source: CONFIG_DEVT/IPSLCM6.5_work_ENSEMBLES/config/IPSLCM6/SOURCES/NEMO/nemogcm.F90 @ 5877

Last change on this file since 5877 was 5877, checked in by aclsce, 3 years ago
  • Removed the call to cpl_finalize because the finalize is already done by xios just before.
File size: 36.0 KB
Line 
1MODULE nemogcm
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE nemogcm   ***
4   !! Ocean system   : NEMO GCM (ocean dynamics, on-line tracers, biochemistry and sea-ice)
5   !!======================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1990-10  (C. Levy, G. Madec)  Original code
7   !!            7.0  ! 1991-11  (M. Imbard, C. Levy, G. Madec)
8   !!            7.1  ! 1993-03  (M. Imbard, C. Levy, G. Madec, O. Marti, M. Guyon, A. Lazar,
9   !!                             P. Delecluse, C. Perigaud, G. Caniaux, B. Colot, C. Maes) release 7.1
10   !!             -   ! 1992-06  (L.Terray)  coupling implementation
11   !!             -   ! 1993-11  (M.A. Filiberti) IGLOO sea-ice
12   !!            8.0  ! 1996-03  (M. Imbard, C. Levy, G. Madec, O. Marti, M. Guyon, A. Lazar,
13   !!                             P. Delecluse, L.Terray, M.A. Filiberti, J. Vialar, A.M. Treguier, M. Levy) release 8.0
14   !!            8.1  ! 1997-06  (M. Imbard, G. Madec)
15   !!            8.2  ! 1999-11  (M. Imbard, H. Goosse)  sea-ice model
16   !!                 ! 1999-12  (V. Thierry, A-M. Treguier, M. Imbard, M-A. Foujols)  OPEN-MP
17   !!                 ! 2000-07  (J-M Molines, M. Imbard)  Open Boundary Conditions  (CLIPPER)
18   !!   NEMO     1.0  ! 2002-08  (G. Madec)  F90: Free form and modules
19   !!             -   ! 2004-06  (R. Redler, NEC CCRLE, Germany) add OASIS[3/4] coupled interfaces
20   !!             -   ! 2004-08  (C. Talandier) New trends organization
21   !!             -   ! 2005-06  (C. Ethe) Add the 1D configuration possibility
22   !!             -   ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
23   !!             -   ! 2006-03  (L. Debreu, C. Mazauric)  Agrif implementation
24   !!             -   ! 2006-04  (G. Madec, R. Benshila)  Step reorganization
25   !!             -   ! 2007-07  (J. Chanut, A. Sellar) Unstructured open boundaries (BDY)
26   !!            3.2  ! 2009-08  (S. Masson)  open/write in the listing file in mpp
27   !!            3.3  ! 2010-05  (K. Mogensen, A. Weaver, M. Martin, D. Lea) Assimilation interface
28   !!             -   ! 2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase
29   !!            3.3.1! 2011-01  (A. R. Porter, STFC Daresbury) dynamical allocation
30   !!             -   ! 2011-11  (C. Harris) decomposition changes for running with CICE
31   !!            3.6  ! 2012-05  (C. Calone, J. Simeon, G. Madec, C. Ethe) Add grid coarsening
32   !!             -   ! 2014-12  (G. Madec) remove KPP scheme and cross-land advection (cla)
33   !!            4.0  ! 2016-10  (G. Madec, S. Flavoni)  domain configuration / user defined interface
34   !!----------------------------------------------------------------------
35
36   !!----------------------------------------------------------------------
37   !!   nemo_gcm      : solve ocean dynamics, tracer, biogeochemistry and/or sea-ice
