maillage ; choix possible : icosa_global (default) pour le global / icosa_area pour le LAM
• area_center_lon = 3 ==> pour le LAM : longitude (degrés) du centre du LAM (centre hexagone)
• area_center_lat = 47 ==> pour le LAM : latitude (degrés) du centre du LAM (centre hexagone)
• area_radius=800 ==> pour le LAM : rayon du lam en Km (centre -> sommet hexagone)
• PS_relax_out=3600 ==>
• T_relax_out=3600
• U_relax_out=3600
• Q_relax_out=3600

• nudging_vertical_levels=model

#---------------- guided ---------------- #guided_type = none

guided_type = nudging itau_nudging = 120 nudging_zone = area nudging_stiffness=8

# Number of subdivision on a main triangle (nbp) : integer (default=40) nbp=40

# nbp 20 40 80 160 # T-edge length (km) 500 250 120 60

# sub splitting of main rhombus : integer (default=1) nsplit_i=4 nsplit_j=4 omp_level_size=1

# read_metric : read grid description from start.nc file read_metric = n

# optim_it : mesh optimisation : number of iteration : integer (default=0) optim_it= 0

# ---------------------------------- Time---------------------------------

# timestep : real (default=480s) dt = 30.

# advection called every itau_adv time steps : integer (default 2) # standard : umax=100m/s vs c=340m/s (ratio 1:3) # in JW06 umax=35m/s vs c=340m/s (ratio 1:10) itau_adv=1

# run length : real (default=dt*itaumax) run_length=_AUTOBLOCKER_

# etat0_start_iteration_reset : set y to reset iteration from start.nc etat0_start_iteration_reset=_AUTOBLOCKER_

# output field period : integer (default none) write_period=10800

itau_check_conserv=100

# ---------------------------------- Misc -------------------------------- # number of tracer (nqtot) : integer (default 1) nqtot=4

# pression value where output is interpolated : real (default=0, no output) out_pression_level=85000

start_file_name=start restart_file_name=restart

# Use of oasis or not (needed to initialize and finalize coupling mode) using_oasis=_AUTOBLOCKER_

# ---------------------------------- Dissipation ---------------------------------

# dissipation time graddiv : real (default=5000) tau_graddiv = 3600

# number of iteration for graddiv : integer (default=1) nitergdiv = 1

# dissipation time nxgradrot (default=5000) tau_gradrot = 21600

# number of iteration for nxgradrot : integer (default=1) nitergrot=2

# dissipation time divgrad (theta) (default=5000) tau_divgrad=10800

# number of iteration for divgrad : integer (default=1) niterdivgrad=2

# -------------------------------- Physics -------------------------------------

# kind of physics : string : none, dcmip (default=none) physics=phys_external # itau_physics: dt_phys=itau_physics*dt here dt=450s => dt_phys=900s itau_physics=30

# Following parameters are changed by options set in dynamico.card create_etat0_limit=_AUTO_ etat0=_AUTO_ iflag_phys=_AUTO_

# heldsz_p0 is only read if etat0=held_suarez (aquaplanet simulation) heldsz_p0=101080