38   !!   nemo_init     : initialization of the NEMO system
39   !!   nemo_ctl      : initialisation of the contol print
40   !!   nemo_closefile: close remaining open files
41   !!   nemo_alloc    : dynamical allocation
42   !!----------------------------------------------------------------------
43   USE step_oce       ! module used in the ocean time stepping module (step.F90)
44   USE phycst         ! physical constant                  (par_cst routine)
45   USE domain         ! domain initialization   (dom_init & dom_cfg routines)
46   USE closea         ! treatment of closed seas (for ln_closea)
47   USE usrdef_nam     ! user defined configuration
48   USE tideini        ! tidal components initialization   (tide_ini routine)
49   USE bdy_oce,  ONLY : ln_bdy
50   USE bdyini         ! open boundary cond. setting       (bdy_init routine)
51   USE istate         ! initial state setting          (istate_init routine)
52   USE ldfdyn         ! lateral viscosity setting      (ldfdyn_init routine)
53   USE ldftra         ! lateral diffusivity setting    (ldftra_init routine)
54   USE trdini         ! dyn/tra trends initialization     (trd_init routine)
55   USE asminc         ! assimilation increments     
56   USE asmbkg         ! writing out state trajectory
57   USE diaptr         ! poleward transports           (dia_ptr_init routine)
58   USE diadct         ! sections transports           (dia_dct_init routine)
59   USE diaobs         ! Observation diagnostics       (dia_obs_init routine)
60   USE diacfl         ! CFL diagnostics               (dia_cfl_init routine)
61   USE diaharm        ! tidal harmonics diagnostics  (dia_harm_init routine)
62   USE step           ! NEMO time-stepping                 (stp     routine)
63   USE icbini         ! handle bergs, initialisation
64   USE icbstp         ! handle bergs, calving, themodynamics and transport
65   USE cpl_oasis3     ! OASIS3 coupling
66   USE c1d            ! 1D configuration
67   USE step_c1d       ! Time stepping loop for the 1D configuration
68   USE dyndmp         ! Momentum damping
69   USE stopar         ! Stochastic param.: ???
70   USE stopts         ! Stochastic param.: ???
71   USE diurnal_bulk   ! diurnal bulk SST
72   USE step_diu       ! diurnal bulk SST timestepping (called from here if run offline)
73   USE crsini         ! initialise grid coarsening utility
74   USE dia25h         ! 25h mean output
75   USE sbc_oce , ONLY : lk_oasis
76   USE wet_dry        ! Wetting and drying setting   (wad_init routine)
77#if defined key_top
78   USE trcini         ! passive tracer initialisation
79#endif
80#if defined key_nemocice_decomp
81   USE ice_domain_size, only: nx_global, ny_global
82#endif
83   !
84   USE in_out_manager ! I/O manager
85   USE lib_mpp        ! distributed memory computing
86   USE mppini         ! shared/distributed memory setting (mpp_init routine)
87   USE lbcnfd  , ONLY : isendto, nsndto, nfsloop, nfeloop   ! Setup of north fold exchanges
88   USE lib_fortran    ! Fortran utilities (allows no signed zero when 'key_nosignedzero' defined)
89#if defined key_iomput
90   USE xios           ! xIOserver
91#endif
92#if defined key_agrif
93   USE agrif_all_update   ! Master Agrif update
94#endif
95
96   IMPLICIT NONE
97   PRIVATE
98
99   PUBLIC   nemo_gcm    ! called by model.F90
100   PUBLIC   nemo_init   ! needed by AGRIF
101   PUBLIC   nemo_alloc  ! needed by TAM
102
103   CHARACTER(lc) ::   cform_aaa="( /, 'AAAAAAAA', / ) "     ! flag for output listing
104
105#if defined key_mpp_mpi
106   ! need MPI_Wtime
107   INCLUDE 'mpif.h'
108#endif
109
110   !!----------------------------------------------------------------------
111   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
112   !! $Id: nemogcm.F90 13013 2020-06-03 08:33:06Z smasson $
113   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
114   !!----------------------------------------------------------------------
115CONTAINS
116
117   SUBROUTINE nemo_gcm
118      !!----------------------------------------------------------------------
119      !!                     ***  ROUTINE nemo_gcm  ***
120      !!
121      !! ** Purpose :   NEMO solves the primitive equations on an orthogonal
122      !!              curvilinear mesh on the sphere.
123      !!
124      !! ** Method  : - model general initialization
125      !!              - launch the time-stepping (stp routine)
126      !!              - finalize the run by closing files and communications
127      !!
128      !! References : Madec, Delecluse, Imbard, and Levy, 1997:  internal report, IPSL.
129      !!              Madec, 2008, internal report, IPSL.
130      !!----------------------------------------------------------------------
131      INTEGER ::   istp   ! time step index
132      REAL(wp)::   zstptiming   ! elapsed time for 1 time step
133      !!----------------------------------------------------------------------
134      !
135#if defined key_agrif
136      CALL Agrif_Init_Grids()      ! AGRIF: set the meshes
137#endif
138      !                            !-----------------------!
139      CALL nemo_init               !==  Initialisations  ==!
140      !                            !-----------------------!
141#if defined key_agrif
142      CALL Agrif_Declare_Var_dom   ! AGRIF: set the meshes for DOM
143      CALL Agrif_Declare_Var       !  "      "   "   "      "  DYN/TRA
144# if defined key_top
145      CALL Agrif_Declare_Var_top   !  "      "   "   "      "  TOP
146# endif
147# if defined key_si3
148      CALL Agrif_Declare_Var_ice   !  "      "   "   "      "  Sea ice
149# endif
150#endif
151      ! check that all process are still there... If some process have an error,
152      ! they will never enter in step and other processes will wait until the end of the cpu time!
153      CALL mpp_max( 'nemogcm', nstop )
154
155      IF(lwp) WRITE(numout,cform_aaa)   ! Flag AAAAAAA
156
157      !                            !-----------------------!
158      !                            !==   time stepping   ==!
159      !                            !-----------------------!
160      istp = nit000
161      !
162#if defined key_c1d
163      DO WHILE ( istp <= nitend .AND. nstop == 0 )    !==  C1D time-stepping  ==!
164         CALL stp_c1d( istp )
165         istp = istp + 1
166      END DO
167#else
168      !
169# if defined key_agrif
170      !                                               !==  AGRIF time-stepping  ==!
171      CALL Agrif_Regrid()
172      !
173      ! Recursive update from highest nested level to lowest:
174      CALL Agrif_step_child_adj(Agrif_Update_All)
175      !
176      DO WHILE( istp <= nitend .AND. nstop == 0 )
177         CALL stp
178         istp = istp + 1
179      END DO
180      !
181# else
182      !
183      IF( .NOT.ln_diurnal_only ) THEN                 !==  Standard time-stepping  ==!
184         !
185         DO WHILE( istp <= nitend .AND. nstop == 0 )
186
187            ncom_stp = istp
188            IF( ln_timing ) THEN
189               zstptiming = MPI_Wtime()
190               IF ( istp == ( nit000 + 1 ) ) elapsed_time = zstptiming
191               IF ( istp ==         nitend ) elapsed_time = zstptiming - elapsed_time
192            ENDIF
193           
194            CALL stp        ( istp ) 
195            istp = istp + 1
196
197            IF( lwp .AND. ln_timing )   WRITE(numtime,*) 'timing step ', istp-1, ' : ', MPI_Wtime() - zstptiming
198
199         END DO
200         !
201      ELSE                                            !==  diurnal SST time-steeping only  ==!
202         !
203         DO WHILE( istp <= nitend .AND. nstop == 0 )
204            CALL stp_diurnal( istp )   ! time step only the diurnal SST
205            istp = istp + 1
206         END DO
207         !
208      ENDIF
209      !
210# endif
211      !
212#endif
213      !
214      IF( ln_diaobs   )   CALL dia_obs_wri
215      !
216      IF( ln_icebergs )   CALL icb_end( nitend )
217
218      !                            !------------------------!
219      !                            !==  finalize the run  ==!
220      !                            !------------------------!
221      IF(lwp) WRITE(numout,cform_aaa)        ! Flag AAAAAAA
222      !
223      IF( nstop /= 0 .AND. lwp ) THEN        ! error print
224         WRITE(ctmp1,*) '   ==>>>   nemo_gcm: a total of ', nstop, ' errors have been found'
225         IF( ngrdstop > 0 ) THEN
226            WRITE(ctmp9,'(i2)') ngrdstop
227            WRITE(ctmp2,*) '           E R R O R detected in Agrif grid '//TRIM(ctmp9)
228            WRITE(ctmp3,*) '           Look for "E R R O R" messages in all existing '//TRIM(ctmp9)//'_ocean_output* files'
229            CALL ctl_stop( ' ', ctmp1, ' ', ctmp2, ' ', ctmp3 )
230         ELSE
231            WRITE(ctmp2,*) '           Look for "E R R O R" messages in all existing ocean_output* files'
232            CALL ctl_stop( ' ', ctmp1, ' ', ctmp2 )
233         ENDIF
234      ENDIF
235      !
236      IF( ln_timing )   CALL timing_finalize
237      !
238      CALL nemo_closefile
239      !
240#if defined key_iomput
241                                    CALL xios_finalize  ! end mpp communications with xios
242!      IF( lk_oasis     )            CALL cpl_finalize   ! end coupling and mpp communications with OASIS
243#else
244      IF    ( lk_oasis ) THEN   ;   CALL cpl_finalize   ! end coupling and mpp communications with OASIS
245      ELSEIF( lk_mpp   ) THEN   ;   CALL mppstop      ! end mpp communications
246      ENDIF
247#endif
248      !
249      IF(lwm) THEN
250         IF( nstop == 0 ) THEN   ;   STOP 0
251         ELSE                    ;   STOP 123
252         ENDIF
253      ENDIF
254      !
255   END SUBROUTINE nemo_gcm
256
257
258   SUBROUTINE nemo_init
259   USE ensemble_oce
260      !!----------------------------------------------------------------------
261      !!                     ***  ROUTINE nemo_init  ***
262      !!
263      !! ** Purpose :   initialization of the NEMO GCM
264      !!----------------------------------------------------------------------
265      INTEGER ::   ios, ilocal_comm   ! local integers
266      !!
267      NAMELIST/namctl/ ln_ctl   , sn_cfctl, nn_print, nn_ictls, nn_ictle,   &
268         &             nn_isplt , nn_jsplt, nn_jctls, nn_jctle,             &
269         &             ln_timing, ln_diacfl
270      NAMELIST/namcfg/ ln_read_cfg, cn_domcfg, ln_closea, ln_write_cfg, cn_domcfg_out, ln_use_jattr
271      CHARACTER(LEN=256) :: ensemble_code_id
272      INTEGER            :: ensemble_communicator
273      !!----------------------------------------------------------------------
274      !
275      cxios_context = 'nemo'
276      !
277      !                             !-------------------------------------------------!
278      !                             !     set communicator & select the local rank    !
279      !                             !  must be done as soon as possible to get narea  !
280      !                             !-------------------------------------------------!
281      !
282#if defined key_iomput
283      IF( Agrif_Root() ) THEN
284         IF( lk_oasis ) THEN
285!            CALL cpl_init( "oceanx", ilocal_comm )                               ! nemo local communicator given by oasis
286!            CALL xios_initialize( "not used"       , local_comm =ilocal_comm )   ! send nemo communicator to xios
287           CALL get_ensemble_code_id("oceanx",ensemble_code_id)
288           CALL xios_initialize(TRIM(ensemble_code_id), return_comm=ensemble_communicator)
289           CALL init_ensemble(ensemble_communicator, ilocal_comm)
290         ELSE
291            CALL xios_initialize( "for_xios_mpi_id", return_comm=ilocal_comm )   ! nemo local communicator given by xios
292         ENDIF
293      ENDIF
294      CALL mpp_start( ilocal_comm )
295#else
296      IF( lk_oasis ) THEN
297         IF( Agrif_Root() ) THEN
298            CALL cpl_init( "oceanx", ilocal_comm )          ! nemo local communicator given by oasis
299         ENDIF
300         CALL mpp_start( ilocal_comm )
301      ELSE
302         CALL mpp_start( )
303      ENDIF
304#endif
305      !
306      narea = mpprank + 1               ! mpprank: the rank of proc (0 --> mppsize -1 )
307      lwm = (narea == 1)                ! control of output namelists
308      !
309      !                             !---------------------------------------------------------------!
310      !                             ! Open output files, reference and configuration namelist files !
311      !                             !---------------------------------------------------------------!
312      !
313      ! open ocean.output as soon as possible to get all output prints (including errors messages)
314      IF( lwm )   CALL ctl_opn(     numout,        'ocean.output', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, -1, .FALSE. )
315      ! open reference and configuration namelist files
316                  CALL ctl_opn( numnam_ref,        'namelist_ref',     'OLD', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, -1, .FALSE. )
317                  CALL ctl_opn( numnam_cfg,        'namelist_cfg',     'OLD', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, -1, .FALSE. )
318      IF( lwm )   CALL ctl_opn(     numond, 'output.namelist.dyn', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, -1, .FALSE. )
319      ! open /dev/null file to be able to supress output write easily
320      IF( Agrif_Root() ) THEN
321                  CALL ctl_opn(     numnul,           '/dev/null', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, -1, .FALSE. )
322#ifdef key_agrif
323      ELSE
324                  numnul = Agrif_Parent(numnul)
325#endif
326      ENDIF
327      !
328      !                             !--------------------!
329      !                             ! Open listing units !  -> need ln_ctl from namctl to define lwp
330      !                             !--------------------!
331      !
332      REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namctl in reference namelist
333      READ  ( numnam_ref, namctl, IOSTAT = ios, ERR = 901 )
334901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namctl in reference namelist' )
335      REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namctl in confguration namelist
336      READ  ( numnam_cfg, namctl, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
337902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namctl in configuration namelist' )
338      !
339      lwp = (narea == 1) .OR. ln_ctl    ! control of all listing output print
340      !
341      IF(lwp) THEN                      ! open listing units
342         !
343         IF( .NOT. lwm )   &            ! alreay opened for narea == 1
344            &            CALL ctl_opn( numout, 'ocean.output', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, -1, .FALSE., narea )
345         !
346         WRITE(numout,*)
347         WRITE(numout,*) '   CNRS - NERC - Met OFFICE - MERCATOR-ocean - CMCC'
348         WRITE(numout,*) '                       NEMO team'
349         WRITE(numout,*) '            Ocean General Circulation Model'
350         WRITE(numout,*) '                NEMO version 4.0  (2019) '
351         WRITE(numout,*)
352         WRITE(numout,*) "           ._      ._      ._      ._      ._    "
353         WRITE(numout,*) "       _.-._)`\_.-._)`\_.-._)`\_.-._)`\_.-._)`\_ "
354         WRITE(numout,*)
355         WRITE(numout,*) "           o         _,           _,             "
356         WRITE(numout,*) "            o      .' (        .-' /             "
357         WRITE(numout,*) "           o     _/..._'.    .'   /              "
358         WRITE(numout,*) "      (    o .-'`      ` '-./  _.'               "
359         WRITE(numout,*) "       )    ( o)           ;= <_         (       "
360         WRITE(numout,*) "      (      '-.,\\__ __.-;`\   '.        )      "
361         WRITE(numout,*) "       )  )       \) |`\ \)  '.   \      (   (   "
362         WRITE(numout,*) "      (  (           \_/       '-._\      )   )  "
363         WRITE(numout,*) "       )  ) jgs                     `    (   (   "
364         WRITE(numout,*) "     ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ "
365         WRITE(numout,*)
366         !
367         WRITE(numout,cform_aaa)                                        ! Flag AAAAAAA
368         !
369      ENDIF
370      !
371      ! finalize the definition of namctl variables
372      IF( sn_cfctl%l_config ) THEN
373         ! Activate finer control of report outputs
374         ! optionally switch off output from selected areas (note this only
375         ! applies to output which does not involve global communications)
376         IF( ( narea < sn_cfctl%procmin .OR. narea > sn_cfctl%procmax  ) .OR. &
377           & ( MOD( narea - sn_cfctl%procmin, sn_cfctl%procincr ) /= 0 ) )    &
378           &   CALL nemo_set_cfctl( sn_cfctl, .FALSE., .FALSE. )
379      ELSE
380         ! Use ln_ctl to turn on or off all options.
381         CALL nemo_set_cfctl( sn_cfctl, ln_ctl, .TRUE. )
382      ENDIF
383      !
384      IF(lwm) WRITE( numond, namctl )
385      !
386      !                             !------------------------------------!
387      !                             !  Set global domain size parameters !
388      !                             !------------------------------------!
389      !
390      REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namcfg in reference namelist
391      READ  ( numnam_ref, namcfg, IOSTAT = ios, ERR = 903 )
392903   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namcfg in reference namelist' )
393      REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namcfg in confguration namelist
394      READ  ( numnam_cfg, namcfg, IOSTAT = ios, ERR = 904 )
395904   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namcfg in configuration namelist' )   
396      !
397      IF( ln_read_cfg ) THEN            ! Read sizes in domain configuration file
398         CALL domain_cfg ( cn_cfg, nn_cfg, jpiglo, jpjglo, jpkglo, jperio )
399      ELSE                              ! user-defined namelist
400         CALL usr_def_nam( cn_cfg, nn_cfg, jpiglo, jpjglo, jpkglo, jperio )
401      ENDIF
402      !
403      IF(lwm)   WRITE( numond, namcfg )
404      !
405      !                             !-----------------------------------------!
406      !                             ! mpp parameters and domain decomposition !
407      !                             !-----------------------------------------!
408      CALL mpp_init
409
410      ! Now we know the dimensions of the grid and numout has been set: we can allocate arrays
411      CALL nemo_alloc()
412
413      !                             !-------------------------------!
414      !                             !  NEMO general initialization  !
415      !                             !-------------------------------!
416
417      CALL nemo_ctl                          ! Control prints
418      !
419      !                                      ! General initialization
420      IF( ln_timing    )   CALL timing_init     ! timing
421      IF( ln_timing    )   CALL timing_start( 'nemo_init')
422      !
423                           CALL     phy_cst         ! Physical constants
424                           CALL     eos_init        ! Equation of state
425      IF( lk_c1d       )   CALL     c1d_init        ! 1D column configuration
426                           CALL     wad_init        ! Wetting and drying options
427                           CALL     dom_init("OPA") ! Domain
428      IF( ln_crs       )   CALL     crs_init        ! coarsened grid: domain initialization
429      IF( ln_ctl       )   CALL prt_ctl_init        ! Print control
430     
431      CALL diurnal_sst_bulk_init                ! diurnal sst
432      IF( ln_diurnal   )   CALL diurnal_sst_coolskin_init   ! cool skin   
433      !                           
434      IF( ln_diurnal_only ) THEN                   ! diurnal only: a subset of the initialisation routines
435         CALL  istate_init                            ! ocean initial state (Dynamics and tracers)
436         CALL     sbc_init                            ! Forcings : surface module
437         CALL tra_qsr_init                            ! penetrative solar radiation qsr
438         IF( ln_diaobs ) THEN                         ! Observation & model comparison
439            CALL dia_obs_init                            ! Initialize observational data
440            CALL dia_obs( nit000 - 1 )                   ! Observation operator for restart
441         ENDIF     
442         IF( lk_asminc )   CALL asm_inc_init          ! Assimilation increments
443         !
444         RETURN                                       ! end of initialization
445      ENDIF
446     
447                           CALL  istate_init    ! ocean initial state (Dynamics and tracers)
448
449      !                                      ! external forcing
450                           CALL    tide_init    ! tidal harmonics
451                           CALL     sbc_init    ! surface boundary conditions (including sea-ice)
452                           CALL     bdy_init    ! Open boundaries initialisation
453
454      !                                      ! Ocean physics
455                           CALL zdf_phy_init    ! Vertical physics
456                                     
457      !                                         ! Lateral physics
458                           CALL ldf_tra_init      ! Lateral ocean tracer physics
459                           CALL ldf_eiv_init      ! eddy induced velocity param.
460                           CALL ldf_dyn_init      ! Lateral ocean momentum physics
461
462      !                                      ! Active tracers
463      IF( ln_traqsr    )   CALL tra_qsr_init      ! penetrative solar radiation qsr
464                           CALL tra_bbc_init      ! bottom heat flux
465                           CALL tra_bbl_init      ! advective (and/or diffusive) bottom boundary layer scheme
466                           CALL tra_dmp_init      ! internal tracer damping
467                           CALL tra_adv_init      ! horizontal & vertical advection
468                           CALL tra_ldf_init      ! lateral mixing
469
470      !                                      ! Dynamics
471      IF( lk_c1d       )   CALL dyn_dmp_init      ! internal momentum damping
472                           CALL dyn_adv_init      ! advection (vector or flux form)
473                           CALL dyn_vor_init      ! vorticity term including Coriolis
474                           CALL dyn_ldf_init      ! lateral mixing
475                           CALL dyn_hpg_init      ! horizontal gradient of Hydrostatic pressure
476                           CALL dyn_spg_init      ! surface pressure gradient
477
478#if defined key_top
479      !                                      ! Passive tracers
480                           CALL     trc_init
481#endif
482      IF( l_ldfslp     )   CALL ldf_slp_init    ! slope of lateral mixing
483
484      !                                      ! Icebergs
485                           CALL icb_init( rdt, nit000)   ! initialise icebergs instance
486
487      !                                      ! Misc. options
488                           CALL sto_par_init    ! Stochastic parametrization
489      IF( ln_sto_eos   )   CALL sto_pts_init    ! RRandom T/S fluctuations
490     
491      !                                      ! Diagnostics
492                           CALL     flo_init    ! drifting Floats
493      IF( ln_diacfl    )   CALL dia_cfl_init    ! Initialise CFL diagnostics
494                           CALL dia_ptr_init    ! Poleward TRansports initialization
495                           CALL dia_dct_init    ! Sections tranports
496                           CALL dia_hsb_init    ! heat content, salt content and volume budgets
497                           CALL     trd_init    ! Mixed-layer/Vorticity/Integral constraints trends
498                           CALL dia_obs_init    ! Initialize observational data
499                           CALL dia_25h_init    ! 25h mean  outputs
500                           CALL dia_harm_init   ! tidal harmonics outputs
501     IF( ln_diaobs    )    CALL dia_obs( nit000-1 )   ! Observation operator for restart
502
503      !                                      ! Assimilation increments
504      IF( lk_asminc    )   CALL asm_inc_init    ! Initialize assimilation increments
505      !
506      IF(lwp) WRITE(numout,cform_aaa)           ! Flag AAAAAAA
507      !
508      IF( ln_timing    )   CALL timing_stop( 'nemo_init')
509      !
510   END SUBROUTINE nemo_init
511
512
513   SUBROUTINE nemo_ctl
514      !!----------------------------------------------------------------------
515      !!                     ***  ROUTINE nemo_ctl  ***
516      !!
517      !! ** Purpose :   control print setting
518      !!
519      !! ** Method  : - print namctl and namcfg information and check some consistencies
520      !!----------------------------------------------------------------------
521      !
522      IF(lwp) THEN                  ! control print
523         WRITE(numout,*)
524         WRITE(numout,*) 'nemo_ctl: Control prints'
525         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~'
526         WRITE(numout,*) '   Namelist namctl'
527         WRITE(numout,*) '      run control (for debugging)     ln_ctl     = ', ln_ctl
528         WRITE(numout,*) '       finer control over o/p sn_cfctl%l_config  = ', sn_cfctl%l_config
529         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%l_runstat = ', sn_cfctl%l_runstat
530         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%l_trcstat = ', sn_cfctl%l_trcstat
531         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%l_oceout  = ', sn_cfctl%l_oceout
532         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%l_layout  = ', sn_cfctl%l_layout
533         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%l_mppout  = ', sn_cfctl%l_mppout
534         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%l_mpptop  = ', sn_cfctl%l_mpptop
535         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%procmin   = ', sn_cfctl%procmin 
536         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%procmax   = ', sn_cfctl%procmax 
537         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%procincr  = ', sn_cfctl%procincr 
538         WRITE(numout,*) '                              sn_cfctl%ptimincr  = ', sn_cfctl%ptimincr 
539         WRITE(numout,*) '      level of print                  nn_print   = ', nn_print
540         WRITE(numout,*) '      Start i indice for SUM control  nn_ictls   = ', nn_ictls
541         WRITE(numout,*) '      End i indice for SUM control    nn_ictle   = ', nn_ictle
542         WRITE(numout,*) '      Start j indice for SUM control  nn_jctls   = ', nn_jctls
543         WRITE(numout,*) '      End j indice for SUM control    nn_jctle   = ', nn_jctle
544         WRITE(numout,*) '      number of proc. following i     nn_isplt   = ', nn_isplt
545         WRITE(numout,*) '      number of proc. following j     nn_jsplt   = ', nn_jsplt
546         WRITE(numout,*) '      timing by routine               ln_timing  = ', ln_timing
547         WRITE(numout,*) '      CFL diagnostics                 ln_diacfl  = ', ln_diacfl
548      ENDIF
549      !
550      nprint    = nn_print          ! convert DOCTOR namelist names into OLD names
551      nictls    = nn_ictls
552      nictle    = nn_ictle
553      njctls    = nn_jctls
554      njctle    = nn_jctle
555      isplt     = nn_isplt
556      jsplt     = nn_jsplt
557
558      IF(lwp) THEN                  ! control print
559         WRITE(numout,*)
560         WRITE(numout,*) '   Namelist namcfg'
561         WRITE(numout,*) '      read domain configuration file                ln_read_cfg      = ', ln_read_cfg
562         WRITE(numout,*) '         filename to be read                           cn_domcfg     = ', TRIM(cn_domcfg)
563         WRITE(numout,*) '         keep closed seas in the domain (if exist)     ln_closea     = ', ln_closea
564         WRITE(numout,*) '      create a configuration definition file        ln_write_cfg     = ', ln_write_cfg
565         WRITE(numout,*) '         filename to be written                        cn_domcfg_out = ', TRIM(cn_domcfg_out)
566         WRITE(numout,*) '      use file attribute if exists as i/p j-start   ln_use_jattr     = ', ln_use_jattr
567      ENDIF
568      IF( .NOT.ln_read_cfg )   ln_closea = .false.   ! dealing possible only with a domcfg file
569      !
570      !                             ! Parameter control
571      !
572      IF( ln_ctl ) THEN                 ! sub-domain area indices for the control prints
573         IF( lk_mpp .AND. jpnij > 1 ) THEN
574            isplt = jpni   ;   jsplt = jpnj   ;   ijsplt = jpni*jpnj   ! the domain is forced to the real split domain
575         ELSE
576            IF( isplt == 1 .AND. jsplt == 1  ) THEN
577               CALL ctl_warn( ' - isplt & jsplt are equal to 1',   &
578                  &           ' - the print control will be done over the whole domain' )
579            ENDIF
580            ijsplt = isplt * jsplt            ! total number of processors ijsplt
581         ENDIF
582         IF(lwp) WRITE(numout,*)'          - The total number of processors over which the'
583         IF(lwp) WRITE(numout,*)'            print control will be done is ijsplt : ', ijsplt
584         !
585         !                              ! indices used for the SUM control
586         IF( nictls+nictle+njctls+njctle == 0 )   THEN    ! print control done over the default area
587            lsp_area = .FALSE.
588         ELSE                                             ! print control done over a specific  area
589            lsp_area = .TRUE.
590            IF( nictls < 1 .OR. nictls > jpiglo )   THEN
591               CALL ctl_warn( '          - nictls must be 1<=nictls>=jpiglo, it is forced to 1' )
592               nictls = 1
593            ENDIF
594            IF( nictle < 1 .OR. nictle > jpiglo )   THEN
595               CALL ctl_warn( '          - nictle must be 1<=nictle>=jpiglo, it is forced to jpiglo' )
596               nictle = jpiglo
597            ENDIF
598            IF( njctls < 1 .OR. njctls > jpjglo )   THEN
599               CALL ctl_warn( '          - njctls must be 1<=njctls>=jpjglo, it is forced to 1' )
600               njctls = 1
601            ENDIF
602            IF( njctle < 1 .OR. njctle > jpjglo )   THEN
603               CALL ctl_warn( '          - njctle must be 1<=njctle>=jpjglo, it is forced to jpjglo' )
604               njctle = jpjglo
605            ENDIF
606         ENDIF
607      ENDIF
608      !
609      IF( 1._wp /= SIGN(1._wp,-0._wp)  )   CALL ctl_stop( 'nemo_ctl: The intrinsec SIGN function follows f2003 standard.',  &
610         &                                                'Compile with key_nosignedzero enabled:',   &
611         &                                                '--> add -Dkey_nosignedzero to the definition of %CPP in your arch file' )
612      !
613#if defined key_agrif
614      IF( ln_timing )   CALL ctl_stop( 'AGRIF not implemented with ln_timing = true')
615#endif
616      !
617   END SUBROUTINE nemo_ctl
618
619
620   SUBROUTINE nemo_closefile
621      !!----------------------------------------------------------------------
622      !!                     ***  ROUTINE nemo_closefile  ***
623      !!
624      !! ** Purpose :   Close the files
625      !!----------------------------------------------------------------------
626      !
627      IF( lk_mpp )   CALL mppsync
628      !
629      CALL iom_close                                 ! close all input/output files managed by iom_*
630      !
631      IF( numstp          /= -1 )   CLOSE( numstp          )   ! time-step file
632      IF( numrun          /= -1 )   CLOSE( numrun          )   ! run statistics file
633      IF( numnam_ref      /= -1 )   CLOSE( numnam_ref      )   ! oce reference namelist
634      IF( numnam_cfg      /= -1 )   CLOSE( numnam_cfg      )   ! oce configuration namelist
635      IF( lwm.AND.numond  /= -1 )   CLOSE( numond          )   ! oce output namelist
636      IF( numnam_ice_ref  /= -1 )   CLOSE( numnam_ice_ref  )   ! ice reference namelist
637      IF( numnam_ice_cfg  /= -1 )   CLOSE( numnam_ice_cfg  )   ! ice configuration namelist
638      IF( lwm.AND.numoni  /= -1 )   CLOSE( numoni          )   ! ice output namelist
639      IF( numevo_ice      /= -1 )   CLOSE( numevo_ice      )   ! ice variables (temp. evolution)
640      IF( numout          /=  6 )   CLOSE( numout          )   ! standard model output file
641      IF( numdct_vol      /= -1 )   CLOSE( numdct_vol      )   ! volume transports
642      IF( numdct_heat     /= -1 )   CLOSE( numdct_heat     )   ! heat transports
643      IF( numdct_salt     /= -1 )   CLOSE( numdct_salt     )   ! salt transports
644      !
645      numout = 6                                     ! redefine numout in case it is used after this point...
646      !
647   END SUBROUTINE nemo_closefile
648
649
650   SUBROUTINE nemo_alloc
651      !!----------------------------------------------------------------------
652      !!                     ***  ROUTINE nemo_alloc  ***
653      !!
654      !! ** Purpose :   Allocate all the dynamic arrays of the OPA modules
655      !!
656      !! ** Method  :
657      !!----------------------------------------------------------------------
658      USE diawri    , ONLY : dia_wri_alloc
659      USE dom_oce   , ONLY : dom_oce_alloc
660      USE trc_oce   , ONLY : trc_oce_alloc
661      USE bdy_oce   , ONLY : bdy_oce_alloc
662      !
663      INTEGER :: ierr
664      !!----------------------------------------------------------------------
665      !
666      ierr =        oce_alloc    ()    ! ocean
667      ierr = ierr + dia_wri_alloc()
668      ierr = ierr + dom_oce_alloc()    ! ocean domain
669      ierr = ierr + zdf_oce_alloc()    ! ocean vertical physics
670      ierr = ierr + trc_oce_alloc()    ! shared TRC / TRA arrays
671      ierr = ierr + bdy_oce_alloc()    ! bdy masks (incl. initialization)
672      !
673      CALL mpp_sum( 'nemogcm', ierr )
674      IF( ierr /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'nemo_alloc: unable to allocate standard ocean arrays' )
675      !
676   END SUBROUTINE nemo_alloc
677
678   
679   SUBROUTINE nemo_set_cfctl(sn_cfctl, setto, for_all )
680      !!----------------------------------------------------------------------
681      !!                     ***  ROUTINE nemo_set_cfctl  ***
682      !!
683      !! ** Purpose :   Set elements of the output control structure to setto.
684      !!                for_all should be .false. unless all areas are to be
685      !!                treated identically.
686      !!
687      !! ** Method  :   Note this routine can be used to switch on/off some
688      !!                types of output for selected areas but any output types
689      !!                that involve global communications (e.g. mpp_max, glob_sum)
690      !!                should be protected from selective switching by the
691      !!                for_all argument
692      !!----------------------------------------------------------------------
693      LOGICAL :: setto, for_all
694      TYPE(sn_ctl) :: sn_cfctl
695      !!----------------------------------------------------------------------
696      IF( for_all ) THEN
697         sn_cfctl%l_runstat = setto
698         sn_cfctl%l_trcstat = setto
699      ENDIF
700      sn_cfctl%l_oceout  = setto
701      sn_cfctl%l_layout  = setto
702      sn_cfctl%l_mppout  = setto
703      sn_cfctl%l_mpptop  = setto
704   END SUBROUTINE nemo_set_cfctl
705
706   !!======================================================================
707END MODULE nemogcm
708
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.